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Kurze Zeit später zeigen einige Crewmitglieder seltsame Krankheitssyntome. Janeway leidet unter schweren [[Kopfschmerz]]en und anfangs vermutet der Doktor, dass diese durch viel Stress ausgelöst worden sind. Doch plötzlich beginnen Chakotay und Neelix an genetische Mutationen zu leiden und der Doktor versucht heraus zu finden woher diese Mutationen stammen. Der Doktor findet bei seinen Untersuchungen heraus, dass die DNS von Neelix und Chakotay manipuliert worden ist. Plötzlich wird das Programm des Doktors aus dem Computer gelöscht, doch dem Doktor gelingt es im letzten Moment aufs Holodeck zu transferieren. Der Doktor versteckt sich darauf in einem Holoprogramm, als es an Bord zu immer mehr Mutationen kommt. Der Doktor nimmt heimlich Kontakt zu Seven of Nine auf und berichtet ihr von der Manipulation der DNS und erklärt ihr einen Weg diejenigen welche dafür verantwortlich sind aufzuspüren. Seven of Nine findet heraus, dass sich Fremde an Bord befinden und Experimente mit der Crew durchführen und ihr gelingt es eine dieser Fremde zu enttarnen. Die [[Srivani]] erklären ihre Experimente fortzuführen oder sie töten ansonsten die gesamte Crew. Um die ''Voyager'' zu retten, durchfliegt Janeway die ''Voyager'' durch einen [[Pulsar|binären Pulsar]]. Da die Srivani glauben, die ''Voyager'' wird durch den Pulsar vernichtet, fliehen diese von Bord. Nachdem die Srivani verschwunden sind, kann der Doktor die genetischen Mutationen stoppen. ({{VOY|Verwerfliche Experimente}})
[[Datei:Wiederbelebung von Neelix.jpg|thumb|Seven of Nine und der Doktor versuchen Neelix wieder zu beleben.]]
Nachdem Torres bei den Mari einige gewalttätige Gedanken entfernt worden sind, untersucht sie der Doktor, ob sie unter Folgeschäden leidet. ({{VOY|Gewalttätige Gedanken}})
Wenige Wochen später wird die ''Voyager'' angegriffen und die Fremden stehlen wichtige Technik von Bord der ''Voyager''. Unter den gestohlen Objekten befindet sich auch der mobile Emitter des Doktors und dieser sitzt nun wieder auf der Krankenstation fest. Während ein Außenteam auf einem Planeten nach der gestohlen Technologie sucht, langweilt sich der Doktor auf der Krankenstation. Als Seven of Nine den Doktor besucht, will der Doktor alles wissen was was auf dem Schiff geschieht. Später gelingt es dem Außenteam die Objekte wieder zu beschaffen und der Doktor bekommt seinen Emitter zurück. ({{VOY|Apropos Fliegen}})
Nachdem Neelix durch einen Unfall gestorben ist, kann der Doktor nichts mehr für ihn tun. Doch mit Hilfe von Seven of Nines Nanosonden kann der Doktor Neelix wieder erwecken, obwohl dieser bereits über 18 Stunden tot gewesen ist. ({{VOY|Leben nach dem Tod}})
[[Datei:Chakotay und der Doktor versuchen die Voyager zu retten.jpg|thumb|left|Chakotay und der Doktor versuchen die ''Voyager'' zu retten.]]
Kurz darauf hat die gesamte Crew seltsame [[Albtraum|Albträume]] und einige Crewmitglieder wachen gar nicht mehr auf. Der Doktor untersucht diese Crewmitglieder, kann jedoch nichts für diese tun. Da jeder eine [[Traumspezies|fremde Spezies]] gesehen hat, versucht Chakotay mit dieser in einem Traum Kontakt aufzunehmen. Da Chakotay seine Träume kontrollieren kann, willigt Janeway diesen Plan zu und der Doktor überwacht Chakotays Schlaf. Die Fremden erklären Chakotay im Traum einen Kurs wie die ''Voyager'', das Gebiet der Fremden verlassen kann. Chakotay wacht auf und die ''Voyager'' verlässt das Gebiet der Fremden und alle wachen wieder auf. Plötzlich greifen jedoch die Fremden die ''Voyager'' an und übernehmen die ''Voyager''. Plötzlich erkennt Chakotay, dass er noch immer träumt und ihn gelingt es sich wieder zu wecken. Der Doktor berichtet, dass nun die gesamte Crew schläft und alle im selben Traum gefangen sind. Chakotay und der Doktor versuchen nun die Fremden in der realen Welt zu finden, um so die Crew aus der Traumwelt zu befreien. Doch auch Chakotay schläft regelmäßig ein und der Doktor versucht Chakotay wach zu halten. Als die ''Voyager'' den Planeten erreicht, beamt dieser auf die Oberfläche und findet die schlafenden Fremden. Chakotay befiehlt den Doktor im Notfall einen Torpedo auf die Oberfläche zu feuern. Als Chakotay einschläft und wieder in die Traumwelt gelangt, warnt er die Fremden, dass der Doktor einen Torpedo auf sie feuern wird. Darauf geben die Fremden die Besatzung wieder frei und diese wacht wieder auf. ({{VOY|Wache Momente}})
[[Datei:Der Doktor und das MHN II.jpg|thumb|Der Doktor und das MHN Modell II in Not.]]
