Kurz bevor die ''Enterprise'' auslaufen soll, stürzt ein [[Klaangs Schiff|klingonisches Schiff]] auf die Erde. Der Pilot [[Klaang]] wird auf der Erde schwer verletzt. Die Vulkanier raten der Sternenflotte den Klingonen sterben zu lassen, aber Archer kann die Sternenflotte davon überzeugen, den Klingonen zu seiner Heimatwelt [[Qo'noS]] zu bringen. Aber Archer braucht für diese Mission Hilfe, so bekommt er den [[Denobulaner|denobulanischen]] [[Arzt]] [[Phlox]] und die Vulkanierin T'Pol zu seiner Crew hinzu. Archer bringt den Klingonen nach Qo'noS, aber ohne es zu ahnen greift er in den [[Temporaler Kalter Krieg|Temporalen Kalten Krieg]] ein. Die SulbianSuliban, eine Fraktion in diesem Konflikt, versuchen zu verhindern, dass Klaang wichtige Information nach Qo'noS überbringt. Obwohl die Suliban Klaang mehrmals Entführen, gelingt es Archer ihn zu befreien und Klaang erfolgreich nach Qo'noS zu bringen. Dort überbringt Klaang die wichtige Nachricht über die Einmischung der Suliban in das [[Klingonisches Reich|Klingonische Reich]]. Die Sternenflotte ist von der erfolgreichen Mission der ''Enterprise'' begeistert und die ''Enterprise'' beginnt mit der Erforschung des [[Tiefenraum]]. ({{ENT|Aufbruch ins Unbekannte, Teil I|Aufbruch ins Unbekannte, Teil II}})

Anfang [[2152]] werden Captain Archer und Ensign Mayweather von den [[Tandaraner]] gefangen genommen und in ein [[Gefängniskomplex 26|Internierungslager]] gebracht. Dort werden auch unschuldige Suliban gefangen gehalten. Diese Sulbian Suliban stehen im Verdacht die [[Cabal]] zu unterstützen, obwohl diese mit den Cabal nichts zu tun haben wollen. Auch Archer und Mayweather werden von den Tandaraner über die Cabal verhört und sogar gefoltert. Später können die beiden und die unschuldigen Suliban mit Hilfe der ''Enterprise'' aus dem Lager entkommen. ({{ENT|In sicherem Gewahrsam}})

Einen Monat später gerät die ''Enterprise'' in einen tödlichen [[Neutronensturm]]. Da das Schiff dem Sturm nicht entkommen kann, wird die gesamte Crew in die [[Warpgondel]]n evakuiert, damit sie dort überleben kann. Neben der Crew befinden sich auch drei [[Takretianer]] in den Gondeln. Die Crew verbringt einige Tage in den Gondeln als sich ein Schiff der Takretianer der ''Enterprise'' nähert und andockt. Die Takerianer Takretianer wollen die angeblich verlassene ''Enterprise'' übernehmen. Die Crew kann aber die ''Enterprise'' verteidigen und die Soldaten fliehen. Es stellt sich heraus, dass die drei Takretianer in Wirklichkeit Flüchtlinge sind, die vor der takretianischen Armee fliehen. Nachdem die ''Enterprise'' den Sturm durchflogen hat, kann die Crew wieder auf ihre Posten zurückkehren. ({{ENT|Der Laufsteg}})

Im Mai 2154 greifen eine Gruppe menschlicher [[Augment]]s einen klingonischen Bird of Prey an und kapern diesen. Mit diesen Vorfall beginnt die [[Augment-Krise]]. Der Vorfall führte zu einer akuten Kriegsgefahr zwischen Menschen und Klingonen. Die ''Enterprise'' wird wieder in den Einsatz geschickt um die Augments aufzuhalten. An Bord der ''Enterprise'' befindet sich [[Arik Soong]], ein Gefangener welcher der Ziehvater der Augments ist. Die ''Enterprise'' fliegt ins [[Borderland]] um dort die Augments aufzuspührenaufzuspüren. Dort gelingt Soong die Flucht von der ''Enterprise'' und er kann mit den Augments entkommen.

Die Besatzung der ''Enterprise'' findet heraus, dass es sich bei den Angreifer um die Romulaner handelt. Die Vier Völker bilden aber eine [[Allianz (2154)|Allianz]] und eine Flotte aus andorianischen, tellaritischen, vulkanischen Raumschiffen und die ''Enterprise'' versuchen mit Hilfe eines [[Sensorennetz]]es das romulanische Schiff aufzuspührenaufzuspüren. Am Ende gelingt es das romulanische Drohnenschiff aufzuhalten und Streitigkeiten zwischen Andorianern und Tellariten werden beigelegt. ({{ENT|Babel|Vereinigt|Die Aenar}})