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… Kurze Zeit später zeigen einige Crewmitglieder seltsame Krankheitssymptome. Janeway leidet unter schweren [[Kopfschmerz]]en. Anfangs vermutet der Doktor, dass diese Kopfschmerzen durch viel Stress ausgelöst worden sind. Doch plötzlich beginnen Chakotay und Neelix an genetischen Mutationen zu leiden und der Doktor versucht herauszufinden, woher diese Mutationen stammen. Der Doktor findet bei seinen Untersuchungen heraus, dass die DNS von Neelix und Chakotay manipuliert worden ist. Plötzlich wird das Programm des Doktors aus dem Computer gelöscht, doch dem Doktor gelingt es im letzten Moment aufs Holodeck zu transferieren. Er versteckt sich darauf in einem Holoprogramm, als es an Bord zu immer mehr Mutationen kommt. Der Doktor nimmt heimlich Kontakt zu Seven of Nine auf, berichtet ihr von der Manipulation der DNS und erklärt ihr einen Weg diejenigen, die dafür verantwortlich sind, aufzuspüren. Seven of Nine findet heraus, dass sich Fremde an Bord befinden und Experimente mit der Crew durchführen. Ihr gelingt es eine dieser Fremde zu enttarnen. Die [[Srivani]] erklären ihre Experimente fortzuführen oder ansonsten die gesamte Crew zu töten. Um die ''Voyager'' zu retten, fliegt Janeway die ''Voyager'' durch einen [[Pulsar|binären Pulsar]]. Da die Srivani glauben, die ''Voyager'' werde durch den Pulsar vernichtet, fliehen sie von Bord. Nachdem die Srivani verschwunden sind, kann der Doktor die genetischen Mutationen stoppen. ({{VOY|Verwerfliche Experimente}})
Kurze Zeit später zeigen einige Crewmitglieder seltsame Krankheitssymptome. Janeway leidet unter schweren [[Kopfschmerz]]en und anfangs vermutet der Doktor, dass diese durch viel Stress ausgelöst worden sind. Doch plötzlich beginnen Chakotay und Neelix an genetische Mutationen zu leiden und der Doktor versucht heraus zu finden woher diese Mutationen stammen. Der Doktor findet bei seinen Untersuchungen heraus, dass die DNS Datei:Wiederbelebung von Neelix und Chakotay manipuliert worden ist. Plötzlich wird das Programm des Doktors aus dem Computer gelöscht, doch dem Doktor gelingt es im letzten Moment aufs Holodeck zu transferieren. Der Doktor versteckt sich darauf in einem Holoprogramm, als es an Bord zu immer mehr Mutationen kommt. Der Doktor nimmt heimlich Kontakt zu jpg|thumb|Seven of Nine auf und berichtet ihr von der Manipulation der DNS und erklärt ihr einen Weg diejenigen welche dafür verantwortlich sind aufzuspüren. Seven of Nine findet heraus, dass sich Fremde an Bord befinden und Experimente mit der Crew durchführen und ihr gelingt es eine dieser Fremde zu enttarnen. Die [[Srivani]] erklären ihre Experimente fortzuführen oder sie töten ansonsten die gesamte CrewDoktor versuchen Neelix wiederzubeleben. Um die ''Voyager'' zu retten, durchfliegt Janeway die ''Voyager'' durch einen [[Pulsar|binären Pulsar]]. Da die Srivani glauben, die ''Voyager'' wird durch den Pulsar vernichtet, fliehen diese von Bord. Nachdem die Srivani verschwunden sind, kann der Doktor die genetischen Mutationen stoppen. ({{VOY|Verwerfliche Experimente}})
[[Datei:Wiederbelebung von Neelix.jpg|thumb|Seven of Nine und Nachdem Torres bei den Mari einige gewalttätige Gedanken entfernt worden sind, untersucht der Doktor versuchen Neelix wieder zu belebensie, ob sie unter Folgeschäden leidet.]]({{VOY|Gewalttätige Gedanken}})
Nachdem Torres bei Wenige Wochen später wird die ''Voyager'' angegriffen und die Fremden stehlen wichtige Technik von Bord der ''Voyager''. Unter den Mari einige gewalttätige Gedanken entfernt worden sindgestohlen Objekten befindet sich auch der mobile Emitter des Doktors und er sitzt nun wieder auf der Krankenstation fest. Während ein Außenteam auf einem Planeten nach der gestohlenen Technologie sucht, untersucht sie langweilt sich der Doktor auf der Krankenstation. Als Seven of Nine den Doktorbesucht, ob sie unter Folgeschäden leidetwill er alles wissen, was auf dem Schiff geschieht. Später gelingt es dem Außenteam die Objekte wiederzubeschaffen und der Doktor bekommt seinen Emitter zurück. ({{VOY|Gewalttätige GedankenApropos Fliegen}})