Mit Hilfe eines [[Hirogen-Kommunikationsnetzwerk|Kommunikationsnetzwerkes]] einer unbekannten Spezies entdeckt Seven of Nine ein Föderationsraumschiff. Mit dem Netzwerk versucht die ''Voyager'' Kontakt zum dem Schiff, welche sich an der Grenze zum Alpha-Quadrant befindet, aufzunehmen. Aber das Signal ist zu schwach und kommt zu den Schiff nicht durch. Captain Janeway beschließt ein stärkeres Signal durch das Netzwerk zu transferieren. Janeway schickt darauf den Doktor durch das Netzwerk in den Alpha-Quadrant. Der Doktor transferiert sich auf die [[USS Prometheus (Prometheus-Klasse)|USS ''Prometheus'']] und aktiviert sich darauf dort auf der Krankenstation. doch der Doktor findet nur tote Crewmitglieder vor. Der Doktor erfährt schließlich, dass die Romulaner das Schiff übernommen haben. Der Doktor aktiviert darauf das MHN der ''Prometheus''. Dieses MHN gehört zum MHN-Modell II und der Doktor versucht mit dem MHN II die ''Prometheus'' zurück zu erobern. Doch die beiden geraten häufig in Streitereien, da das MHN II den Doktor für ein primitives Programm hält. Doch der Doktor berichtet von seinen Erfahrungen und Erlebnissen und das er sogar schon [[Sex]] gehabt hat. Das MHN II hält das jedoch nicht für möglich, doch der Doktor erklärt, dass er seinem Programm eine Kleinigkeit hinzugefügt hat, um Sex haben zu können. Beide versuchen mit [[Neurozin-Gas]] die Romulaner zu betäuben, doch dabei wird der Doktor gefangen genommen. Doch dem MHN II gelingt es das Gas zu verteilen und damit die Romulaner zu betäuben. Beide begeben sich darauf auf die Brücke und versuchen die Kontrolle über die Steuerung zu übernehmen. Plötzlich melden die Sensoren, dass sich drei [[Warbird]]s der [[D'deridex-Klasse]] der ''Prometheus'' nähert. Den beiden gelingt es nicht den Warbirds zu entkommen, als sich plötzlich auch weitere Schiffe der Sternenflotte nähern. Bei dem Kampf gelingt es schließlich einen der Warbirds zu vernichten und die anderen Warbirds ziehen sich zurück. Darauf beamt ein Trupp der Sternenflotte auf die ''Prometheus''. Der Doktor berichtet der Sternenflotte, dass die ''Voyager'' im Delta-Quadrant verschollen ist und er berichtet über die Erlebnisse der Crew. Die Sternenflotte tut nun alles, um die verschollene ''Voyager'' nach Hause zu holen. Danach wird der Doktor durch das Netzwerk auf die ''Voyager'' zurück transferiert. ({{VOY|Flaschenpost}})
In den nächsten Wochen erhält der Doktor Botschaften der Sternenflotte über das Kommunikationsnetzwerk. Seven of Nine versucht die Botschaften zu bearbeiten und überarbeitet sich da bei. Der Doktor empfiehlt ihr sich etwas zu entspannen. Später taucht ein Fremdes Schiff auf und der Doktor unter sucht einen Leichnam. Es stellt sich heraus, dass das diejenigen, welche den Fremden getötet haben auch das Kommunikationsnetzwerk gehört. Diese Rasse nennt sich [[Hirogen]] und bei einem Kampf mit diesen wird das Netzwerk zerstört und der Kontakt zu Sternenflotte bricht wieder ab. ({{VOY|Jäger}})
=== 2375 ===
==== Lana ====
=== Hobbys ===
==== Musik ====
Anfang 2373 zeigt der Doktor ein großes Interesse an der Musik und er beginnt Opern zu studieren. Er fängt an sich Opern von vielen Opernstars anzusehen und schließlich fängt der Doktor auch Opern zu singen an. Der Doktor singt Arien auf dem Holodeck mit berühmten Opernstars, darunter auch [[Giuseppina Pentangeli]]. ({{VOY|Der Schwarm}})
Datei:Der Doktor und Giuseppina Pentangeli.jpg|Der Doktor und Giuseppina Pentangeli singen eine Oper.
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==== Holofotographie ====
Ende 2373 zeigt der Doktor ein große Interesse an der Holofotographie und er beginnt regelmäßig Fotos von der Crew zu schießen, auch wenn er damit der Crew auch manchmal ziemlich auf die Nerven geht. ({{VOY|Verborgene Bilder}})
== Alternative Leben ==
{{Dialogzitat||Torres und der Doktor sprechen über die Verhaltensauffälligkeiten des Isomorphs|Doktor|Wissen Sie noch, wie ''ich'' mich verhielt, als ich erstmals aktiviert wurde?|Torres|Und ob, Sie waren eine Nervensäge!}} ({{VOY|Der Isomorph}})
{{Dialogzitat|Doktor|Wer hätte gedacht, dass diese eklektische Gruppe von Reisenden tatsächlich zu einer Familie zusammenwachsen würde? Sternenflotte, Maquis, Klingonen, Talaxianer, Hologramm, Borg, sogar Mr. Paris.}} ({{VOY|Ein Jahr Hölle, Teil I}})
{{Dialogzitat||Beim Bedienen des Steuers|Der Doktor|Atmen sie mir nicht in den Nacken!|MHN Modell II|Mein Atem ist nur eine Simulation.|Der Doktor|Ist mein Nacken auch, hören Sie trotzdem auf!}} ({{VOY|Flaschenpost}})
=== "''Ich bin Arzt …''" ===