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Wenn Omega von den [[Sensoren]] eines [[Liste der Raumschiffe der Föderation|Schiffes]] der Sternenflotte entdeckt wird, werden automatisch alle [[Computer]]systeme an Bord gesperrt. Dabei erscheint auf den [[LCARS]]-[[Interface]]s das griechische Omega. Allein der Captain hat die nötigen Zugriffcodes, um die Computerblockade aufzuheben. Er muß nach Entdeckung des Moleküls sofort das [[Sternenflottenkommando]] benachrichtigen. Dieses schickt anschließend ein Spezialteam zu den entsprechenden Koordinaten und beginnt mit der Zerstörung des Moleküls.
Aufgrund der extrem hohen Gefahr, die von dem Omega-Molekül ausgeht, setzt die Omega-Direktive die offizielle [[Oberste Direktive]] , das Nichteinmischungsprotokoll, außer Kraft.
Als die [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] im [[Delta-Quadrant]]en auf ein Vorkommen von Omega-Molekülen traf, informierte Captain [[Kathryn Janeway]] ihre [[Führungsoffizier]]e über die Omega-Direktive, da ein Kontakt zur Sternenflotte nicht möglich war ({{VOY|Die Omega Direktive}}).
