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[[Bild:Illusion des Dominion.jpg|thumb|Die Offiziere der USS ''Defiant'' in der Hand des Dominions.]]
Nach dem Angriff auf die ''Odyssey'' ist sich die Föderation der Gefahr durch das Dominion bewußt. Auf Deep Space Nine bereiten sich die Offiziere auf eine [[Invasion]] des Dominions vor. Commander Sisko bekommt für Deep Space Nine die [[USS Defiant (NX-74205)|USS ''Defiant'' (NX-74205)]] zugeteilt. Sisko hat den Auftrag Kontakt mit den [[Gründer]]n des Dominions aufzunehmen. Die ''Defiant'' ist für diese Mission mit einer [[Romulaner|romulanischen]] [[Tarnvorrichtung]] ausgestattet. Bashir begleitet Sisko mit in den Gamma-Quadrant. Bei der Mission wird die ''Defiant'' von den [[Jem'Hadar]] angegriffen. Bei den Kampf übernimmt Bashir die [[Conn]], aber schließlich wird die ''Defiant'' von den Jem'Hadar übernommen. Nur Kira und Odo können entkommen. Die ''Defiant'' wird zur [[Heimatwelt der Gründer]] gebracht. Die Gründer erzeugen für die Bewußtlosen Offiziere eine Illusion, was geschehen wird wenn das Dominion Fuß im Alpha-Quadrant faßt. In dieser Simulation versuchen die Offiziere dieses Eindringen zu Verhindern. Bashir und die anderen Offiziere werden schließlich von Odo und Kira befreiht, welche sich ebenfalls auf dem Planeten befinden. Es stellt sich schließlich herraus, dass Odos Volk die Gründer des Dominions sind. Die ''Defiant'' kehrt nach Deep Space Nine zurück. ({{DS9|Die Suche, Teil I|Die Suche, Teil II}})
[[Bild:Junger Jem'Hadar.jpg|thumb|left|Doktor Julian Bashir, Benjamin Sisko und der junge Jem'Hadar.]]
Nach diesen Ereignissen ist die Angst vor einer Invasion des Dominions auf Deep Space Nine groß und immer mehr Personen verlassen die Station. [[Keiko O'Brien]] muß ihre [[Schule]] schließen, da kaum noch Kinder an Bord sind. Chief Miles O'Brien macht sich Sorgen um seine Frau und berät sich mit Julian Bashir über dieses Problem. Bashir empfiehlt seinen Freund, dass Keiko wieder ihren alten Beruf als [[Biologie|Biologin]] ausführen muß, um wieder glücklich zu sein. Der Chief hört auf den Ratschlag und Keiko nimmt an einer Expedition auf Bajor teil. ({{DS9|Das Haus des Quark}})
Wenige Wochen später leidet Jadzia Dax unter starken [[Halluzination]]en und sie verliert mehrmals ihr Bewußtsein. Ihre [[Isoboramin]]werte sinken und Jadzia droht daran zu sterben. Bashir tut alles um sie zu retten, aber es gelingt ihm nicht. Dax muß auf ihre Heimatwelt [[Trill (Planet)|Trill]] gebracht werden, um dort behandelt zu werden. Bashir kümmert sich auch um Trill um Dax. Es stellt sich herraus, dass es Probleme mit einen der Wirte von Dax. Die Erinnerungen von [[Joran Belar]] worden im [[Dax (Symbiont)|Dax-Symbiont]] unterdrückt. Schließlich werden die unterdrückten Erinnerungen in Dax freigesetzt und Jadzia wird gerettet. ({{DS9|Das Equilibrium}})
[[Bild:Sisko und Bashir auf Meridian.jpg|thumb|Doktor Julian Bashir, Benjamin Sisko auf Meridian.]]