Wenige Wochen später wird die ''Voyager'' angegriffen und die Fremden stehlen wichtige Technik von Bord der ''Voyager''. Unter den gestohlen Objekten befindet sich auch der mobile Emitter des Doktors und dieser sitzt nun wieder auf der Krankenstation fest. Während ein Außenteam auf einem Planeten nach der gestohlen Technologie sucht, langweilt sich der Doktor auf der Krankenstation. Als Seven of Nine den Doktor besucht, will der Doktor alles wissen was was auf dem Schiff geschieht. Später gelingt es dem Außenteam die Objekte wieder zu beschaffen und der Doktor bekommt seinen Emitter zurück. ({{VOY|Apropos Fliegen}}) Nachdem Neelix durch einen Unfall gestorben ist, kann der Doktor nichts mehr für ihn tun. Doch mit Hilfe von Seven of Nines Nanosonden kann der Doktor Neelix wieder erwecken, obwohl dieser Neelix bereits über 18 Stunden tot gewesen ist. ({{VOY|Leben nach dem Tod}})
Rechtschreibkorrektur
Einige Zeit später empfiehlt der Doktor, dass Seven of Nine ihre erste richtige Nahrung zu sich nehmen darf. Doch bei ihrer ersten Nahrungsaufnahme hat sie seltsame Erinnerungen an die Borg und plötzlich aktivieren sich einige Borg-Implantate in ihr und Seven of Nine verliert die Kontrolle über sich. Seven of Nine flieht mit einem Shuttle von der ''Voyager''. Der Doktor entwickelt ein Mittel, die die Produktion ihrer Nanosonden stoppt, um sie so aufhalten zu können. Es stellt sich heraus, dass ein Borgsignal, das von Seven of Nines ehemaligen Schiff, der [[USS Raven|USS ''Raven'']], stammt. Nachdem es gelungen ist dieses Signal zu deaktivieren, kehrt Seven of Nine auf die ''Voyager'' zurück. Der Doktor deaktiviert darauf ein Implantat in Seven of Nines Körper, damit sie nicht mehr solche Signale empfangen kann. ({{VOY|Der schwarze Vogel}})
[[Datei:Chakotay und der Doktor versuchen die Voyager zu retten.jpg|thumb|left|Chakotay und der Doktor versuchen die ''Voyager'' zu retten.]]
Kurz darauf hat die gesamte Crew seltsame [[Albtraum|AlbträumeAlpträume]] und einige Crewmitglieder wachen gar nicht mehr auf. Der Doktor untersucht diese Crewmitglieder, kann jedoch nichts für diese sie tun. Da jeder eine [[Traumspezies|fremde Spezies]] gesehen hat, versucht Chakotay mit dieser Spezies in einem Traum Kontakt aufzunehmen. Da Chakotay seine Träume kontrollieren kann, willigt Janeway in diesen Plan zu ein und der Doktor überwacht Chakotays Schlaf. Die Fremden erklären Chakotay im Traum einen Kurs , wie die ''Voyager'', das Gebiet der Fremden verlassen kann. Chakotay wacht auf und , die ''Voyager'' verlässt das Gebiet der Fremden und alle wachen wieder auf. Plötzlich greifen jedoch die Fremden die ''Voyager'' an und übernehmen die ''Voyager''das Schiff. Plötzlich erkennt Chakotay, dass er noch immer träumt , und ihn es gelingt es ihm sich wieder zu wecken. Der Doktor berichtet, dass nun die gesamte Crew schläft und alle im selben Traum gefangen sind. Chakotay und der Doktor versuchen nun die Fremden in der realen Welt zu finden, um so die Crew aus der Traumwelt zu befreien. Doch auch Chakotay schläft regelmäßig ein und , auch wenn der Doktor immer weiter versucht Chakotay ihn wach zu halten. Als die ''Voyager'' den Planeten erreicht, beamt dieser Chakotay auf die Oberfläche und findet die schlafenden Fremden. Chakotay befiehlt den Doktor im Notfall einen Torpedo auf die Oberfläche zu feuern. Als Chakotay er einschläft und wieder in die Traumwelt gelangt, warnt er die Fremden, dass der Doktor einen Torpedo auf sie feuern wird. Darauf geben die Fremden die Besatzung wieder frei und diese sie wacht wieder auf. ({{VOY|Wache Momente}})
[[Datei:Der Doktor und das MHN II.jpg|thumb|Der Doktor und das MHN Modell II in Not.]]
