Das so genannte [[Spiegeluniversum]] ist ein zum bekannten [[Universum|Prime Universum]] koexistentes [[Paralleluniversum]] und weist große Ähnlichkeiten zum bekannten Universum auf. Offenbar kommt nahezu jede Person, jeder [[Planet]] und jedes [[Raumschiff|Schiff]] des bekannten Universums auch in diesem Universum vor. Selbst die Namen der Personen sind mit denen der uns bekannten identisch. Jedoch ist die [[Politik|politische]] Struktur dieses Universums grundlegend anders als die des bekannten. So zum Beispiel existiert die [[Föderation]] nicht. Anstatt ihrer herrscht ein [[Terranisches Imperium|terranisches Imperium]] im [[23. Jahrhundert]] über weite Teile des [[Alpha-Quadrant]]en, welches von einem [[Imperator]] geführt wird.

Aber nicht nur die Rebellen stellen für das Imperium eine [[Gefahr]] dar, auch die [[Völker des Spiegeluniversums|Tholianer]]. Mit Hilfe einer [[Interphasische Spalte|interphasischen Spalte]] können sie Kontakt mit dem bekannten Prime Universum aufnehmen. Mit einem gefälschten Notruf locken sie ein Schiff, die [[USS Defiant (NCC-1764)|USS ''Defiant'' (NCC-1764)]] in den Spalt. Das Schiff befindet sich in [[Interphase]] und gelangt so in das Spiegeluniversum. Als die Tholianer erkennen, dass dieses Schiff nicht nur aus einem anderem Universum, sondern auch aus der Zukunft stammt, bringen sie das Schiff in das [[Vintaak-System]] und schlachten es dort in einem [[Tholianisches Raumdock|Raumdock]] aus. ({{ENT|Die dunkle Seite des Spiegels, Teil I}})

Dank Kirks Hinweis bekommt Spock die Macht über den Tantalus-Strahler, einer mächtigen Waffe. Nachdem Kirk ins Spiegeluniversum zurückkehrt, beseitigt Spock ihn und übernimmt das Kommando über die ''Enterprise''. Spock steigt kurz darauf in eine der höchsten Positionen des Imperiums auf und beginnt dort mit friedlichen Reformen des Imperiums. ({{DS9|Die andere Seite}}) Kurz darauf wird Spock getötet. Zu dieser Zeit meutern einige Crewmitglieder der Enterprise und können mit Hilfe des Sklaven [[Saru (Spiegeluniversum)|Saru]] übernehmen. Die ''Enterprise'' flieht in ein [[Wurmloch]], welche eine Verbindung zum Prime Universum hat. Die befreiten Crewmitglieder fliehen von Bord der ''Enterprise'' und beginnen ein freies Leben im Prime Universum. ({{DSC|Spiegel}}) Ungefähr in dieser Zeit bilden die Klingonen und die [[Völker des Spiegeluniversums|Cardassianer]] eine [[Klingonisch-Cardassianische Allianz|Allianz]]. Diese Allianz wird mit der Zeit immer stärker und beginnt auch das Imperium anzugreifen. Sie befreien auch einige Welten, darunter Bajor, welche sich auch der Allianz anschließen. Durch Spocks Reformen ist das Imperium so schwach, dass es komplett von der Allianz erobert wird. Da der Allianz das andere Universum bekannt ist, wird sämtliche Technologie vernichtet, welche zu einem Transport in dieses Universum führt. Außerdem wird ein Gesetz erlassen, dass jeder welcher aus dem anderen Universum stammt eleminiert wird, da keine Einmischung gedulet wird. ({{DS9|Die andere Seite}})

 Die Allianz beginnt darauf mit der Versklavung der Bürger aus dem ehemaligen Imperium. Viele Terraner, Vulkanier und weitere Rassen müssen für die Allianz hart arbeiten. Aber es gibt auch Rassen, die für [[Geld]] bei der Allianz arbeiten, darunter die [[Völker des Spiegeluniversums|Trill]] und [[Völker des Spiegeluniversums|Ferengi]]. Es gibt aber auch Terraner, die für die Allianz frei arbeiten.

