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Kurz darauf begleitet der Doktor Tuvok und Paris auf eine Außenmission. Doch ihr Shuttle wird in eine [[Raumtasche]] gezogen und stürzt auf einen [[Klasse D]]-Planeten ab. Dort werden Tuvok und Paris von Fremden angegriffen, doch sie bekommen Hilfe von einer Frau namens [[Noss]]. Da das Programm des Doktors auch einen [[Universalübersetzer]] enthält, übersetzt des Doktor für Noss. Da das Shuttle zerstört ist und kein Kontakt zur ''Voyager'' hergestellt werden sind, die drei gezwungen zusammen mit Noss auf der Oberfläche zu leben. Da sie Energie sparen müssen, wird das Programm des Doktors deaktiviert. Einige Wochen später wird der Doktor aktiviert, als sich Tuvok verletzt hat. Währenddessen versucht die Voyagercrew das Shuttle zu bergen und untersucht die Raumtasche. Dabei stellen diese fest, dass in der Raumtasche die Zeit viel schneller als im normalen Raum vergeht. Die Crew schickt eine Botschaft an das Außenteam, dass diese von dem Planeten gebeamt werden. Das Außenteam erhält die Botschaft und erfährt auch von dem Zeitunterschied. Inzwischen versucht ein [[Yosts Spezies|fremdes Wesen]] namens [[Yost]] die Raumtasche zu verschließen, um zu verhindern das weitere Raumschiffe in die Raumtasche gezogen werden. Bevor die Raumtasche geschlossen wird, gelingt es der Voyagercrew das Außenteam zusammen mit Noss aus der Raumtasche zu beamen. ({{VOY|Schwere}})
Wenige Wochen später entdeckt die ''Voyager'' ein Wurmloch, welches direkt zur Erde zurück führt. Doch als Seven of Nine von eine Außenmission zurückkehrt, bemerkt sie das seltsame Verhalten der Crew und berichtet dies dem Doktor. Der Doktor will darauf die Crew untersuchen, doch er wird deaktiviert, da sein Programm im Wurmloch beschädigt werden könnte. Auch Seven of Nine wird außer Gefecht gesetzt und die ''Voyager'' fliegt in das scheinbare Wurmloch. In Wirklichkeit handelt es sich bei dem Wurmloch um eine [[Telepathische Werferpflanze]], welche sich von der Energie der ''Voyager'' und ihrer Crew ernähren will. Während sich die Crew in dieser Werferpflanze befindet, verliert die gesamte Besatzung ihr Bewusstsein. Nur Naomi Wildman bleibt bei Bewusstsen und hilft Seven of Nine wieder zu sich zu kommen und diese aktiviert darauf dem Doktor. In der Telepathischen Werferpflanze befindet sich ein weiteres Schiff mit einem Fremden namens [[Qatai]] und beide Schiffe versuche aus dem Schlund der Werferpflanze zu entkommen. Qatai will die Werferpflanze töten, doch der Doktor streubt sich dagegen, da er gegen das töten dieser Kreatur ist. Doch beiden Schiffen gelingt es mit Energieausstößen zu entkommen und die Werferpflanze speit beide Schiffe wieder aus. ({{VOY|Euphorie}})
Nachdem die ''Voyager'' eine [[Borg-Sonde]] vernichtet ist, beamt die Beatzung die [[Trümmer]] an Bord. Der Doktor ist sehr begeistert, als dieser in den Trümmern einige medizinische Komponenten entdeckt. Zu der Zeit beschließt Captain Janeway von den Borg eine [[Transwarpspule]] von den Borg zu stehlen, damit die ''Voyager'' mit dieser Technologie schneller zurück in den Alpha-Quadrant reisen kann. Doch bei dem Diebstahl der Transwarpspule bleibt Seven of Nine auf dem Borgschiff zurück und kehrt zum [[Borg-Kollektiv]] zurück. Janeway plant eine Rettungsmission und lässt die gestohlene Transwarpspule in den [[Delta Flyer|''Delta Flyer'']] installieren. Der Doktor soll diese Rettungsmission begleiten, da er sich um den medizinischen Zustand von Seven of Nine kümmern soll. Der ''Flyer'' fliegt durch einen [[Transwarpkanal]] zum [[Unikomplex]] der Borg. Doch das Programm des Doktors scheint den Flug durch den Transwarpkanal nicht richtig zu vertragen und dieser wird [[Raumkrankheit|Raumkrank]]. Später gelingt es Janeway Seven of Nine aus der Gewalt der Borg zu befreien und der Doktor stellt die volle Gesundheit an ihr fest. Später kehrt der ''Flyer'' zur ''Voyager'' zurück und mit der Transwarpspule gelingt es der ''Voyager'' 20.000 Lichtjahre näher an den Alpha-Quadrant hinzugelangen. ({{VOY|Das ungewisse Dunkel, Teil I|Das ungewisse Dunkel, Teil II}})
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