Mit Hilfe eines [[Hirogen-Kommunikationsnetzwerk|Kommunikationsnetzwerkes]] einer unbekannten Spezies entdeckt Seven of Nine ein Föderationsraumschiff. Mit dem Netzwerk versucht die ''Voyager'' Kontakt zum dem Schiff, welche das sich an der Grenze zum Alpha-Quadrant Quadranten befindet, aufzunehmen. Aber das Signal ist zu schwach und kommt zu den zum Schiff nicht durch. Captain Janeway beschließt ein stärkeres Signal durch das Netzwerk zu transferieren. Janeway schickt darauf den Doktor durch das Netzwerk in den Alpha-QuadrantQuadranten. Der Doktor transferiert sich auf die [[USS Prometheus (Prometheus-Klasse)|USS ''Prometheus'']] und aktiviert sich darauf dort auf der Krankenstation. Doch der Doktor findet nur tote Crewmitglieder vor. Der Doktor Er erfährt schließlich, dass die Romulaner das Schiff übernommen haben. Der Doktor aktiviert darauf das MHN der ''Prometheus''. Dieses MHN gehört zum MHN-Modell II und der Doktor versucht mit dem MHN II die ''Prometheus'' zurück zu erobernzurückzuerobern. Doch die beiden geraten häufig in Streitereien, da das MHN II den Doktor für ein primitives Programm hält. Doch der Doktor berichtet von seinen Erfahrungen und Erlebnissen und das dass er sogar schon [[Sex]] gehabt hat. Das MHN II hält das jedoch nicht für möglich, doch der Doktor erklärt, dass er seinem Programm eine Kleinigkeit hinzugefügt hat, um Sex haben zu können. Beide versuchen mit [[Neurozin-Gas]] die Romulaner zu betäuben, doch dabei wird der Doktor gefangen genommen. Doch dem MHN II gelingt es das Gas zu verteilen und damit die Romulaner zu betäuben. Beide begeben sich darauf danach auf die Brücke und versuchen die Kontrolle über die Steuerung zu übernehmen. Plötzlich melden die Sensoren, dass sich drei [[Warbird]]s der [[D'deridex-Klasse]] der ''Prometheus'' nähert. Den beiden gelingt es nicht den Warbirds zu entkommen, als sich plötzlich auch weitere Schiffe der Sternenflotte nähern. Bei dem Kampf gelingt es den beiden Hologrammen schließlich einen der Warbirds zu vernichten und die anderen Warbirds ziehen sich zurück. Darauf beamt ein Trupp der Sternenflotte auf die ''Prometheus''. Der Doktor berichtet der Sternenflotte, dass die ''Voyager'' im Delta-Quadranten verschollen ist , und er berichtet über die Erlebnisse der Crew. Die Sternenflotte tut nun alles, um die verschollene ''Voyager'' nach Hause zu holen. Danach wird der Doktor durch das Netzwerk zurück auf die ''Voyager'' zurück transferiert. ({{VOY|Flaschenpost}})
[[Datei:Der Doktor untersucht einen Hirogen.jpg|thumb|left|Der Doktor untersucht einen Hirogen.]]
In den nächsten Wochen erhält die ''Voyager'' Botschaften der Sternenflotte über das Kommunikationsnetzwerk. Seven of Nine versucht die Botschaften zu bearbeiten und überarbeitet sich dabei. Der Doktor empfiehlt ihr sich etwas zu entspannen, doch denn er bemerkt, dass sie überarbeitet ist. Später taucht ein Fremdes fremdes Schiff auf und der Doktor untersucht einen Leichnam, welcher der dort geborgen worden ist. Es stellt sich heraus, dass das diejenigendenen, welche die den Fremden getötet haben , auch das Kommunikationsnetzwerk gehört. Diese Spezies nennt sich [[Hirogen]] und bei . Bei einem Kampf mit diesen ihnen wird das Netzwerk zerstört und der Kontakt zu Sternenflotte bricht wieder ab. ({{VOY|Jäger}})
Als ein verletzter Hiroge Hirogen auf seinem Schiff von einem Außenteam der ''Voyager'' geborgen wird, wird dieser er sofort auf die Krankenstation der ''Voyager'' gebracht. Der Doktor behandelt den verletztenVerletzten, aber er warnt ihnaber, dass er ein Hologramm ist und nicht von den Hirogen angegriffen werden kann. Der Hiroge hat zu der Zeit ein Mitglied von Spezies 8472 gejagt, welches das sich nun ebenfalls an Bord der ''Voyager'' befindet. Der Doktor untersucht später das verletzte Mitglied von Spezies 8472, kann allerdings nicht viel für dieses es tun. Als weitere Hirogen auftauchen, beamt Seven of Nine den Hirogen und das Mitglied von Spezies 8472 zu den anderen Hirogen. Zu der Zeit beginnt der Doktor mit Seven of Nine ein soziales Training, damit sie sich besser in die Crew intrigieren integrieren kann. Seven of Nine gefallen die Übungen zu beginn Beginn überhaupt nicht, aber sie übt weiterhin mit dem Doktor. ({{VOY|Die Beute}})
[[Datei:Der Doktor versucht Seven zu helfen.jpg|thumb|Der Doktor versucht Seven of Nine zu helfen.]]