[[2372]] gelingt es den Rebellen unter schweren Verlusten, die Station Terok Nor zu erobern. Die Rebellen können viele Gefangene aus der Allianz machen, darunter auch die Intendantin Kira. Kira wird darauf eingesperrt und Bashir und viele Rebellen genießen es Kira für ihre Taten leiden zu lassen. Als einzigem [[Offizier]] gelingt Garak die Flucht von Terok Nor. Der [[Regent]] [[Worf (Spiegeluniversum)|Worf]] ist sehr erbost darüber und macht Garak für den Verlust der Station verantwortlich. Garak wird in Ketten dem Regenten vorgeführt und vergnügt sich an seinem Leid. Garak schiebt aber die Schuld auf die Intendantin und , doch Worf ist dies egal, da er in Garak noch immer den Hauptschuldigen sieht. Worf plant darauf den Angriff auf Terok Nor, um die Station zurück zu erobern. Die Rebellen sind sich der großen Gefahr, die Station zu halten, bewusst. Als "Smiley" O'Brien das erste Mal in unserem Universum war, hat er sich die [[Computer]]pläne der [[USS Defiant (NX-74205)|USS ''Defiant'' (NX-74205)]] herunter geladen. Mit diesen Daten beginnen die Rebellen mit dem Bau einer neuen [[ISS Defiant|ISS ''Defiant'']].  Aber es gibt technische Schwierigkeiten mit dem Schiff und der Angriff der Allianz rückt näher. Also fasst man den Plan, Benjamin Sisko wieder ins Spiegeluniversum zu holen. Jennifer Sisko kann [[Jake Sisko]] ins Spiegeluniversum locken und kurz darauf ist Benjamin Sisko gezwungen, ihr zu folgen. Als er im Spiegeluniversum ankommt, stellt ihm O'Brien die Bedingung, entweder zu helfen, die letzten technischen Probleme der Defiant zu lösen, oder er und sein Sohn können nicht in ihr Universum zurück. Also ist Sisko gezwungen, bei der Fertigstellung des Schiffs zu helfen. Um mehr Zeit zu gewinnen, fliegen [[Julian Bashir (Spiegeluniversum)|Julian Bashir]] und [[Jadzia Dax (Spiegeluniversum)|Jadzia Dax]] mit ihrem [[Liste von Schiffen im Spiegeluniversum|Schiff]], um mit Hilfe falscher [[Sensor]]enschatten die Flotte abzulenken. Diese Information hat die Rebellion von der auf Terok Nor gefangenen Intendantin erfahren.

Die Rebellen sind sich der großen Gefahr, die Station zu halten, bewusst. Als O'Brien das erste Mal im Prime Universum gewesen ist, hat er sich die [[Computer]]pläne der [[USS Defiant (NX-74205)|USS ''Defiant'' (NX-74205)]] herunter geladen. Mit diesen Daten beginnen die Rebellen mit dem Bau der [[ISS Defiant|ISS ''Defiant'']], welche bei Terok Nor errichtet wird. Aber es gibt technische Schwierigkeiten mit dem Schiff und der Angriff der Allianz rückt näher. Also fasst man den Plan, Benjamin Sisko wieder ins Spiegeluniversum zu holen. Jennifer Sisko kann [[Jake Sisko]] ins Spiegeluniversum locken und kurz darauf ist Benjamin Sisko gezwungen, ihr zu folgen. Als er im Spiegeluniversum ankommt, stellt ihm O'Brien die Bedingung, entweder zu helfen, die letzten technischen Probleme der ''Defiant'' zu lösen, oder er und sein Sohn können nicht in ihr Universum zurück. Also ist Sisko gezwungen, bei der Fertigstellung des Schiffs zu helfen. Dabei trifft Sisko wieder auf Dax und Bashir, welche beide Sisko schlagen, aufgrund seines Verhaltens bei seinem letzten Besuch. Um mehr Zeit zu gewinnen, fliegen Bashir und Dax mit ihrem [[Liste von Schiffen im Spiegeluniversum|Schiff]], um mit Hilfe falscher [[Sensor]]enschatten die Flotte abzulenken. Diese Information hat die Rebellion von der auf Terok Nor gefangenen Intendantin erfahren, nachdem Sisko es gelungen ist sie überzeugen ihm zu helfen. Dax und Bashir fliegen mit ihrem Schiff der Allianzflotte entgegen. Das Ablenkungsmanöver funktioniert, die Allianz denkt, eine Rebellenflotte kommt ihnen entgegen und beginnen die angeblichen Schiffe zu verfolgen. In der Zwischenzeit kann Benjamin Captain Sisko Jennifer Sisko überzeugen, Jake seinen Sohn wieder in unser Universum nach Deep Space 9 zurück zu schicken.

