Wenige Wochen später kommt es zu einem politischen Machtwechsel auf dem Planeten [[Xantoras]]. Die neue Regierung fordert, dass alle Fremden schnellst möglichst den Planeten verlassen. Zu der Zeit befindet sich ein denubolanisches Forschungsteam und erforscht Höhlen auf der Planetenoberfläche. Die denubolanische Regierung bittet die ''Enterprise'' von der Planetenoberfläche zu holen. Da Mayweather die meiste Erfahrung im Bergsteigen hat begleitet er das Außenteam in die Höhle. Das Außenteam klettert in tiefe Abgründe und dringt immer tiefer in die Höhle ein. Plötzlich verliert Reed seinen Halt und rutscht ab und zieht die anderen mit in die Tiefe. Kurz bevor Reed, Tucker und Mayweather in einen Abgrund stürzen, stützt sich Mayweather mit seinen Bein in einen Felsvorsprung und kann damit sich und die anderen davor bewahren in einen tiefen Abgrund zu stürzen. Allerdings bricht sich Mayweather sein Bein und ist gezwungen zurück zu bleiben. Tucker und Reed treffen auf die denubolanischen Wissenschaftler und zusammen mit dem verletzten Mayweather kehren sie auf die Oberfläche und zur ''Enterprise'' zurück. Zur selben Zeit erhält die ''Enterprise'' einen Notruf von einem Frachter im Orbit des Planeten [[Xantoras]]. Phlox kümmert sich um die vielen Verletzten. Doch unter den verletzten befindet sich [[Antaraner]] [[Hudak]]. Dieser weigert sich von Phlox behandeln zu lassen, da die Antaraner mit den Denobulanern verfeindet sind. Phlox respektiert den Wunsch von Hudak, doch Archer will nicht zu lassen das Phlox Hudak sterben lässt. Archer erklärt, dass Ärzte verpflichtet sind jedes Leben zu retten. Doch Phlox macht Archer klar, dass er kein Mensch ist und nicht an den [[Hippokratischer Eid|hippokratischen Eid]] gebunden ist. Für Phlox als Denobulaner ist es wichtig das die Wünsche des Patienten respektiert werden, auch wenn diese zum Tode führen. Als sich Phlox weigert Hudak zu behandeln, befiehlt Archer Phlox dies. Doch Phlox verweigert diesen Befehl, da er seiner medizinischen Ethik verpflichtet ist. Schließlich fügt sich Phlox Archers Befehl und versucht Hudakt zu behandeln, doch dieser stellt sich stur und schürt weiter die Feindschaft zwischen den beiden. Phlox wendet sich an T'Pol und bespricht mit ihr seine Probleme. Dieses Gespräch hilft Phlox sein Verhalten zu überdenken und er knüpft Kontakt zu Hudak. Phlox erzählt Hudak, dass er nie Hass auf die Antaraner gehabt hat und dies auch seiner Familie vermittelt hat. Er erzählt Hudak auch von seinen Sohn Mettus, dass er weiter den Hass gegen die Antaraner schürt, während Phlox immer Toleranz gelehrt hat. Schließlich lässt sich Hudak von Phlox behandelt und dieser rettet sein Leben. ({{ENT|Böses Blut}})

[[Datei:Xindus Trümmerfeld.jpg|thumb|Die ''Enterprise'' im Trümmerfeld von Xindus.]]

[[Datei:Enterprise bei einer Delphische Sphäre.jpg|thumb|left|Die ''Enterprise'' bei einer delphischen Sphäre.]]

Einige Zeit später wird die ''Enterprise'' von einer Anomalie getroffen. Dabei wird Cpatain Archer leicht verletzt. ({{ENT|Dämmerung}})

