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Die [[USS Enterprise (NCC-1701)|''Enterprise'']] fängt einen Notruf auf und entdeckt dabei ein [[Schläferschiff]] aus dem [[20. Jahrhundert]]. Die Passagiere unter der Führung des Diktators [[Khan Noonien Singh]] beginnen kurz darauf die ''Enterprise'' zu übernehmen.

Die [[USS Enterprise (NCC-1701)|''Enterprise'' ]] entdeckt ein unbekanntes [[Raumschiff]] mit den [[Sensoren]] und fliegt darauf zu. Auf der [[Brücke]] ist sich [[Spock]] sicher, dass es kein [[Liste der Föderationsraumschiffe|Föderationsschiff ]] ist, jedoch empfängt [[Uhura]] kurz darauf einen alten [[Morsecode]]. [[Captain]] [[James T. Kirk|Kirk]] amüsiert sich über Spocks Irrtum, diesem ist das Amüsement unverständlich und Kirk erklärt es als eine [[Mensch|menschliche]] Schwäche. Das unbekannte Schiff ist nun auf dem [[Hauptbildschirm]] zu sehen, und Kirk erkennt es als ein Schiff vom Typ [[DY-500-Klasse|DY-500]]. Spock korrigiert ihn und identifiziert es als [[DY-100-Klasse]] und merkt an das die letzten Schiffe dieses Typs um [[1990]] gebaut wurden. Die beiden mutmaßen über das Schicksal des Schiffs. Während Kirk glaubt, dass die ''Enterprise'' lediglich ein automatisches Notsignal erhät, glaubt Spock, dass es von einer unbekannten Rasse gekapert wurde. Kirk [[Befehl|befiehlt ]] Alarmbereitschaft und kontaktiert [[Doktor]] [[Leonard McCoy|McCoy]]. Der meldet, das seine Instrumente [[Herz]]schläge registrieren, ist aber der Ansicht, dass es sich nicht um Menschen handeln kann, da er nur vier pro Minute misst. Nun meldet Spock neue Werte, und zwar eine Energiequelle [[Energie]]quelle an Bord des Schiffs. Kirk befiehlt [[Alarmstufe Rot]]. Die ''Enterprise'' hat das andere Schiff erreicht und dreht bei.

Captain Kirk befiehlt über das [[Interkom]] Alarmbereitschaft für die [[Phaser]]mannschaften weiterhin Feuerbereitschaft, und beendet für alle anderen Decks Alarmstufe Rot. Doktor McCoy kommt auf die [[Brücke]] und schätzt die empfangenen Herzschläge auf 60 bis 70 [[Person]]en, kann aber zur [[Spezies]] keine Aussage machen. Spock tritt zum Captain und berichtet das der Name des Schiffs trotz [[MeteroitMeteorit]]enschäden ermittelt wurde. Er nennt den Namen [[SS Botany Bay|SS ''Botany Bay'']] und fügt hinzu das es nicht im Register verzeichnet ist. Er bemerkt die Unvollständigkeit der Aufzeichnungen aus der Zeit, da damals ein großer Krieg stattgefunden hat. Doktor McCoy benennt sie als die [[Eugenische Kriege|Eugenischen Kriege]] und Spock kritisiert diesen Krieg, da er das Ergebnis von [[Genetik|genetischen Experimenten ]] der Menschheit war. Doktor McCoy entgegnet das nur ehrgeizige [[Wissenschaft|Wissenschaftler]] dafür verantwortlich, [[Logik|logische]] Menschen ohne Gefühl. Bevor Spock reagieren kann unterbricht der Captain die Diskussion und entscheidet mit Doktor McCoy [[Beamen|hinüberzubeamen]] und übergibt Spock das [[Kommando]]. Kurz vor dem [[Turbolift]] fordert er noch die [[Historiker]]in für die Mission an.

