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Nach diesem Erfolg befehligt Dukat die gesamte Flotte des Dominion von Deep Space 9 aus, das jetzt wieder Terok Nor heißt. Auch wenn die Deaktivierung des Minenfeldes zunächst nicht gelingt, schafft es Dukat mit den verfügbaren Truppen den Gegner an den Rand der Niederlage zu bringen. Als Dukats Stellvertreter [[Damar]] eine Methode entwickelt, das Wurmloch wieder zu öffnen, scheint der endgültige Sieg greifbar. ({{DS9|Ein kühner Plan}})
Sisko erfährt jedoch von diesem Plan und führt die [[Zweite Flotte|Zweite]] und [[Fünfte Flotte]] nach Deep Space 9. Dukat entsendet eine Streitmacht, um sie aufzuhalten, doch durch einen überraschenden Flankenangriff der Klingonen gelingt es zunächst der [[USS Defiant (NX-74205)|USS ''Defiant'']] die Linie des Dominion zu durchbrechen. Als die ''Defiant'' Deep Space 9 erreicht, wird das Minenfeld gerade deaktiviert. Sisko kann jedoch die Flotte des Dominion im Wurmloch mithilfe der [[Propheten]] vernichten. Da die [[Waffensystem]]e von Terok Nor von bajoranischen Rebellen unter Führung von Kira Nerys [[Sabotage|sabotiert]] worden sind, kann sich die Station nicht gegen die ''Defiant'' verteidigen und wird evakuiert. Als Dukat seine Tochter Ziyal holen will, [[Geständnis|gesteht]] sie ihm, Kira geholfen zu haben. Damar, der die Szene beobachtet, erschießt daraufhin Ziyal als Verräterin. Dukat kann das nicht akzeptieren, liebt er doch seine Tochter und ist bereit gewesen, ihr zu verzeihen. Er widersetzt sich der Evakuierung und wird von den eintreffenden Koalitionstruppen unter [[Arrest]] gestellt. ({{DS9|Sieg oder Niederlage?}})
==Wahnsinn==
Offiziell verehrt er seine cardassianische [[Familie]], die aus seiner Frau und sieben Kindern besteht, darunter sein Sohn [[Mekor]]. Jedoch unterhält er zahlreiche [[Affäre|uneheliche Beziehungen]], so unter anderem zu [[Kira Meru]]. Später entwickelt er auch ein Verlangen für deren Tochter, [[Kira Nerys]], die dieses jedoch entschieden ablehnt. ({{DS9|Tiefes Unrecht}}, et al.)
Kurz vor Ende der Besatzung führt Dukat eine [[Beziehung]] mit [[Tora Naprem]], aus der seine Tochter [[Tora Ziyal]] hervorgeht. Wissend, dass deren Existenz seine Karriere gefährden wird, schickt er beide nach [[Lissepia]], doch ihr Schiff wird von den [[Breen]] angegriffen. Ziyal überlebt und wird [[Sklaverei|versklavt]], bis sie von Dukat und Kira Nerys gerettet wird. Seine Liebe zu Ziyal ist aber zu groß, um sie zu töten. Er akzeptiert sie als Tochter und wird daraufhin von seiner Familie und der cardassianischen Gesellschaft geächtet. ({{DS9|Indiskretion|Zu neuer Würde}}) Den späteren Tod Ziyals kann Dukat nicht verkraften und wird wahnsinnig. ({{DS9|Sieg oder Niederlage?}})
Als er 2375 die [[Sekte]] der Pah-Geister auf Empok Nor anführt, zeugt er ein weiteres Kind mit der Bajoranerin [[Mika]]. ({{DS9|Entscheidung auf Empok Nor}})
In den ersten Jahren nach Ende der Besatzung ist er bestrebt, die Sicht Bajors und vor allem die von Kira Nerys auf ihn zu korrigieren. Möglich ist auch, dass er deswegen seine halb-bajoranische Tochter Tora Ziyal überhaupt anerkennt. ({{DS9|Indiskretion}})
Als die Cardassianer [[Schlacht von Deep Space 9 (2373)|2373 ins bajoranische System zurückkehren]], will Dukat den Planeten erneut besetzen, jedoch hindert ihn der [[Nichtangriffspakt]] zwischen Bajor und dem Dominion. In den folgenden Wochen bemüht sich Dukat um ein neues Bild in der [[Bajoranische Geschichte|bajoranischen Geschichte]], dennoch begrüßen die Bajoraner die zurückkehrende [[Föderation]] später als Befreier. ({{DS9|Zu den Waffen!|Sieg oder Niederlage?}})
Den Wendepunkt in der Beziehung Dukats zu Bajor stellt seine Zeit mit Benjamin Sisko dar, nachdem dieser mit ihm gestrandet ist. Dukat, inzwischen von Halluzinationen geplagt, erkennt seinen unbändigen Hass auf die Bajoraner, die sich weigern, seine Größe anzuerkennen. Er beschließt Bajor und sein Volk zu vernichten. Dazu verschreibt er sich dem Kult der [[Pah-Geister]] und schafft es kurzzeitig, die Bajoranern von den [[Propheten]] zu trennen. Als er später versucht, die Pah-Geister mithilfe Winn Adamis freizulassen, wird er in den [[Feuerhöhlen]] gefangen. ({{DS9|Das Gute und das Böse|Tränen der Propheten|Das, was du zurückläßt, Teil II}})
**{{e|Hinter der Linie}}
**{{e|Ein kühner Plan}}
**{{e|Sieg oder Niederlage?}}
**{{e|Das Gute und das Böse}}
**{{e|Jenseits der Sterne}} (nur als ''Vision'')