Kurz darauf nimmt Tucker einige Modifikationen am [[Warpantrieb]] des Schiffs vor, um auch in der delphischen Ausdehnung mit hoher Warpgeschwindigkeit fliegen zu können. Dabei versucht er einen komprimierten [[Plasma]]strom zu erzeugen. Allerdings gerät das Schiff dabei in eine Anomalie, woraufhin der Warpantrieb ausfällt. Tucker wird dabei schwer verletzt und fällt ins [[Koma]]. Da Archer ihn für die Mission benötigt, lässt er mit Hilfe von Phlox aus einer [[Biomimetische Lebensform|biomimetischen Lebensform]] einen [[Klon]] des Commanders züchten, um das geschädigte [[Gehirn|Hirngewebe]] zu ersetzen. Dieser bekommt den Namen [[Sim]] und entwickelt sich in kürzester Zeit von einem [[Baby|Säugling]] zu einem Erwachsenen. Die ''Enterprise'' ist inzwischen in einem Raumgebiet gestrandet, in welchem eine stark erhöhte Konzentration von [[nukleonisches Partikel|nukleonischen Partikeln]] zu registrieren ist und die sich auf der Außenhülle des Schiffs ablagern. Durch den Ausfall der [[Antrieb]]ssysteme steht das Schiff still und bewegt sich nicht fort, was keine akute Bedrohung ist, jedoch nimmt durch die Ablagerung der Partikel die effektive [[Masse]] des Schiffs zu, so dass man sich später, wenn der Antrieb repariert ist, nicht mehr fortbewegen kann. Sim kommt auf die Idee mit den beiden Fähren die ''Enterprise'' aus dem Feld hinaus zu ziehen. Reed und Mayweather steuern die Fähren und ziehen damit die ''Enterprise'' aus dem Feld heraus. Später stellt sich heraus, das Sim die Operation nicht überleben wird. Archer ist gezwungen Sims Leben zu opfern, um Tuckers Leben zu retten. Nach Sims Tod veranstaltet Archer eine [[Gedenkfeier]] für ihn. ({{ENT|Ebenbild}})

Mit Hilfe von Daniels reisen Archer und T'Pol durch die Zeit in das [[Detroit]] des Jahres [[2004]]. Dort halten sich einige [[Xindi-Reptilianer]] versteckt und entwickeln mit den gesammelten Daten Rajiins die [[Xindi-Biowaffe]], um die Menschheit zu vernichten. Es gelingt den beiden, die Xindi zu töten und die Entwicklung der Biowaffe zu stoppen. Mit Hilfe von Daniels reisen beide ins 22. Jahrhundert zurück und nehmen sämtliches Material und die Xindi-Leichname mit. ({{ENT|Carpenter Street}})

Einige Zeit später übernimmt eine Gruppe fanatischer [[Pilger]] die ''Enterprise''. Der Anführer der Gruppe, [[D'Jamat]], macht Archer und seine Crew für die [[Entweihung]] der heiligen Sphären verantwortlich. Die [[Triannoner]] drohen dem Captain, sich mit Hilfe eines [[Sprengstoff]]s, welcher sich in ihrem [[Körper]] befindet, zu töten und das Schiff zu zerstören. Als Beweis für seine Worte sprengt sich einer seiner Gefolgsmänner in die Luft und reißt ein Crewmitglied der ''Enterprise'' mit in den Tod. D'Jamat befiehlt, zur Strafe für die Entweihung der Sphäre ein Crewmitglied hinzurichten. Da D'Jamat die gesammelten Daten über die Sphären ebenfalls als Entweihung sieht, löscht er die gesammelten Daten über die Ausdehnung, inklusive der geborgenen Xindi-Datenbank. Später greift D'Jamat Andersgläubige mit der ''Enterprise'' an. Archer wählt sich inzwischen selbst als Crewmitglied, welches hingerichtet werden soll und übergibt T'Pol das Kommando über die ''Enterprise''. Mit einem Trick wird vorgetäuscht, dass Archer einem [[Transporter]]unfall zum Opfer fällt, aber in Wirklichkeit wird er nur an einen anderen Ort des Schiffes gebeamt. Mit dieser Finte gelingt es dem Captain mit Hilfe von Reed und den MACOs nach schweren Phasergefechten die Kontrolle über die ''Enterprise'' wiederzuerlangen. Darauf bricht die Enterprise den Kampf ab. Unterdessen gelingt es Phlox, den Sprengstoff der Triannoner zu neutralisieren, sodass diese keinerlei Gefahr mehr darstellen. Darauf werden D'Jamat und die anderen Triannoner zu ihrer Heimatwelt [[Triannon]] gebracht, welche aufgrund des jahrelangen Krieges und Hasses vollständig verwüstet ist. ({{ENT|Das auserwählte Reich}})