Im [[Transporterraum]] steht [[Montgomery Scott|Scotty]] an der Konsole und berichtet das sich auf dem anderen Schiff eine [[Atmosphäre|Sauerstoffatmosphäre]] entwickelt. Auf Kirks Frage ob er sich bereit fühlt beschwert sich Dr. McCoy darüber hin und her gebeamt zu werden. Lieutenant McGivers trifft im Transporterraum ein und der [[Außenteam|Landetrupp]] macht sich fertig zum beamen.

Der Landetrupp materialisiert auf dem fremden Schiff in einem [[Korridor|Gang]], an dessen Seiten Kammern mit bewusstlosen Menschen angebracht sind. Scotty bemerkt, das es sich eindeutig um ein Schiff von der [[Erde]] aus dem [[20. Jahrhundert ]] mit [[Atomantrieb ]] handelt, und ergänzt das , dass er es gerne auseinander bauen würde. Lieutenant McGivers erzählt das es ein [[Schläferschiff ]] ist, früher für lange Flüge notwendig war, da es technologische Forschritte erst um [[2018]] gab. Kirk ist der Meinung, das es unmöglich ist das sie noch leben, Doktor McCoy entgegnet das es theoretisch möglich ist, jedoch wurde das über so einen Zeitraum nie erforscht. Mister Scott schaltet das Licht ein und McCoy registriert mit dem [[Tricorder]] eine Veränderung, die er dem Licht zuschreibt. Lieutenant McGivers weist alle anderen auf die einzige Kammer hin in der Licht brennt. Doktor McCoy registriert eine Erhöhung des Herzschlags. Der Captain will wissen ob er der Anführer ist und sie erklärt, das der [[Kommandant]] als erster wieder belebt wird, um dann zu entscheiden ob die Mannschaft auch aufgeweckt wird. Der Zustand des Mannes stabilisiert sich weiter. Scotty berichtet das sonst niemand mehr erwacht, sich jedoch eine bunte Gruppe aller Nationen an Bord befindet. McGivers freut sich auf die Begegnung mit einem Mann aus der Vergangenheit, doch McCoy meldet das der Herzschlag wieder fällt, da an der Kammer eine Fehlfunktion vorliegt. Die Fehlfunktion kann nicht schnell genug repariert werden. Bevor er [[Tod|stirbt]] öffnet Kirk die Kammer und sie holen den Mann heraus. Aus der Kammer befreit erwacht er kurz und erkundigt sich nach der Länge seines Kälteschlafs. Kirk kontaktiert die ''Enterprise'' um zurückgebeamt zu werden.

Kirk kontaktiert den Landetrupp und erkundigt sich ob sie [[Logbuch|Logbücher]] oder ähnliches gefunden haben. Mister Scott ist der Meinung, dass die Besatzung schon vor dem Start eingefroren wurde. Außerdem sind 12 Kammern ausgefallen, 72 in Ordnung wovon sich in 30 Frauen befinden. Kirk beginnt eine Diskussion mit Spock. Der Captain denkt, dass die Begegnung mit Menschen aus dem 20. Jahrhundert Probleme geben wird, da sie wenig über diese Zeit wissen. Spock erwidert, das selbst in der [[Datenbank|Föderationsdatenbank ]] nichts über die ''Botany Bay'' zu finden ist. Er bemerkt das , dass dieses Schiff nur für kurze Reisen gebaut wurde. Kirk kommt in den Sinn, dass ''Botany Bay'' auch der Name einer [[Strafkolonie ]] in [[Australien]] war. Spock meint, dass der Gedanke an ein Gefangenenschiff ein unlogischer Schluss ist, da man in harten Zeiten [[Verbrechen|Kriminellen ]] sicher nicht in ein fortschrittliches Raumschiff gesteckt hätte. Nachdem sie nicht weiter kommen und Spock meint, dass er Fakten benötigt, will Kirk Spocks Meinung über einen eventuellen Angriff wissen. Spock kann sich das nicht vorstellen, aber auch nicht ausschließen. Kirk befiehlt die ''Botany Bay'' abzuschleppen und einen Kurs zur [[Sternenbasis 12|Raumbasis 12]] zu berechnen.