Nachdem Seven of Nine den Händler [[Kovin]] verletzt hat, behandelt der Doktor diesenihn. Später unterhält sich der Doktor mit Seven of Nine über ihr Verhalten, als diese sie beginnt sich beginnt seltsam und ängstlich zu verhalten. Der Doktor versucht mit einer Therapie die Erinnerungen von Seven of Nine zu erforschen, um heraus zu finden herauszufinden warum sie sich diese so ängstlich verhält. Bei diesen Erinnerungen erfährt der Doktor, dass Seven of Nine von Kovin entführt worden ist und ihr von ihm Borg-Technologie entwendet wurde. Der Doktor berichtet Captain Janeway von Seven of Nines Erinnerungen im Bezug auf Kovin. Janeway beginnt basierend auf Seven of Nines Erinnerungen gegen Kovin zu ermitteln. Doch Kovin beteuert seine Unschuld, doch als . Als jedoch die Indizien gegen ihn sprechen, flieht Kovin. Bei späteren Ermittlungen stellt sich jedoch dann aber heraus, dass Kovin die Wahrheit gesagt hat und das dass die Erinnerungen von Seven of Nine fehlerhaft sind. Als man dies Kovin mitteilen will, glaubt dieser er der ''Voyager'' -Crew nicht. Mit seinem Schiff greift Kovin die ''Voyager'' an, doch dabei überladen sich die Waffen von Kovins Schiff seines Schiffs und dieses es explodiert. Der Doktor macht sich darauf schwere Vorwürfe, da er mit für den Tod von Kovin verantwortlich ist. Er bittet sogar Captain Janeway ihn auf seine ursprüngliche Programmierung zurück zu setztenzurückzusetzen, damit so etwas niemals wieder geschieht, doch Janeway verweigert dem Doktor seine Bitte, da dieser so er nur aus seinen Fehlern lernen kann. ({{VOY|Im Rückblick}})
[[Datei:Der Doktor muss mit den Hirogen arbeiten.jpg|thumb|left|Der Doktor muss für die Hirogen arbeiten.]]
Kurze Zeit später wird die ''Voyager'' von den Hirogen angegriffen und auch von diesen ihnen erobert. Die Hirogen führen darauf Simulationen mit der Crew auf dem Holodeck durch. Die Crew glaubt Teil der Simulation zu sein, während die Hirogen ihre Opfer auf dem Holodeck jagen. In den nächsten drei Wochen muss der Doktor die verletzte Crew behandeln, bevor diese damit sie wieder aufs Holodeck gebracht werdenkönnen. Als Seven of Nine verletzt wird, behandelt der Doktor diese sie und es gelingt ihm sie so zu programmieren, dass sie sich wieder an alles Erinnern erinnern kann. Währenddessen versucht Harry Kim, welcher der für die Hiorgen Hirogen auf der Brücke arbeitet , die Neuralen Interphases neuralen Interphasen zu deaktivieren, damit sich die Crew wieder an alles erinnert. Seven of Nine kehrt mit ihren Erinnerungen aufs Holodeck zurück und dem Doktor und Harry Kim gelingt es auch Janeways Interphase zu deaktivieren , damit sie sich an alles erinnern kann. Auf dem Holodeck , in der eine Simulation des [[Zweiter Weltkrieg|zweiten Weltkrieges]] läuft bricht währenddessen ein Kampf aus, in dem die Crew gegen die [[Nazi]]s kämpfenkämpft. ({{VOY|Das Tötungsspiel, Teil I}})
Da die Hiorgen Hirogen überall an Bord der Holoemitter installiert haben , weiten sich die Kämpfe vom Holodeck über das gesamte Schiff aus. Der Doktor bekommt es mit immer mehr Verletzten zu tun. Doch die Hirogen schalten den Doktor ab, da sie nun wollen, dass ihre Beute verletzt zurück bleibt. Doch Janeway transferiert den Doktor auf das Holodeck und aktiviert diesen ihn wieder. Der Doktor ist nun in einer Klingonensimulation zusammen mit Neelix, welcher der glaubt ein klingonischer Krieger zu sein. Zur selben Zeit gelingt es Janeway vollständig die Interphases Interphasen zu deaktivieren und nun erinnert sich jedes Crewmitglied wieder an alles. Janeway versucht mit ihrer Crew und einigen Hologrammen die ''Voyager'' von den Hirogen zurück zu erobernzurückzuerobern. Der Doktor und Neelix müssen sich währenddessen mit den Klingonen beschäftigen, welche die wieder in den Kampf ziehen wollen. Janeway gelingt es zur selben Zeit einen Waffenstillstand mit dem Kommandanten der Hirogen auszuhandeln und die Kämpfe werden vorerst abgebrochen. Doch einige Hirogen wollen weiter kämpfen und sie töten sogar ihren Kommandanten. Danach brechen die Kämpfe wieder aus. Es kommt aus dem ganzen Schiff zu kämpfen Kämpfen mit der Crew, welche die gegen Hirogen und holographische holografische Nazis kämpfen. Doch Neelix und der Doktor greifen mit den holographischen holografischen Klingonen die Nazis und die Hirogen an und diese die Hirogen werden von den Klingonen besiegt. Kim gelingt es inzwischen das Hologitter an Bord des Schiffes zu überladen und die Hologramme werden deaktiviert. Nach den Kämpfen gelingt es Janeway wieder einen Waffenstillstand auszuhandeln und sie übergibt den Hirogen die Holotechnologie. Danach verlassen die Hirogen die ''Voyager''. ({{VOY|Das Tötungsspiel, Teil II}})
[[Datei:Neelix und der Doktor bei den Klingonen.jpg|thumb|Neelix und der Doktor bei den Klingonen.]]
