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Im Durchschnitt sind Klingonen größer und körperlich stärker als [[Mensch]]en. Sie sind bekannt dafür, keine Tränendrüsen zu haben und während die meisten rotes Blut haben, gibt es einige, deren Blut ausgesprochen rosa ist. Klingonen leiden unter verschiedene Allergien insbesondere eine starke Reaktion auf kleine pelzige Tierchen wie [[Tribble]]s (''([[TOS]]: "[[Kennen Sie Tribbles?]]")''). Außerdem sind sie sehr kälteempfindlich. Dies zu zeigen wäre jedoch unter ihrer Würde.

Das Körperinnere der Klingonen unterscheidet sich erheblich von dem menschlichen. Es gibt wesentlich mehr Redundanz ihrer Organe, eine Eigenschaft die sie [[brak'lul]] nennen. Dadurch können Klingonen auch schwere Verletzungen im Kampf überleben. Sie haben dreiundzwanzig Rippen, drei Lungenflügel, zwei Lebern, ein acht-kammeriges Herz und sogar doppelte Nervenfunktionen sowie mehrere Mägen. Klingonen haben überraschend wenig Kenntnis ihrer Physiologie und ihre Medizin ist sehr schwach entwickelt. Das ist vor allem auf ihre Krieger-Tradition zurückzuführen - ein verletzter Klingone überlebt, wird zum Sterben zurückgelassen oder vollzieht das [[Hegh'bat]], den rituellen Selbstmord. (''([[TNG]]: "[[Die Operation]]")'').

Wozu Klingonen einen dritten Lungenflügel brauchen ist unbekannt. Evolutionsbiologen nehmen an das er ihnen eines Tages mehr Ausdauer auf dem Schlachtfeld geben kann(''([[VOY]]: "[[Abstammung]]")'').

Insbesondere Weibliche weibliche Klingonen neigen zu einer Krümung Krümmung der Wirbelsäule. Dieser Defkt Defekt ist vererbbar, lässt sich aber duch nachtrögliche vorbeugende Genmanipulation oder nachträgliche Operationen oder vorbäugende Genmanipulation beheben(''([[VOY]]: "[[Abstammung]]")'').

Durch ihre Abstammung von den [[Urhumanoide]]n werden [[Mischlingskind]]er mit anderen Spezies möglich, so wie [[B'Elanna Torres]] oder [[Ba'el]]. Klingonische Gesichtsmerkmahle sind bei Hybriden meist sehr dominant(''([[VOY]]: "[[Abstammung]]")'').