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Doch die Cardassianer haben die Besetzung durch das Dominion satt. Nach dem scheinbaren Tod von Damar entstehen in der Bevölkerung Legenden über den Helden Damar. Mila berichtet den Niedergenschlagenden dem niedergeschlagenen Damar von dem Zuspruch der Bevölkerung. Der Führer der Rebellion plant daraufhin mit Hilfe von Kira und Garak einen Anschlag auf eine [[Jem'Hadar-Kaserne]]. Beim legen Legen einer Bombe, wird Garak jedoch von den Jem'Hadar erwischt. Plötzlich taucht wie aus dem Nichts Damar auf und fordert die Freilassung von Garak. Doch die Soldaten des Dominion denken niht nicht daran, Garak frei zu lassen, sondern wollen Damar stattdessen töten. Bevor die Jem'Hadar ihr Werk jedoch vollenden können , kommt Kira zur Hilfe und tötet stattdessen die Jem'Hadar. Durch die anschließende Explosion der Bombe wird die Kaserne zerstört. Als die Cardassianer sehen, dass Damar noch lebt , fassen diese neuen Mut. Damar fordert die Bevölkerung auf an seiner Seite gegen das Dominion zu kämpfen und das Volk erwidert seine Freiheitsrufe.

Durch die gestohlene Energiedämpfungswaffe findet die Sternenflotte eine Möglichkeit diese Waffe abzuwehren und die Sternenflotte teilt ihr Wissen auch mit den Romulanern. Als die Gründerin dies erfährt , zieht diese alle Truppen des Dominions, der Cardassianer und der Breen in den cardassianischen Raum zurück. Die Gründerin will damit ihre Truppen auf ein kleineres Gebiet konzentrieren, um es den Feind schwerer zu machen sie anzugreifen. Die Gründerin spekuliert, dass die Föderation und ihre Verbündeten das Dominion nicht angreifen werden. Darauf befiehlt die Gründerin die Produktion der Schiffswerften und der Jem'Hadar zu erhöhen, um dann mit einer stärkeren Armee die Föderationsallianz anzugreifen.

Auch die Föderation bekommt den Rückzug des Dominions in den cardassianischen Raum mit. Die Romulaner wollen das Dominion im cardassianischen Raum einkesseln und dort gefangen halten. Doch Captain Sisko ist gegen diese Strategie, da er befürchtet, dass das Dominion die Produktion ihrer Schiffe und der Jem'Hadar erhöht und dann wieder angreifenangreift. Sisko schlägt schließlich vor , das Dominion sofort anzugreifen und die Klingonen stimmen dem zu. Nachdem auch die Romulaner zugestimmt haben , wird die [[Schlacht um Cardassia|Invasion auf Cardassia]] geplant. ({{DS9|In den Wirren des Krieges}})

Auf Cardassia Prime planen Damar, Kira und Garak zusammen mit der cardassianischen Bevölkerung den Aufstand. Es werden [[Streik]]s veranstaltet und auch die Energie und die Kommunikation auf dem Planet wird lahm gelegt. Durch diese Aktion verliert die Gründerin den Kontakt zu der Flotte, welche sich der Föderationsallianz entgegenstellen soll. Legat Broca berichtet der Gründerin, dass die cardassianische Bevölkerung auf dem ganzen Planeten Sabotageakte gegen das Dominion durchführt durchgeführt hat. Weyoun empfiehlt darauf das cardassianische Volk für diese Sabotage zu bestrafen und er lässt von den Jem'Hadar die cardassianische Stadt [[Lakarian City]] auslöschen und dabei . Dabei werden 2 Millionen Männer, Frauen und Kinder getötet. Als Damar die Botschaft von Weyoun sieht , beschließt er zusammen mit Kira und Garak das Hauptquartier des Dominions anzugreifen, um sich an Weyoun zu rächen. Doch dem Dominion gelingt es das Versteck von Damar ausfindig zu machen und ihn zusammen mit Kira und Garak zu verhaften.

Währenddessen trifft die Flotte der Föderationsallianz auf die Flotten des Dominions, der Breen und der Cardassianer. Es kommt zu schweren Gefechten und obwohl die Dominiontruppen keinen Kontakt nach Cardassia Prime haben, sind diese der Föderationsallianz überlegen. Bei den Gefechten werden immer mehr Schiffe der Föderationsallianz vernichtet und zu . Zu den Opfern gehört auch das Flaggschiff der Romulaner.

Die Schlacht verläuft immer schlechter für die Föderationsallianz diese . Diese haben bereit ein drittel Drittel ihrer Flotte verloren. Captain Sisko befiehlt sogar mit der neuen ''Defiant'' den Rückzug, da für ihn der Kampf aussichtslos erscheint. Doch plötzlich beginnen die cardassianischen Schiffe die Flotten des Dominions und der Breen anzugreifen. Zu der Zeit gelingt es der Gründerin auf Cardassia Prime wieder Kontakt mit ihren Truppen an der Front herzustellen. Mit Entsetzen muss sie mit ansehen, dass die Cardassianer endgültig das Dominion verraten haben. Die Gründerin befiehlt den Rückzug ihrer Flotten in den Orbit von Cardassia Prime, obwohl sie weiß, dass sie nun von der Föderationsallianz umzingelt sind. Für den Verrat befiehlt die Gründerin Weyoun, die gesamte cardassianische Bevölkerung zu töten. Das erste Opfer ist Legat Broca, obwohl er dem Dominion loyal gegenübersteht.

Die Flotte der Föderation, der Klingonen, der Romulaner und der Cardassianer erreichen, erreicht den Orbit von Cardassia Prime und stehen steht einer weiteren großen Flotte des Dominions und der Breen gegenüber. Die Föderation will die Orbitalen orbitalen Geschütze angreifen, die Klingonen kümmern sich um die Schiffe der Breen und die Romulaner bekämpfen gemeinsam mit den Cardassianern die Schiffe der Jem'Hadar. Doch Admiral Ross schätzt bei diesen Kämpfen sehr hohe Verluste der Flotte.

Inzwischen gelingt es Damar mit seinen Truppen in das Hauptquartier des Dominions einzudringen, doch bei den Gefechten mit den Jem'Hadar kommt Damar ums Leben. Kira, Garak und Ekoor gelingt es die wenigen Jem'Hadar im Gebäude zu töten, da die meisten zur Auslöschung der cardassianischen Bevölkerung abkommandiert worden sind. Den drei gelingt es Weyoun und die im sterben Sterben liegende Gründerin gefangen zu nehmen. Nachdem Weyoun eine abfällige Bemerkung über Damar und Cardassia von sich gegeben hat, tötet Garak den letzten Klon von Weyoun. Obwohl sie weiß, dass sie verloren hat, will die Gründerin nicht kapitulieren. Sie will jeden Jem'Hadar und Breen bis aufs letzte kämpfen lassen, damit die Föderationsallianz trotz des Sieges die hohen Verluste an Leben beklagen muss. Nachdem Kira Kontakt mit der sich im Orbit befindenden ''Defiant'' aufgenommen hat, beamt sich Odo auf die Planetenoberfläche. Odo verbindet sich mit der Gründerin und heilt sie von ihrer Krankheit. Darauf kann Odo sie davon Überzeugenüberzeugen, den Krieg zu beenden. ({{DS9|Das, was du zurückläßt, Teil I|Das, was du zurückläßt, Teil II}})