Da sich Tom Paris immer seltener in der Krankenstation meldet, begibt sich der Doktor aufs Holodeck und bittet Paris ihn bei seiner Arbeit auf der Krankenstation zu unterstützen. Als Paris wieder nicht zu seiner Schicht erscheint, meldet der Doktor dies Chakotay. Später taucht ein Fremder auf, welcher [[Steth]] heißt. Dieser Er tauscht mit Paris den Körper und Steth lässt Paris mit seinem Schiff verschwinden. In der Gestalt von Paris begibt sich Steth auf die Krankenstation. Der Doktor bemerkt ein seltsames Verhalten an Paris, doch Steth schmeichelt dem Ego des Doktors und darauf gibt der Doktor dem falschen Paris frei. Später greift Steth Janeway an und übernimmt ihren Körper. Zur selben Zeit taucht Paris im Körper von Steth auf und versucht die Sache zu erklären. Doch die falsche Janeway versucht zu fliehen, allerdings wird sie von Paris abgefangen. Danach gelingt es dem Doktor Paris und Janeway in ihre Körper zurück zu bringenzurückzubringen. ({{VOY|Vis-à-vis}})
Während die ''Voyager'' weiter zum Alpha-Quadranten fliegt, empfängt das Schiff plötzlich eine seltsame Botschaft mit dem Symbol Omega. Die Sensoren der ''Voyager'' haben das [[Omega-Molekül]] entdeckt und Janeway muss die [[Omega-Direktive]] ausführen. Janeway hat den Auftrag, da dieses Molekül zu gefährlich ist, dieses es zu vernichten. Da sie dies nicht allein Bewältigen bewältigen kann, informiert Janeway ihre Führungsoffiziere, darunter auch den Doktor über die aktuelle Situation. Janeway gelingt es mit ihren Führungsoffizieren schließlich die lokalisierten Omega-Moleküle zu vernichten. ({{VOY|Die Omega Direktive}})
[[Datei:Der falsche Paris schmeichelt sich beim Doktor ein.jpg|thumb|left|Der falsche Tom Paris schmeichelt sich beim Doktor ein.]]
Wenige Wochen später kommt die [[Ramura]] [[Kellin (Ramuranerin)|Kellin]] an Bord der ''Voyager''. Sie behauptet, dass sie vor ein paar Wochen bereits auf der ''Voyager'' gewesen ist sei und mit Chakotay sogar eine Beziehung gehabt hathabe. Der Doktor untersucht sie darauf, kann aber nichts an ihr feststellen, da der Tricorder ihren Körper nicht scannen kann. Doch Kellin gelingt es ihre Behauptung zu Beweisen und sie beweisen. Sie bittet Captain Janeway um Asyl, da sie auf der Flucht vor ihrem Volk ist. Doch Kellin wird aufgespürt und , ihre Erinnerungen an die ''Voyager'' werden gelöscht und der Doktor kann nichts für sie tun. Auch die Crew verliert kurz darauf sämtliche Erinnerungen über die Ramura und setzt ihre Reise fort. ({{VOY|Unvergessen}})
Einige Zeit später schließt Captain Janeway ein Handelsabkommen mit den [[Vaskaner]]n ab und tauscht mit diesen ihnen medizinische Güter gegen [[Dilithium]]. Plötzlich greifen einige [[Kyrianer]] die ''Voyager'' an und , dringen an Bord ein und töten dort einige Crewmitglieder der ''Voyager''. Die Kyrianer werden schließlich eingekesselt und der Vaskanische vaskanische Botschafter töten tötet den Anführer der Kyrianer. Der Doktor kann mit seinem Tricorder nur noch den Tod des Kyrianers feststellen. Kurz darauf folgt ein weitere Angriff der Kyrianer auf die ''Voyager'' und diese sie stehlen einiges an Technologie von Bord der ''Voyager'', darunter auch ein Backup-Modul des Doktors. ({{VOY|Der Zeitzeuge}})
[[Datei:Der Doktor und Neelix streiten.jpg|thumb|Der Doktor und Neelix streiten sich.]]
