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Kira unterstützt [[2375]] den von [[Legat]] [[Damar]] organisierten Widerstand gegen das [[Dominion]] und ist damit nicht unbeteiligt an der Niederlage des Dominion im [[Dominion-Krieg]]. Um aber Bajor, das eine neutrale Position im Dominion-Krieg eingenommen hat, nicht mit in den [[Krieg]] zu ziehen, verleiht ihr das [[Sternenflottenkommando]] ein [[Offizierspatent]]. Für diese Mission erhält sie den [[Rang]] eines [[Commander]]s. Jedoch bleiben die Cardassianer misstrauisch gegenüber einer, aus ihrer Sicht, ehemaligen Terroristin. Nur Damar kann seine Männer überzeugen, dass ihre Hilfe absolut notwendig ist. Trotzdem bleibt insbesondere sein engster Vertrauter [[Rusot|Gul Rusot]] skeptisch gegenüber Kira. Dies mündet in zahlreichen Provokationen. So weist Rusot sie auf Odos Rolle während der Besatzung hin, die nach ihm der eines Kollaborateurs gleiche, und somit Kira missfallen müsste. ({{DS9|Ein Unglück kommt selten allein}})[[Datei:KiraRusot.jpg|thumb|left|Kira überwältigt Rusot.]] Weiterhin versucht Rusot immer wieder Kiras aktive Rolle beim Widerstand in ein schlechtes Licht zu rücken, und sie unteranderem als Mörderin von hunderten von Cardassianern darzustellen, die sich ihre Halsknochen als Trophäen an den Gürtel hängt. Dies lässt sich Kira nicht gefallen und demonstriert Rusot, warum er sie lieber in Frieden lassen sollte.

Einen herben Rückschlag erlebt ihr Wirken bei einem geplanten Treffen auf [[Cardassia Prime]] mit den potenziellen Dissidenten [[Revok|Gul Revok]], [[Seltan]] und [[Goris|Legat Goris]], die eine nach Damar essenzielle Truppenzahl stellen könnten. Jedoch läuft die ganze Operation schief: Revok entpuppt sich als Verräter, alle Cardassianer, die sich der Rebellion anschließen wollen, werden von den [[Jem'Hadar ]] eliminiert. Auch das erbeutete Schiff wird vernichtet. Nur Kira, Damar und [[Garak ]] überleben dieses Unglück, gefangen in der Kernwelt des Feindes.

Der Widerstand bleibt jedoch nicht unbeantwortet, das Dominion beginnt mit der Vernichtung von [[Datei:Kira arbeitet verdecktLakarian City]] und geht nachdem die cardassianische Flotte zur Allianz überläuft zur systematischen Vernichtung der Cardassianer und Cardassia Primes über. Hinzu kommt, dass die Jem'Hadar, das Versteck der Gruppe lokalisieren, Mila töten und nun bereit sind alle Rebellen zu exekutieren.jpg|thumb|Kira beobachtet Bevor der Befehl jedoch vollstreckt wird, kommt ihnen die Hilfe anwesender cardassianischer Truppen zugute, die Cardassianer]]die Jem'Hadar niederschießen und sich der Rebellion anschließen.

Mit eigenen Augen erlebt Nun bleibt Kira, Damar und ihren Gefährten bleibt nur noch der Sturm auf das Hauptquartier des Dominion, um das cardassianische VolkMorden zu beenden. Zum Missfallen der Rebellen, wie Damarkann der von Garak angefertigte Sprengsatz nicht den Eingang öffnen. Kira, nun in vollkommenen Sarkasmus, scherzt, quicklebendigdass die Rebellen, einen Anschlag auf eine an die Tür klopfen und die Jem'Hadar-Kaserne verübt fragen sollten, ob sie die Rebellen vielleicht nicht reinlassen könnten. Schließlich kommt ihnen die unfreiwillige Hilfe eines anderen Cardassianers, dem neuen Führer Cardassias, [[Broca]], zugute, der im Sinne des systematischen Völkermords auch exekutiert wird. Seine Exekution vor dem Eingang ermöglicht den Eintritt der Rebellen in das Hauptquartier. Der Sturm gelingt nur unter größten Verlusten und danach das Volk zum Kampf auf den Straßen aufruftDamar fällt an vorderster Linie. Auch Letztlich schaffen es nur Kira beobachtet , Garak und Ekoor in den ProzessKontrollraum, wo sie auf [[Weyoun 8|Weyoun]] und die angeschlagene [[Gründerin|Gründerin]] treffen. Garak erschießt Weyoun, und die Gründerin, durch ihre Krankheit nicht in der gewisse Parallelen Lage die Form zu ihrer Vergangenheit im Widerstand aufweistwechseln, ist ihre Gefangene. ({{DS9|In den Wirren des Krieges}})