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Einige Zeit später schließt Captain Janeway ein Handelsabkommen mit den [[Vaskaner]]n ab und tauscht mit diesen medizinische Güter gegen Dilithium. Plötzlich greifen einige [[Kyrianer]] die ''Voyager'' an und dringen an Bord ein und töten einige Crewmitglieder der ''Voyager''. Die Kyrianer werden schließlich eingekesselt und der Vaskanische Botschafter töten den Anführer der Kyrianer. Der Doktor kann mit seinem Tricorder nur noch den Tod des Kyrianers feststellen. Kurz darauf folgt ein weitere Angriff der Kyrianer auf die Voyager und diese stehlen einiges an Technologie von Bord der ''Voyager'', darunter auch ein Backup-Modul des Doktors. ({{VOY|Der Zeitzeuge}})
Als die [[Deuterium]]vorräte aufgebraucht sind und die Energie knapp wird, werden Notmaßnahmen getroffen, um Energie zu sparen. Die Crew muss ihre Quartier verlassen und ins Kasino umsiedeln. Doch Neelix will sich nicht dorthin umsiedeln lassen und macht es sich stattdessen mit einigen Crewmitgliedern auf der Krankenstation gemütlich. Der Doktor protestiert dagegen, da er sich in seiner Privatsphäre verletzt fühlt, doch Chakotay stellt ihn vor die Wahl, entwerder er lässt Neelix und die anderen auf der Krankenstation bleiben oder er wird einfach deaktiviert. Zur selben Zeit befindet sich die ''Voyager'' im Orbit eines [[Y-Klasse]] Planeten. Auf der Oberfläche versuchen Paris und Kim Deuterium zu finden, doch als der Kontakt zu den beiden abbricht ist Janeway gezwungen die ''Voyager'' auf der Oberfläche zu landen. Zur gleichen Zeit hat Neelix schwierigkeiten auf der Krankenstation zu leben, da der Doktor nachts laut singt. Als Neelix droht mit zu singen, gibt der Doktor nach und lässt die anderen in Ruhe schlafen. Währenddessen findet ein Außenteam Paris und Kim und bringt die beiden auf die Krankenstation. Der Doktor ist froh, da er nun Patienten hat, endlich Neelix und die anderen von seiner Krankenstation zu vertreiben. Als der Doktor Paris und Kim untersucht, stellt dieser festdas die beiden vom Planeten umgewandelt worden sind und nur die Atmosphäre des Planten atmen könnnen. Doch später stellt sich heraus, dass es sich um [[Silberblut]]-Duplikate von Kim und Paris handelt. Der echte Paris und Kim werden gefunden und werden auf die Krankenstation gebracht. Die ''Voyager'' bekommt das Deuterium im Austausch, dass das Silberblut die Crew duplizieren darf. ({{VOY|Dämon}})
Einige Zeit später erreicht die ''Voyager'' einen [[Mutara-Klasse-Nebel]]. Als das Schiff in den Nebel hineinfliegt erleidet die Crew schwere Verbrennungen und die ''Voyager'' verlässt darauf den Nebel. Da das Umfliegen des Nebels über ein Jahr dauert wird die gesamte Crew mit Ausnahme von dem Doktor und Seven of Nine, welche gegen die Auswirkungen des Nebels immun sind, in [[Stasis]] versetzt. Die beiden überwachen während des einmonatigen Fluges durch den Nebel die Voyager und die in Stasis schlafende Crew. Doch während dieser Zeit geraten der Doktor und Seven of Nie häufig in Streitereien. Doch mit der Zeit fällt durch den Nebel auch die Technologie aus und nach dem Ausfall des mobilen Emitters sitzt der Doktor wieder auf der Krankenstation fest. Inzwischen spührt auch Seven of Nine an den Auswirkungen des Nebels, sie leidet unter Haluzinationen. Schließlich fällt das Programm des Doktors vollständig aus und Seven of Nine ist gezwungen die ''Voyager'' allein durch den Nebel zu fliegen. Doch schließlich gelingt ihr das und die Crew wird aus der Stasis erweckt. ({{VOY|Eine}})
Ende des Jahres untersucht der Doktor ob der [[Quanten-Slipstream-Antrieb]] schädliche Auswirkungen auf die Crew hat, doch der Doktor kann nichts vorfinden. ({{VOY|In Furcht und Hoffnung}})
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