Als die [[Deuterium]]vorräte der ''Voyager'' aufgebraucht sind und die Energie knapp wird, werden Notmaßnahmen getroffen, um Energie zu sparen. Die Crew muss ihre Quartier verlassen und ins Kasino umsiedeln. Doch Neelix will sich nicht dorthin umsiedeln lassen und macht es sich stattdessen mit einigen Crewmitgliedern auf der Krankenstation gemütlich. Der Doktor protestiert dagegen, da er sich in seiner Privatsphäre verletzt fühlt, doch Chakotay stellt ihn vor die Wahl, entweder er lässt Neelix und die anderen auf der Krankenstation bleiben oder er wird einfach deaktiviert. Zur selben Zeit befindet sich die ''Voyager'' im Orbit eines [[Y-Klasse]] -Planeten. Auf der Oberfläche versuchen Paris und Kim Deuterium zu finden, doch als . Als aber der Kontakt zu den beiden abbricht , ist Janeway gezwungen die ''Voyager'' auf der Oberfläche zu landen. Zur gleichen Zeit hat Neelix Schwierigkeiten auf der Krankenstation zu leben, da der Doktor nachts laut singt. Als Neelix droht mit zu singenmitzusingen, gibt der Doktor nach und lässt die anderen in Ruhe schlafen. Währenddessen findet ein Außenteam Paris und Kim und bringt die beiden auf die Krankenstation. Der Doktor ist froh, da er nun Patienten hat, endlich Neelix und die anderen von seiner Krankenstation zu vertreiben. Als der Doktor Paris und Kim untersucht, stellt dieser er fest das , dass die beiden vom Planeten umgewandelt worden sind und nur die Atmosphäre des Planten Planeten atmen können. Doch später stellt sich heraus, dass es sich um [[Silberblut]]-Duplikate von Kim und Paris handelt. Der echte Die echten Paris und Kim werden gefunden und werden auf die Krankenstation gebracht. Die ''Voyager'' bekommt das Deuterium im Austauschdafür, dass das Silberblut die Crew duplizieren darf. ({{VOY|Dämon}})
[[Datei:Voyager Stasiskammern.jpg|thumb|left|Der Doktor und Seven of Nine überwachen die sich in Stasis befindende Crew.]]
Einige Zeit später erreicht die ''Voyager'' einen [[Mutara-Klasse-Nebel]]. Als das Schiff in den Nebel hinein fliegt , erleidet die Crew schwere Verbrennungen und die ''Voyager'' verlässt darauf den Nebel. Da das Umfliegen des Nebels über ein Jahr dauert, wird die gesamte Crew mit Ausnahme vom von Doktor und Seven of Nine, welche die gegen die Auswirkungen des Nebels immun sind, in [[Stasis]] versetzt. Die beiden überwachen während des einmonatigen Fluges durch den Nebel die ''Voyager'' und die in Stasis schlafende Crew. Doch während dieser Zeit geraten der Doktor und Seven of Nine häufig in Streitereien. Doch mit der Zeit fällt durch den Nebel auch die Technologie aus und nach dem Ausfall des mobilen Emitters sitzt der Doktor wieder auf der Krankenstation fest. Inzwischen spürt auch Seven of Nine an den Auswirkungen des Nebels, sie leidet unter Halluzinationen. Schließlich fällt das Programm des Doktors vollständig aus und Seven of Nine ist gezwungen die ''Voyager'' allein durch den Nebel zu fliegen. Doch schließlich gelingt ihr das und die Crew wird aus der Stasis erweckt. ({{VOY|Eine}})
Am Ende des Jahres untersucht der Doktor , ob der [[Quanten-Slipstream-Antrieb]] schädliche Auswirkungen auf die Crew hat, doch der Doktor er kann nichts vorfinden. ({{VOY|In Furcht und Hoffnung}})
=== 2375 ===
[[Datei:Der Doktor kommt aufs Holodeck.jpg|thumb|Der Doktor taucht unerwartet auf dem Holodeck auf.]]