In der [[Krankenstation]] hat sich die Lage normalisiert, Doktor McCoy dankt der [[Krankenschwester|Schwester]] und entlässt sie, dann untersucht er den unbekannten Mann nochmals mit seinem Scanner. Captain Kirk kommt herein und erkundigt sich nach dem Zustand des Patienten. McCoy meint, dass er aufgrund einer hervorragenden Konstitution überleben wird. Er merkt an, dass Herz- und [[Lunge]]nleistung besser sind als von ihnen selber. Lieutenant McGivers betritt die Krankenstation. Kirk äußert die Vermutung, dass es sich um einen [[GenetikAugment|genetischverbesserten Menschen]] verbesserten Menschen handelt, den Doktor interessiert eine eventuelle Leistungssteigerung des Gehirns[[Gehirn]]s. Sie fragt Doktor McCoy nach den Überlebenschancen des Unbekannten und der Doktor kann sie beruhigen. Der Captain bittet sie für eine Besprechung über ihr Verhalten in den Nebenraum. Sie diskutieren ihr Interesse über den Mann, wobei Kirk auch ein nicht nur berufliches vermutet. Er erinnert sie an ihre Pflicht als Mitglied der Mannschaft. Sie entgegnet ein rein professionelles Interesse aufgrund ihres Berufs, es kommt aber noch heraus, dass sie die Männer der Vergangenheit für mutiger und abenteuerlustiger hält als ihre Zeitgenossen. Der Captain nimmt ihre Meinung zur Kenntnis, und sie verlässt die Krankenstation. Doktor McCoy gratuliert dem Captain zu seinen Fähigkeiten als Psychologe, die beiden lächeln kurz darüber und Kirk verabschiedet sich ebenfalls. Doktor McCoy wendet sich wieder seinem Bericht zu. Im Raum nebenan erwacht der Patient, hält sich den Kopf, steht auf und macht eine stille Entspannungsübung. Währendessen kontaktiert McCoy das Labor und erkundigt sich nach den Testergebnissen, was der Unbekannte mithören kann. Nun sieht er sich um und entdeckt an der Wand antiquierte medizinische Ausrüstung, wovon er sich ein [[Skalpell ]] nimmt. Der Doktor hat sich entschlossen nochmals nach dem Patienten zu sehen, welcher immer noch reglos im Bett liegt. Nach einem kurzen Blick auf die Anzeigen hebt er ein [[Auge]]nlid an und wird plötzlich vom scheinbar bewusstlosen Unbekannten angegriffen, der ihn an der Kehle packt und das Skalpell ebenfalls dorthin drückt. McCoy stellt ihn vor die Wahl zwischen Kehle durchschneiden und Erwürgen, der Unbekannte reagiert aber nicht darauf und erzählt das , dass er dachte das , dass er träumt als er ihn reden hörte, und fragt wo er sich befindet. McCoy antwortet ihm, das er im Bett liegt und seinem Doktor im Moment ein Messer an die Kehle drückt. Der Patient will seine Frage beantwortet haben, McCoy lässt sich jedoch nicht aus der Ruhe bringen und gibt ihm den Tipp das er die [[Halsschlagader ]] am besten direkt hinter dem linken Ohr durchschneiden soll. Beeindruckt vom Mut des Doktors lässt er von ihm ab und McCoy nimmt ihm das Skalpell aus der Hand. Dann erzählt er, dass der Patient an Bord der ''Enterprise'' ist und die ''Botany Bay'' abgeschleppt wird. Doktor McCoy bestätigt ihm außerdem, dass er 200 Jahre geschlafen hat. Der Unbekannte verlangt den Captain zu sprechen. McCoy ruft ihn über das Interkom und berichtet über einen Patienten mit vielen Fragen.

