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Die Crew der [[IKS Somraw|IKS ''Somraw'']] wird durch den Genuss von [[Xarantinisches Bier|xarantinischem Bier]] bewusstlos, da sich ein Molekül eines [[Nervengift]]es darin befindet. ({{ENT|Schlafende Hunde}})
[[2152]] fragt [[Charles Tucker III]] [[Hoshi Sato]] nach ihrem ersten Transport, ob alle Moleküle an ihrem richtigen Platz seien und sie antwortet, dass sie es ihn wissen lassen wird. ({{ENT|Vermisst}})
[[2366]] sagt [[Doktor|Dr.]] [[Beverly Crusher]] zu [[Captain]] [[Jean-Luc Picard]] und [[Commander]] [[William Thomas Riker|Will Riker]], dass sie keine [[Ribosom]]en für den [[Romulaner]] [[Patahk]] [[Replikator|replizieren]] kann, weil die Moleküle dafür zu komplex sind. ({{TNG|Auf schmalem Grat}})
Die [[Borg-Implantat]]e synthetisieren alle [[Nährstoff]]-[[Molekül]]e, die die biologischen [[Körper]] der [[Borg-Drohne]]n benötigen. Daher müssen Borg nicht essen. ({{TNG|Ich bin Hugh}}; {{VOY|Die Gabe|Der schwarze Vogel}})
Bei der Beförderung einer Person mittels [[Transporter]] wird sie Molekül für Molekül auseinander genommen, verschwickt und am Zielort wieder zusammengesetzt. ({{TNG|Todesangst beim Beamen}})
[[2371]] bemerkt [[B'Elanna Torres]], dass die Moleküle des vermeintlichen [[Nebel]]s mit [[Omicron-Partikel]]n isolinear sind und keine [[Polyzyklische Struktur|polyzyklischen Strukturen]], dafür aber nukleogene Peptidbindungen haben. ({{VOY|Der mysteriöse Nebel}})