Jennifer Sisko begleitet Jake wenig später den jungen Sisko zum Transporter. Zu dieser Zeit befreit der Ferengi [[Nog (Spiegeluniversum)|Nog]] aus Dankbarkeit, weil er durch sie Kira Alleinerbe von der [[Quarks Quark's (Spiegeluniversum)|Bar]] seines Onkels geworden ist, Kira aus dem [[Arrest|Gefängnis]]. Er übergibt ihr seine Waffe und führt sie zu einem Fluchtschiff von Terok Nor. Aber weil Kira keine Zeugen für ihre Flucht braucht, tötet sie Nogund versucht von der Station zu fliehen. Auf ihrer der Flucht tötet trifft sie auch auf Professor Sisko und den jungen Sisko. Kira will den Professor als Geisel nehmen, doch da Kira auch Jenniferden Jungen nicht benötigt, als will sie Jake diesen töten. Doch Professor Sisko stellt sich schützend vor Kira zu schützen versuchtdem Jungen und wird dabei tödlich verwundet. Jake Den jungen Sisko lässt sie im Nachhinein aber am Leben, weil Kira seinem Vater noch etwas schuldet. Kira flieht darauf nach Bajor und taucht bei Bekannten unter.  In der Zwischenzeit erreicht die Allianz-Flotte Terok Nor und greift die Station an. O'Brien will Sisko nicht in Gefahr bringen und will diesen in sein Universum zurückschicken. Aber Sisko bleibt und hilft beim Kampf gegen die Allianz. Es kommt zum Angriff auf die Station, mehrere [[Liste von Schiffen im Spiegeluniversum|Bird of Preys]] und [[Liste von Schiffen im Spiegeluniversum|Schiffe der Galor Klasse]] greifen die Station an. Mit der ''Defiant'' können die Rebellen Widerstand leisten und auch einige Allianz-Schiffe vernichten. Aber das [[Regenten-Flaggschiff|Flaggschiff des Regenten]] macht der ''Defiant'' schwer zu schaffen, daher fliegt Sisko sehr nah an das Schiff heran, damit die Klingonen die ''Defiant'' mit ihren Waffen nicht erfassen können. Mit Hilfe Jadzias von Dax und Julians Schiff Bashir kann die ''Defiant'' das Schiff des Regenten schwer beschädigt werden und die Allianz zieht sich zurück. Der Regent merkt, dass er von Kira verraten wurde, und schwört ihr und den Rebellen Rache. Nach dem Sieg der Rebellen können Sisko und sein Sohn wieder zurück in ihr das Prime Universumzurück kehren. ({{DS9|Der zerbrochene Spiegel}})

[[Datei:Intendantin Kira und Bareil und die beiden Kirasplanen den Diebstahl des Drehkörpers.jpg|thumb|Intendantin Kira versucht und Bareil planen den Drehkörper zu stehlenDiebstahl des Drehkörpers.]]Nach dem Sturz als Intendantin muss sich Kira auf Bajor verstecken. In dieser Zeit beginnt sie, die Allianz zu hassen und plant ihre Rache an der Allianz, dafür, dass sie von ihr gestürzt wurde. Sie plant die Unabhängigkeit von Bajor und sie will über den Planeten herrschen. Mit ihrem Geliebten [[Bareil Antos (Spiegeluniversum)|Bareil Antos]] versucht sie in unserem Universum den [[Drehkörper]] [[Drehkörper der Prophezeiung und der Veränderung|der Prophezeiung und der Veränderung]] zu stehlen und auf Bajor eine neue [[Religion]] aufzubauen. Kira sieht sich schon als neuer [[Gott]] von Bajor.