Anfang 2375 gerät die ''Voyager'' in eine Region, welche die die [[Die Leere (Region)|Leere]] genannt wird. In dieser Region gibt es keine Planeten und Sterne und die ''Voyager'' durchquert bereits seit zwei Monaten diese Region. Doch da Da es nichts zu tun gibt , langweilt sich die Crew und die Holodecks sind in der Zeit sehr gefragt. Zu der Zeit streiten sich der Doktor und Paris über die Nutzung des Holodecks. Allerdings wird die Reise durch diese Region über zwei Jahre dauern und die Moral der Crew sinkt. Plötzlich tauchen Fremde auf der ''Voyager'' auf und einer wird von diesen Nachtwesen wird verletzt. Der Doktor behandelt diesen ihn und Captain Janeway erfährt von den Fremden, dass die [[Malon]] ihre Heimat mit Antimaterieabfälle verseuchtverseuchen. Janeway fängt darauf an die Malon zu bekämpfen und vernichtet das Wurmloch, durch das die Malon ihre Entsorgung in die Leere eindringtvornehmen. Kurz bevor das Wurmloch kollabiert , durchfliegt die ''Voyager'' dieses Wurmloch und verlässt die Leere. ({{VOY|Nacht}})
Der Doktor begleitet ein Außenteam in einem Shuttle, welches das die Entstehung eines [[Protonebel]]s beobachten wollenwill. Der Doktor Er möchte unbedingt mit seiner [[Holokamera]] einige Bilder machen. Doch durch die Ausdehnung des Nebels droht das Shuttle zu explodieren und das Außenteamzu sterben. Beim beamen Beamen gelangen einige Nanosonden in den Mobilen Emitter des Doktors und dieser der Emitter wird beschädigt. Der Doktor ist wieder auf der Krankenstation und er bittet, dass Torres seinen Emitter so schnell wie möglich repariert. Doch durch die Nanosonden und der die DNS von Fähnrich [[Mulcahey]] entwickelt sich eine Borg-Drohne mit der Technologie aus dem 29. Jahrhundert. Der Borg nennt sich [[Erster (Borg)|Erster]] und Seven of Nine kümmert sich um den Borg. Bei einer Untersuchung stellt der Doktor fest, dass sein Emitter nicht mehr von dem Borg entfernt werden kann. Doch schon bald wird das [[Borg-Kollektiv]] auf den jungen Borg aufmerksam und will diesen ihn in das Kollektiv einfügen. Doch der junge Borg opfert sich und , beamt auf die [[Borg-Sphäre]] und fliegt mit dieser ihr in den Protonebel. Dabei wird die Sphäre vernichtet und der junge Borg wird dabei schwer verletzt. Der Borg wird darauf auf die Krankenstation gebeamt, doch als der Doktor diesen ihn behandeln will, aktiviert Erster ein Kraftfeld. Der Borg will sterben, da ansonsten die ''Voyager'' ständig von den Borg angegriffen wird. Nach dem Tod des Borgs bekommt der Doktor seinen Emitter wieder. ({{VOY|Die Drohne}})
[[Datei:Der Doktor untersucht toten 8472.jpg|thumb|left|Der Doktor untersucht ein totes Mitglied von Spezies 8472.]]
Nachdem Torres sich Torres auf dem Holodeck verletzt hat, als sie das [[Sicherheitsprotokoll]] abgestellt hat, wird diese sie auf die Krankenstation gebracht. Der Doktor findet bei Untersuchungen heraus, dass sich Torres häufig auf dem Holodeck verletzt hat. Dies meldet der Doktor er an Janeway und Janeway stellt stellt Torres darauf zu zur Rede. Janeway beauftragt den Doktor Torres die nächsten Tage zu überwachen. ({{VOY|Extreme Risiken}})
Auf einer [[Terrasphäre 8|Raumstation]] findet ein Außenteam eine Simulation der [[Akademie der Sternenflotte]] vor. Das Außenteam nimmt einen dieser Menschen mit und als der Doktor diesen ihn auf der Krankenstation untersuchen will, bringt der sich dieser um. Der Doktor untersucht den Leichnam und findet heraus, dass es sich bei diesem ihm um ein Mitglied von Spezies 8472 handelt. Janeway befürchtet darauf darauf deswegen eine Invasion von Spezies 8472 auf die Erde. Der Doktor beginnt darauf mit Seven of Nine Nanosonden zu produzieren, um Spezies 8472 zu bekämpfen. Trotzdem hofft der Doktor, dass die Nanosonden nicht eingesetzt werdenmüssen. Später gelingt es Janeway einen Waffenstillstand mit Spezies 8472 auszuhandeln. ({{VOY|In Fleisch und Blut}})
Der Doktor kümmert sich kurzzeitig vorübergehend um Naomi Wildman, als ihre Mutter kurzzeitig vermisst wurden ist. Der Doktor versucht sie in dieser Zeit abzulenken und erklärt ihr den Aufbau der [[Zelle (Biologie)|Zelle]]. ({{VOY|Es war einmal}})
[[Datei:Seven of Nine betrunken.jpg|thumb|Der Doktor und die betrunkene Seven of Nine.]]
