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Das Flaggschiff ist ein Raumschiff einer Flotte oder auch eines Geschwaders, auf dem sich die kommandierenden Offiziere befinden. Flaggoffiziere haben oft eigene Flaggschiffe.
==bekannte Flaggschiffe einzelner Kampfverbände oder Flotten==
===Föderation===
*[[USS Lexington]], [[Constitution-Klasse]] in [[Computer M5]]
*[[USS Enterprise (NCC-1701-E)]] in der Schlacht um Sektor 001
*USS Venture als Flaggschiff der 2. Flotte
===Klingonen===
*Die [[IKS Rotarran]] als Flaggschiff der 9. Flotte im Dominionkrieg
===Romulaner===
===Dominion===
*Der [[Jem'Hadar-Schlachtkreuzer]] in der [[Dritten Schlacht um DS9]] von [[Dukat]] und [[Weyoun]]