Mit ihrem Geliebten [[Bareil Antos (Spiegeluniversum)|Bareil Antos2374]] versucht sie reist Bareil in unserem das Prime Universum den [[Drehkörper]] [[Drehkörper der Prophezeiung und der Veränderung|der Prophezeiung nimmt dort Kira als Geisel. Allerdings wird Bareil schnell verhaftet und der Veränderung]] er gibt Kira zu verstehen, dass er fehlgeleitet wurde. Bareil bittet Kira auch nicht in das Spiegeluniversum zurückkehren zu stehlen müssen. Kira zeigt Bareil die Station und auf Bajor eine neue berichtet auch von [[ReligionBareil Antos|seinem Gegenstück]] aufzubauen. Beide verbringen viel Zeit mit Kira sieht und diese verliebt sich schon als neuer [[Gott]] von Bajorin ihn.[[2374]] reist Bareil in unser Universum besucht auch eine bajoranische Messe und gibt sich als armer Bareil es sieht so aus, als sei der ehemalige Dieb auf den falschen Weg geleitet wurde, ein anständiges und ordentliches Leben zu führen. Zur selben Zeit kommt die andere Kira an Bord der Station und erkundigt sich wie weit Bareil vorangekommen ist. Bareil erklärt, dass er seine Arbeit für sie erledigen wird. Doch Bareil kommen Zweifel an ihren Plan. Er betrinkt sich darauf bei [[Quark]] und dabei durchschaut Quark Bareil und teilt Kira seinen Verdacht mit.

Die Kira aus unseren Universum vertraut sich ihm an [[Datei:Bareil und verliebt sich sogar in ihndie beiden Kiras. Bareil besucht auch eine bajoranische Messe und es sieht so aus, als sei der ehemalige Dieb auf jpg|thumb|left|Kira kann den Weg, ein anständiges und ordentliches Leben zu führenDiebstahl verhindern. Der Plan der Intendantin scheint aufzugehen, wenn da nicht [[Quark]] gewesen wäre. Quark durchschaut ihn und teilt Kira seinen Verdacht mit.

Inzwischen versucht Kira aus dem Spiegeluniversum zusammen mit Bareil den Drehkörper zu stehlen. Die Kira aus dem Spiegeluniversum gibt sich als Major Kira aus, um in den Schrein zu gelangen. Aufgrund Quarks Aussage begibt sich Kira gelangt noch rechtzeitig in den Schrein und erwischt trifft dort auf Bareil und ihr anderes Ich und erwischt diese beim Stehlen des Drehkörpers. Doch Kira bemerkt das Bareil sich verändert hat. Kira kann Bareil überzeugen, dass sein Verhalten falsch ist. Um die Intendantin aufzuhalten, betäubt er Bareil sie mit seinem [[Phaser]] und beide beamen mit leeren Händen zurück ins Spiegeluniversum. Kurze Zeit später Bareil weiß, dass Kira ihn wahrscheinlich dort töten wird die , er weiß aber auch, dass er der Intendantin von der Allianz gefangen genommenentkommen kann. ({{DS9|Erkenntnis}})

Kurze Zeit später wird die Intendantin von der Allianz gefangen genommen. Auch nach der erfolgreichen Verteidigung von Terok Nor geht der Konflikt zwischen den Rebellen und der Allianz weiter. Die Rebellion erleidet gegenüber der Allianz weitere Verluste, so kommt Jadzia Dax bei einem Gefecht ums Leben. In der Zwischenzeit plant der Regent Worf die Vernichtung von Terok Nor, dem wichtigsten Stützpunkt der Rebellen.