Kurz darauf betritt der Captain die Krankenstation, stellt sich dem Gast vor und erkundigt sich nach dessen Namen. Dieser ignoriert die Frage und stellt selber einige. Er erfährt vom Captain das sie auf dem Weg zu Sternbasis 12 sind und das sich von seiner Besatzung noch 72 Personen in funktionierenden [[Stasiskammer]]n befinden. Daraufhin will er sie aufwecken lassen, Kirk schlägt ihm vor, damit zu warten bis sie Sternbasis 12 erreicht haben, womit er einverstanden ist. Auf Kirks nochmalige Frage nach dem Namen antwortet er, dass er nur [[Khan Noonien Singh|Khan]] heißt. Auf Kirks Frage nach dem Zeitpunkt des Starts unterbricht ihn Khan und schlägt vor, das Gespräch zu verschieben da er sehr müde ist. Kirk äußert sein Verständnis, will aber noch den Grund der Reise erfragen. McCoy unterbricht ihn mit der Bitte die Frage zu verschieben. Khan bittet noch um [[Buch|Bücher]], um sein Gedächtnis zu trainieren. Er gibt vor, früher [[Ingenieur]] für Raumfahrttechnik gewesen zu sein und dass er sich für die Weiterentwicklungen interessiert. Der Captain erklärt ihm das es keine Bücher mehr gibt und zeigt ihm einen Lesebildschirm und verweist Khan an Doktor McCoy für die Einweisung in die [[Bibliothek]]. Der Captain verlässt die Krankenstation und der Doktor beginnt mit den Erklärungen.

Beim Dinner wiederholt Captain Kirk seine frage nach dem Grund der Reise. Spock beginnt eine taktische Diskussion die Khans Meinung über die Verantwortlichen der Eugenischen Kriege ans Tageslicht bringen soll. Khans nennt sie einen Einigungsversuch für die Menschheit, wobei Spock einen Vergleich mit Tieren und Peitsche bringt. Khan meint, dass es wie [[Römisches Reich|Rom]] unter [[Julius Cäsar|Caesar]] werden sollte. Der durch die indirekten Fragen gereizte Khan besteht auf mehr Offenheit und bezeichnet sich als mutigen Menschen. Auf eine Fangfrage über mutige Männer gibt er sich als ein damaliger Machthaber zu erkennen, entschuldigt sich höflich und verlässt den Raum.

Kirk besucht Khan in der Kabine und eröffnet ihm das Wissen über seine Person, was in ein kurzes Gespräch übergeht, in dem Khan der Meinung ist, den Menschen immer noch überlegen zu sein. Nachdem Kirk gegangen ist öffnet Khan die verschlossene Tür mit bloßen Händen und schlägt den [[Sicherheitsoffizier|Sicherheitsmann ]] nieder.

Im Konferenzraum haben Khans Leute die Kontrolle. Khan hält eine kurze Ansprache um die Crew der ''Enterprise'' auf seine Seite zu bringen und ihn zu unterstützen. Mister Scott will jedoch nur wissen, wo sich der Captain befindet. Khan befiehlt [[Uhura ]] den Bildschirm einzuschalten, was sie erst nach einem Schlag ins Gesicht befolgt. Auf dem Schirm sieht man Kirk, der sich in der [[Unterdruckkammer]] befindet. Khan bietet das Leben des Captains für die [[Kapitulation]], jedoch entgegnet Doktor McCoy, dass sich ihm niemand von der Crew anschließen wird. Daraufhin droht er, die gesamte Mannschaft in der Kammer zu töten. Lieutenant McGivers entschuldigt sich, da sie den [[Tod ]] des Captains nicht mit ansehen will, Khan lässt sie gehen. Er wiederholt sein Kapitulationsangebot. Kurz darauf schaltet sich der Bildschirm aus, ein Anhänger von Khan will von [[Uhura]] mit Gewalt erzwingen, dass sie ihn wieder einschaltet. Khan jedoch ist der Meinung, dass der Captain jetzt tot sei und schickt einen Mann mit Spock zur Kammer.