Einige Wochen später wird der Quanten-Slipstream-Antrieb auf der ''Voyager'' angepasst und dieser wird wieder aktiviert. Mit Hilfe des Quanten-Slipstream-Antrieb Antriebs will die Crew endlich zurück zur Erde gelangen. Kurz bevor der Antrieb aktiviert wird, feiert die Crew diesen Anlass. Bei den Feierlichkeiten trinkt Seven of Nine ein Glas [[Synthehol]], welchen den sie allerdings aber nicht verträgt und , so dass der Doktor bringt die betrunkene Borg auf die Krankenstationbringen muss. Doch bei dem Flug mit dem Quanten-Slipstream-Antrieb kommt es zu Problemen, doch aber Seven of Nine erhält eine Botschaft aus der Zukunft, durch die die Voyager den Quanten-Slipstream wieder verlassen kann. Die ''Voyager'' ist zwar nicht nach Hause zurück gekehrt, konnte allerdings ihre Reise um zehn Jahre verkürzen. ({{VOY|Temporale Paradoxie}})
Kurze Zeit später beginnt Seven of Nine verschiedene Persönlichkeiten anzunehmen und der Doktor untersucht das seltsame Verhalten von Seven of Nine. Mit der Zeit übernehmen aus dem [[Hive-Bewusstsein]] stammenden stammende Persönlichkeiten immer mehr die Kontrolle über den Körper von Seven of Nine. Der Doktor tut zwar alles , was er kann, aber ihm gelingt es nicht diese Persönlichkeitsstörung zu behandeln. Inzwischen findet die ''Voyager'' in der nähe eine Nähe eines Trümmerfeldes ein [[Vinculum|Borg-Vinculum]], welches das für die Persönlichkeitsstörungen von Seven of Nine verantwortlich ist. Die Deaktivierung des Vinculums scheitert und Seven of Nine übernimmt immer mehr Persönlichkeiten. Tuvok schlägt schließlich vor Seven of Nine mit einer Geistesverschmelzung zu helfen, allerdings ist der Doktor gegen diesen Vorschlag. Da dem Doktor keine andere Möglichkeit einfällt Seven of Nine zu retten, stimmt er Tuvoks Vorschlag widerwillig zu. Tuvok verbindet seinen Geist und nimmt Kontakt mit Seven of Nine auf. Inzwischen gelingt es Torres das Vinculum zu deaktivieren und darauf schließlich erhält Seven of Nine wieder die Kontrolle über ihre Persönlichkeit wieder. ({{VOY|Das Vinculum}})
[[Datei:Der Doktor und Moset behandeln Torres.jpg|thumb|left|Der Doktor und Crell Moset behandeln B'Elanna Torres.]]
Einige Zeit später wird Torres von einer fremden Lebensform angegriffen, welche die sich dann mit Torres Torres’ Körper verbindet. Der Doktor findet keine Möglichkeiten beide wieder voneinander zu trennen. Da der Doktor er Hilfe von einen einem Experten in [[Xenobiologie]] benötigt, durchsucht sucht der Doktor einen Experten in der Datenbank, welcher der das nötige Fachwissen hat. Darauf erscheint ein Hologramm des Cardassianers [[Crell Moset]]. Beide versuchen darauf einen Weg zu finden, Torres und das fremde Wesen voneinander zu trennen , ohne beide zu töten. Bei weiteren Arbeiten erkennt der Bajoraner [[Tabor]] Crell Moset, als den Massenmörder der medizinische und Folterexperimente an Bajoranern durchgeführt hat. Der Doktor steht nun vor einem moralischen Konflikt, da er das Fachwissen von Moset benötigt, obwohl Moset das Wissen durch den Tod unschuldiger Bajoraner erlangt hat. Der Doktor stellt später das Hologramm von Moset zur Rede, doch das Hologramm erklärt , er sei nur ein Hologramm, was das mit den Taten des echten Moset nichts zu tun hat. Währenddessen weigert sich Torres von Moset behandeln zu lassen, da sie weiß, dass er ein Massenmörder ist. Später entscheidet Captain Janeway , um Torres zu retten, dass der Doktor weiter mit Moset zusammen arbeiten darf, obwohl sie weiß, dass es moralisch Falsch falsch und gegen den Willen von Torres ist. Dem Doktor gelingt es zusammen mit Moset Torres von dieser Kreatur zu befreien. Später wird das Wesen zurück zu seinen Artgenossen zurück gebeamt. Nach der Operation löscht der Doktor vollständig das Programm von Moset. ({{VOY|Inhumane Praktiken}}) …
Während Tom Paris für 30 Tage in Einzelhaft sitzt, behandelt ihn der Doktor, nachdem sich Paris in seiner Arrestzelle leicht verletzt hat. Paris bittet den Doktor ihn mit auf die Krankenstation zu nehmen, doch der Doktor muss ihm das verweigern. ({{VOY|Dreißig Tage}})