Wenig später über Seven und der Doktor soziales Verhalten. Seven hält diese Übungen für unzweckmäßig, doch der Doktor empfiehlt ihr weiter zu üben, damit sie sich besser in die Crew intigrieren kann. Zur selben Zeit taucht ein schwer beschädigtes Hirogenschiff aus und Janeway schickt ein Außenteam an Bord. Doch Seven hält das Risiko für zu groß und empfiehlt das Schiff zu zerstörren. Janeway erklärt, dass sie als Forscher alles über diese Spezies erfahren will. Das Außenteam findet einen überlebenden Hirogen und bringen diesen an Bord der ''Voyager''. Der überlebende Hirogen berichtet, dass seine Beute für den Angriff auf sein Schiff verantwortlich gewesen ist. Plötzlich dringt etwas von Außen an Bord der Voyager ein und es stellt sich herrausheraus, dass die Beute der Hirogen ein angehöriger von Spezies 8472 gewesen ist. Die Crew beginnt nun auf die Suche nach Spezies 8472. Bei ihrer Jagd bekommt die Crew die unterstützung des überlebenden Hirogen. Bei der Jagd wird Spezies 8472 von den Hirogen fast getötet, doch bevor der Hirogen seine Jagd beenden kann, wird dieser von Chakotay außer Gefecht gesetzt und dann eingesperrt. Um den verletzten Mitglied von spezies 8472 zu helfen, befiehlt Janeway Seven eine Singularität in den fluiden Raum zu öffnen. Doch Seven weigert sich diesen Befehl auszuführen, da sie in spezies 8472 eine zu große Bedrohung sieht. Janeway befiehlt Seven sich in den Frachtraum zu begeben, bis diese Kries vorbei. Zur selben Zeit tauchen weitere Hirogenschiffe auf und greifen die ''Voyager'' an. Die Hirogen fordern die Auslieferung ihres Gefährten und ihrer Beute. Doch Janeway will Spezies 8472 nicht an die Hirogen ausliefern. Die Hirogen greifen an und alle Kraftfelder an Bord fallen aus und der Hirogen kann ausbrechen und seine Jagd fortsetzen. Als es zum Kampf zwischen den Hirogen und Spezies 8472 kommt, kommt Seven hinzu und sie keine andere Wahl als beide an Bord der Hirogenschiffe zu beamen. Darauf ziehen sich die Hirogen zurück. Janeway ist wütend über das eigenmächtige Handel von Seven und entzieht ihr zur Strafe den Zugang zu den Primärsystemen des Schiffes, sie darf aber noch in der Astrometrie arbeiten. ({{VOY|Die Beute}})

Kurz versucht ein Schiff der Malon eine Sonde der ''Voyager'' zu stehlen. Damit die Malon nicht an diese Technologie heran gelangen können, lässt Janeway die Sonde in die Atmosphäre eines Gasriesen fliegen. Dort steckt die Sonde allerdings fest und die Malon kommen bei der Bergung der Sonde ums Leben. Da sich die Sonde nicht aus der Atmosphäre heraus beamen lässt, schlägt Paris vor mit einem modifizierten Shuttle in die Atmosphäre zu fliegen. Paris präsentiert für diese Mission sein neu entworfenes Shuttle, welcher er [[Delta Flyer|''Delta Flyer'']] nennt, vor. Janeway ist von diesem neuen Shuttletyp beeindruckt und erlaubt Paris dieses Shuttle zu bauen. Da Seven die Idee für dieses Shuttle ebenfalls gut findet, ist diese bereit auf ihre Regeneration zu verzichten, damit das Shuttle schnellst möglichst gebaut wird. Während das Shuttle gebaut wird, spioniert Seven die Malon heimlich aus und findet herrausheraus, dass auch diese ein Shuttle bauen. Janeway macht nun Druck damit der ''Delta Flyer'' vor den Malon fertig wird. Kurz darauf kann Paris den Bau des ''Delta Flyers'' abschließen und diese fliegen in die Atmosphäre. Auch die Malon schicken ihr Shuttle in die Atmosphäre. Doch trotz des Kampfes mit dem Malon-Shuttles gelingt es dem ''Delta Flyer'' die Sonde zu bergen. ({{VOY|Extreme Risiken}})

Bei der jährlichen Untersuchung, die der Doktor nun mit der Holokamera durchführt, stellt er fest, dass er an Kim eine Operation durchgeführt hat, an die er sich nicht erinnern kann. Auch Kim kann sich nicht an diese Operation erinnern. Der Doktor meldet es später Janeway, aber die hat momentan keine Zeit. Später bittet er Seven, dass sie ihm hilft herauszufinden wer Kim operiert hat. Als sich Seven später beim Doktor meldet, kann er sich nicht erinnern sie um so etwas gebeten zu haben. Seven findet heraus, dass die Erinnerungen des Doktors gelöscht worden sind. Bei weiteren Untersuchungen finden sie heraus, dass Erinnerungen des Doktors über Ereignisse vor 18 Monaten manipuliert worden sind. Seven gelingt es die Erinnerungen teilweise wieder herzustellen und der Doktor beginnt sich an einen unbekannten Fähnrich und eine fremde Spezies zu erinnern. Darauf teilt der Doktor dies Janeway und Tuvok mit, die beiden versprechen, dass sie sich darum kümmern werden, und der Doktor soll sich auf die Krankenstation begeben. Da der Doktor wieder fürchtet, dass seine Erinnerungen gelöscht werden, speichert er sie heimlich und er aktiviert die Holokamera, damit er herausfindet, wer dafür verantwortlich ist. Nachdem der Doktor sich wieder aktiviert, bemerkt er, dass seine Erinnerungen wieder gelöscht worden sind, doch er kann sie reaktivieren. Anhand des geschossenen Fotos erkennt er, dass Janeway seine Erinnerungen gelöscht hat. Er stellt sie deshalb zu Rede, doch Janeway erklärt, dass dies zum Wohl des Doktors geschehe. Der Doktor soll sich wieder auf die Krankenstation begeben, um dort wieder umprogrammiert zu werden. Doch Seven setzt sich bei Janeway für den Doktor ein, damit er nicht umprogrammiert wird. Janeway erklärt darauf dem Doktor, dass er sich vor 18 Monaten bei einer Operation zwischen der Rettung von Kim und Fähnrich [[Ahni Jetal]] hat entscheiden müssen. Kim hat die Operation überlebt, aber Jetal ist gestorben. Deshalb hat sich der Doktor schwere vorwürfe gemacht und sein Programm geriet sogar in eine Feedback-Schleife. Nur eine Löschung der Erinnerung konnte ihn damals retten. Doch nachdem der Doktor die Wahrheit erfahren hat, gerät sein Programm wieder in die selbe dieselbe Feedback-Schleife. Aber nach einen weiteren Gespräch mit Seven of Nine ist Janeway dafür, dass der Doktor seine damalige Entscheidung verarbeiten darf. In den nächsten zwei Wochen ist immer ein Crewmitglied in der Nähe des Doktors, das ihm hilft diese Erinnerung und die Feedback-Schleife zu verarbeiten. So soll der Doktor die Möglichkeit bekommen sich weiter zu entwickeln. ({{VOY|Verborgene Bilder}})

Doch schließlich wird die ''Raven'' von den Borg entdeckt und die Borg greifen diese an. Magnus Hansen versucht mit der Raven auf einem Planeten Notzulanden. Doch die Borg assimilieren ihn. Er versucht noch seine Tochter zu schützen, doch die gesammte gesamte Familie wird assimiliert. ({{VOY|Der schwarze Vogel}})