Marla McGivers betritt das medizinische Labor, begibt sich zur Unterdruckkammer und sagt dem Posten, dass er nach dem Captain sehen soll. Dann betäubt sie den abgelenkten Posten mit einem [[Hypospray]] und befreit Kirk aus der Kammer. Sie entschuldigt sich für ihr Verhalten und bittet um Gnade für Khan. Als sie die Tür hören, versteckt sich Kirk und greift den Bewacher von Spock an, welcher von Spock mit dem [[Vulkanischer Nervengriff|Nervengriff]] betäubt wird. Sie beschließen, dass Schiff mit [[Nervengas ]] zu fluten, was Spock in Angriff nimmt.

Im Maschinenraum hört Khan über das Interkom mit, wie Mister Scott Spock berichtet, dass der Captain auf dem Weg zu ihm ist, und versteckt sich. Als der Captain den Raum betritt, wird er von Khan überrascht und entwaffnet. Khan zerstört den Phaser mit seiner Hand. Die Konsole gibt ein Geräusch von sich und Khan erzählt das sich eine Überlastung aufbaut, die das Schiff zerstört und greift Kirk an. Die beiden ringen im [[Maschinenraum]], bis Kirk aus einem Pult eine massive Stange ziehen und damit Khan überraschen und kampfunfähig machen kann. Danach entschärft er die Überlastung.

In Paradeuniform eröffnet Kirk mit einem Schlag auf eine Glocke die Anhörung. Gleich zu Beginn lässt er zur Überraschung seiner Offiziere alle Anklagepunkte fallen und schlägt vor, Khan und seine Leute auf [[Ceti Alpha V]], einem ungastlichen aber bewohnbaren Planeten auszusetzen. Er fragt Khan, ob er damit einverstanden ist. Dieser weist Kirk nur auf [[John Milton|Milton]] hin. Er stellt auch Lieutenant McGivers vor die Wahl, die Khan aber begleiten möchte. Nachdem die Anhörung beendet ist, gesteht Scotty, dass er nicht weiß was Milton geschrieben hat, und Kirk zitiert: „Es "Es ist besser in der [[Hölle ]] zu regieren als im [[Himmel ]] zu dienen.“ " Auf Spocks Gedanken was wohl in 100 Jahren aus der „Saat“ "Saat" geworden ist, meint Kirk, dass sie das nie erfahren werden, da von ihnen keiner so alt werden wird.

 * Diese Folge diente als Grundlage für den Film ''[[Star Trek II: Der Zorn des Khan]]''{{Film|2}}* In einer Szene sollte sich [[Marla McGivers]] mit ihrer Freundin Baker, gespielt von [[Barbara Baldavin]] unterhalten. Obwohl diese Szene anscheinend nie gedreht wurde, wird Baldavin in vielen Episodenführern mit einem Auftritt vermerkt.* [[Marla McGivers]] sollte als Historikerin, also ''Wissenschaftlerin'', eine ''blaue'' Uniform tragen.

* Als Kirk und Spock auf der Brücke über die ''Botany Bay'' und deren Besatzung diskutieren, gibt Kirk Spock den [[Befehl]], einen Kurs zu berechnen, obschon dies die Aufgabe des [[Navigator]]s ist. Zumindest tritt dieser Fehler in der deutschen Synchronfassung auf.

Bei der Synchronisation wurden in dieser Episode viele Dinge verändert, die [[Eugenische Kriege|Eugenischen Kriege]] fanden in den [[2090er]]n statt in den [[1990er]]n statt, und Khan reiste auf einem Schiff der ''DW-203'' Klasse, anstelle mit einem Schiff der [[DY-100-Klasse|''DY-100''-Klasse]].