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Als das Föderationszeitschiff [[Aeon|''Aeon'']] die ''Voyager'' zerstören will, lässt Chakotay Gegenmaßnahmen einleiten. Durch den Angriff strandet die ''Voyager ''bei der Erde des [[20. Jahrhundert]]s. Er begibt sich mit einem Außenteam auf den Planeten, um das Zeitschiff zu finden. Mit Janeway entdeckt er Captain Braxton von der ''Aeon''. Dieser beschimpft sie daraufhin, weil die Menschheit durch eine temporale Explosion vernichtet werden wird. Er informiert sie darüber, dass [[Henry Starling]] sein Zeitschiff gestohlen hat und beim Versuch ins [[29. Jahrhundert]] zu reisen die temporale Explosion auslösen wird, die zu Braxton Auftrag führt, die ''Voyager'' zu zerstören. Um diese Katastrophe zu verhindern, dringt er mit Janeway bei [[Chronowerx]] ein. Er entdeckt ein Kraftfeld, dass das Zeitschiff schützt. Allerdings werden sie von Starling und [[H. Dunbar]] gestellt. Eine Rettungsmission gelingt, Kim lässt sie an Bord der ''Voyager'' beamen. Dabei verhindert Chakotay durch das Werfen eines Stuhles, dass Dunbar auf Janeway schießt. Anschließend versucht man das Zeitschiff an Bord zu beamen. Jedoch nutzt Starling den Transporterstrahl als Zugangsweg um Daten aus dem Hauptcomputer der ''Voyager'' zu stehlen. Nachdem Torres die Verbindung getrennt hat, meldet Chakotay die Schäden. ({{VOY|Vor dem Ende der Zukunft, Teil I}})
Bei einer anschließenden Besprechung der Führungsoffiziere, meldet er, dass Starling 20 % der Daten aus dem Hauptcomputer gestohlen hat. Er bemerkt, dass Starling, wenn er ins 29. Jahrhundert springt, das [[Raum-Zeit-Kontinuum]] sprengen wird. Da die Transporter ausgefallen sind, fliegt er mit Torres in einem Shuttle zur Erde um das Zeitschiff herauszubeamen. Während des Fluges unterhält er sich mit Torres. Falls sie hier stranden würden, würde er [[Archäologie]] lehren oder [[Ausgrabung]]en in Mittelamerika durchführen. Kurz darauf wird er von Paris informiert, dass Starling mit dem Doktor eingetroffen ist. Nachdem Starling in sein Auto einsteigt, versuchen er und Torres diesen herauszubeamen. Jedoch wird das Shuttle durch einen Störsender Starlings beschädigt und muss notlanden. Am Boden werden er und Torres von Anarchisten gefangen genommen. Diese halten sie für Regierungsagenten und die beiden können sie nicht vom Gegenteil überzeugen. Jedoch können Tuvok und der Doktor die Beiden befreien und neben den Entführern auch die FBI-Agenten betäuben, sodass alle auf die ''Voyager ''zurückkehren können. Chakotay fliegt daraufhin mit Tuvok in einem Shuttle los, um Paris und Robinson zu helfen, die Dunbars LKW verfolgen und von diesem beschossen werden. Mit den Bordphasern wird der LKW zerstört und Chakotay erkundigt sich nach dem Zustand der Beiden. Anschließend meldet er Janeway, dass sich das Zeitschiff nicht im LKW befand. Bald darauf registrieren die Sensoren der ''Voyager'' das Starten des Zeitschiffs. Chakotay kehrt daraufhin mit dem Außenteam an Bord zurück. Da Starling ein instabiles temporales Feld erzeugt, befiehlt er Paris auf einen [[Kollisionskurs]] zu gehen. Janeway kann die Torpedos gerade rechtzeitig scharf machen und Starlings Schiff zerstören. Die kurz darauf eintreffende ''Aeon'' bringt die ''Voyager'' anschließend ins 24. Jahrhundert zurück. ({{VOY|Vor dem Ende der Zukunft, Teil II}})
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