Als Kira nach Cardassia entführt worden ist, hilft Bashir Sisko bei Suche nach ihr. Bashir und Sisko gelingt es Garak zu überzeugen mit nach Cardassia zu fliegen und Kira zu befreihen. ({{DS9|Die zweite Haut}})
Kurz darauf kauft Quark die Trümmerteile eines im Gamma-Quadranten abgestürzten Raumschiffs. In diesen Trümmern befindet sich ein [[Baby]]. Quark bringt das Kind zu Bashir und dieser untersucht es. Das Baby entwickelt sich innerhalb von wenigen Stunden in einen Teenager. Bashir wundert sich über die entwicklung, aber er stellt fest das dies bei seiner Spezies normal zu sein scheint. Innerhalb von wenigen Stunden wächst der Junge heran und es stellt sich herraus, dass es sich um einen Jem'Hadar handelt. Dieser greift Bashir an, aber Odo kann ihn unter Kontrolle bringen. Odo versucht zwar den Jem'Hadar zu zähmen, aber der Jem'Hadar will nichts anderes als kämpfen und töten. Odo sieht schließlich ein, dass er den Jem'Hadar nicht helfen kann und bringt ihn zurück zu seinen Volk. ({{DS9|Der Ausgesetzte}})
Bei der Löschung einiger Programme in der [[Erzaufbereitungsanlage]] aktiviert O'Brien ausversehen das [[Antirebellionsprogramm]] der Cardassianer. Deep Space Nine wird durch [[Kraftfeld]]er abgesichert und Bashir und die anderen Offiziere sitzen auf der [[OPS]] fest. Als die nächste Stufe des Programm gestartet wird, droht [[Neurozingas]] in den [[Habitatring]] auszuströmen und dort alle Personen zu töten. Dax versucht dies zu verhindern und deaktiviert die [[Lebenserhaltungssystem]]e. Dabei wird sie verletzt und Bashir behandelt sie. Durch die deaktivierung der Lebenserhaltungssysteme wird die nächste Stufe des Programms aktiviert und die [[Selbstzerstörung]] von Deep space Nine wird eingeleitet. Als man diese versucht zu deaktivieren wir die nächste Stufe aktiviert und die Offiziere werden von einem [[Phaser]] beschossen. Schließlich kommt Dukat an Bord und deaktiviert den Phaser. Durch Dukats Arroganz, verliert er seine Kommandocodes für Deep Space Nine und ihm gelingt weder die Selbstzerstörrung abzuschalten noch die Flucht. Sisko und O'Brien gelingt es schließlich die Energie, welche für die Vernichtung der Station vernatwortlich ist umzuleiten und können so das Programm deaktivieren. ({{DS9|In der Falle}})
Trotz der Gefahr durch das Dominion führt die Föderation weitere Forschungsmissionen im Gamma-Quadranten durch. Plötzlicht taucht, während einer Mission, ein Planet aus dem Nichts herraus. Die Bewohner des Planeten rufen die ''Defiant'' und laden die Offiziere auf ihren Planeten [[Meridian]] ein. Bashir gefällt der Planet sehr. Jadzia Dax verliebt sich auf dem Planeten in [[Deral]]. Um auf Meridian bleiben zu können, nachdem der Planet in die andere Dimension wechselt, muß Bashir die Moleküle von Dax ändern. Aber dies funktionert nicht und der Planet verschwindet ohne sie. Im letzten Moment kann Dax auf die ''Defiant'' gebeamt werden. ({{DS9|Meridian}})
Als [[Major]] [[Kira Nerys]] unter starken [[Stress]] steht, verordnet [[Julian Bashir]] Kira sich im Quarks zu entspannen. Sie bekommt dort zur Auswahl, ein Glas Karvino-Saft, [[Lorvan-Cracker]], einen [[Jumja-Stick]], Spielmarken und ein Besuch in der [[Holosuite]]. Bashir verordnet ihr, dass sie zwei von diesen Dingen nutzen muss. Quark bekommt von Bashir den Auftrag sie zu überwachen, damit sich Kira entspannt. ({{DS9|Defiant}})
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Dr. Bashir erfährt erstmals [[2374]] von der [[Sektion 31]], einem inoffiziellem [[Geheimdienst]] der Sternenflotte. Bei der ersten Begegnungt mit [[Luther Sloan]], einem hochrangigem [[Agent]]en der Sektion, lehnt er dessen Rekrutierungsversuche ab. Nach dem Julian dem Führungsstab von Deep Space 9 Bericht erstattet, schlägt Captain [[Benjamin Sisko|Sisko]] vor, weitere Versuche zu aktzeptieren, um so als [[Spion]] in der Sektion 31 zu dienen. Infolge dessen nimmt er an einigen [[Mission]]en dieser Organisation teil. Sein Kontaktmann ist stets Sloan. ({{DS9|Inquisition|Unter den Waffen schweigen die Gesetze|Extreme Maßnahmen}})
==Persönliches==
===Familie===
===Freunde===
====Miles O'Brien====
{{clear}}
====Leeta====
====Sarina Douglas====
====Ezri Dax====
==Alternative Leben==
{{Dialogzitat||als Quark seinen schweren Koffer durch die Leitungen schiebt|Bashir|Quark, los, vergessen Sie es.|Quark|Das kann ich nicht, das ist alles was ich habe. Mein persönlicher Almanach und mein Familienalbum|Bashir|Sie ist voller goldgepresstem Latinum, das wissen sie genau.|Quark|Wer sagt das?|Bashir|Ihre Mutter, und zwar an dem Tag, an dem sie geboren wurden.||geht erbost auf Bashir los|Quark|Mach niemals Witze über eine Ferengimutter. Verhaltensregel Nummer 31.}} ({{DS9|Die Belagerung}})
{{Dialogzitat|Bashir (gibt auf Dax nachzulaufen)|Sie genießt es. Es scheint so, als ob sie eine Art perversen Spass daran findet. Ich werde ihr in Zukunft nicht mehr nachlaufen. Wir werden ja sehen.}} ({{DS9|Metamorphosen}})
{{Dialogzitat|Bashir (wird von Dax geküsst)|Ich...ich..weiß nicht was ich sagen soll.|Jadzia Dax|Dann ist es eine Premiere.}} ({{DS9|Meridian}})
{{Dialogzitat|Garak|Sie sind längst nicht mehr der naive junge Mann den ich vor fünf Jahren kennen lernte. Sie sind misstrauisch und argwöhnisch geworden. Das steht Ihnen.|Bashir|Ich hatte einen guten Lehrer.}} ({{DS9|Die Schatten der Hölle}})