Nachdem die ''Kumari'' wieder aus der delphischen Ausdehnung verschwunden ist, kehrt die ''Enterprise'' wieder zurück in das Testgebiet, um das Gelände zu untersuchen. Dabei fällt ihnen mit Degra der Chefkonstrukteur der Waffe mitsamt der Crew [[Degras Schiff|seines Schiffs]] in die Hände. Da dieser aber nichts über die Waffe und den Konstruktionsort verraten will, wendet der Captain einen Trick an, um zu erfahren wo die Waffe gebaut wird. Er lässt Degras Gedächtnis vom Doktor löschen und auch sein Äußeres wird verändert. Degra wacht schließlich in einer Simulation wieder auf, in der die Xindi die Erde vernichtet haben und er mit Archer auf der Flucht vor den Insektoiden ist. T'Pol hat die Aufgabe, die Simulation zu überwachen und Archer mit Informationen über seinen Kommunikator zu versorgen. Schließlich bekommt Archer von Degra die Koordinaten von [[Azati Prime]], wo die Waffe gebaut wird. Aber durch eine Störung des Simulators bemerkt der Xindi plötzlich, dass es sich bei dem Ganzen um einen Trick handelt. Daraufhin greift Degra den Captain an. Diesem gelingt es jedoch, Degra zu überwältigen und durch eine weitere List bestätigt dieser die Koordinaten von Azati Prime. Nachdem Phlox das Gedächtnis Degras und seiner Crew abermals verändert hat, werden diese wieder auf ihr Schiff zurück gebracht. Die ''Enterprise'' nimmt Kurs auf Azati Prime. ({{ENT|Kriegslist}})

==== 2154 ====

[[Datei:MACO Meuterei.jpg|thumb|Die Crew der ''Enterprise'' meutert gegen die MACOs.]]

Kurz darauf spürt die Crew ein auf einem [[~/Planet/ENT/3x17/1|Planeten]] ein abgestürztes [[Insektoiden-Schiff]] auf. Ein Außenteam, angeführt vom Captain erforscht das Wrack. In der [[Brutstätte]] des Schiffes, findet Archer die [[Ei]]er der toten [[Xindi-Insektoid]]en-Crew, als er plötzlich von einem Verteidigungssystem der Brut angegriffen wird. Dieses infiziert ihn mit einem unbekannten Erreger und er beginnt sich daraufhin merkwürdig zu verhalten. Für Archer ist es nur noch wichtig die jungen Insektoiden zu schützen, während er seine eigentliche Mission, die Erde zu retten, vollkommen vergisst. Währenddessen untersuchen Tucker und Mayweather die Steuerung eines geborgenen [[Insektoiden-Shuttle]]s. Wenig später machen sich Mayweather, Reed und Tucker Sorgen um das Verhalten des Captains. Als Archer einen Großteil der Antimaterievorräte der ''Enterprise'' auf das Insektoiden-Schiff bringt, um damit die Brutstätte in Betrieb zu halten, planen T'Pol, Reed und Tucker eine [[Meuterei]]. Archer beginnt den Führungsoffizieren nicht mehr zu vertrauen und stationiert überall an Bord die MACOs. Den Führungsoffizieren gelingt es später schnell die Kontrolle über die [[Brücke]] zu erlangen, da sich Archer auf dem Planeten um die Insektoiden-Babys kümmert. Einem Team gelingt es, Archer zu betäuben, die Antimaterievorräte wieder auf die ''Enterprise'' zu transferieren und Archer zurück auf die ''Enterprise'' zu bringen. Schließlich findet Phlox heraus, dass Archer durch einen Erreger, der durch das Verteidigungssystem aktiviert worden ist, infiziert wurde. Dieser ist für das seltsame Verhalten von Archer verantwortlich gewesen. Nachdem Archer geheilt worden ist, setzt die ''Enterprise'' den Kurs nach Azati Prime fort. ({{ENT|Brutstätte}})