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Janeway wird verletzt. Jedoch kann sie rasch wieder aufstehen und verstärkt die Schilde. Allerdings wird Chakotay zuvor noch schwer verletzt. Außerdem wird der Tod von zwei Besatzungsmitgliedern gemeldet. Daraufhin begibt sich Janeway auf die Krankenstation. Dabei entdeckt sie ein getötetes Wesen in einem Gang und wird von Neelix informiert, dass er den mobilen Emitter des Doktors auf Deck 9 gefunden hat. Sie bringt den Emitter auf die Krankenstation und aktiviert das MHN der ''Equinox''. Nachdem Chakotay behandelt wurde, will er mit den "Geistern des Glücks" Kontakt aufnehmen, jedoch meint Janeway, dass sie die Equinox aufspüren müssten. Sie studiert auch seine Dienstakte und erkennt, dass Ransom dazu neigt, sich zu verstecken, wenn er verfolgt wird. Daraufhin lässt sie Chakotay nach einem möglichen Versteck der ''Equinox'' suchen. Als man die ''Equinox'' im Orbit eines Planeten entdeckt, nimmt man ein Außenteam Ransoms gefangen und Janeway lässt anschließend die ''Equinox'' angreifen. Sie können die Waffen der ''Equinox'' ausschalten, jedoch flieht das Schiff durch die Atmosphäre des Planeten und entkommt. Daraufhin verhört Janeway den gefangen genommenen [[Noah Lessing]]. Als dieser ihre Fragen nicht beantworten will, deaktiviert sie die Schilde um den Frachtraum. Als Lessing nicht trotzdem nicht antwortet geht Chakotay mit einem Phaser in den Frachtraum und verschließt den sich öffnenden Spalt. Daraufhin nimmt er Lessing mit und fordert Informationen über die Ankari. Wenig später entbindet sie Chakotay vom Dienst. Anschließend nimmt sie Kontakt mit den Ankari auf. Sie erpresst den Ankari-Captain Kontakt mit den Wesen aufzunehmen, ehe sie sein Schiff freilässt. Daraufhin nimmt Janeway mit Tuvok und dem Ankari im Frachtraum 2 Kontakt mit den Wesen auf. Diese stellen ihre Angriffe auf die ''Voyager'' ein, als Janeway ihnen die ''Equinox ''ausliefert. Man verfolgt diese weiterhin und kann sie zum Kampf stellen. Inzwischen haben die Gewissensbisse Captain Ransom jedoch dazu bewogen, mit Janeway zu kooperieren. Als er sie kontaktiert, glaubt Janeway ihm und lässt die Besatzung der ''Equinox ''an Bord beamen. Jedoch errichtet Burke ein Kraftfeld um die Brücke, weshalb einige Offiziere nicht erfasst werden können. Anschließend bietet sie Ransom an, ihn an Bord zu beamen. Dieser lehnt jedoch ab, da er versucht Distanz zur ''Voyager'' zu gewinnen, um sie nicht zu gefährden. Anschließend rehabilitiert sie Chakotay und setzt Kurs auf die Heimat. Die fünf überlebenden Offiziere der ''Equinox'' degradiert sie zu Crewman und stellt sie bis auf Weiteres unter scharfe Beobachtung. Anschließend spricht sie sich mit Chakotay aus und meint, dass er auch einen Grund gehabt hätte, zu meutern. Da entdeckt sie die heruntergefallene Widmungsplakette der ''Voyager'' und meint, dass sie in all den Schlachten niemals herunterfiel. Chakotay nimmt sie an sich und hängt sie wieder an ihren Platz. ({{VOY|Equinox, Teil II}})
Wenig später dockt das Schiff an einem [[markonianischer Außenposten|markonianischen Außenposten]] an und Janeway stimmt entgegen Tuvoks Bedenken gegenseitigen Besuchen auf den Schiffen zu. ({{VOY|Überlebensinstinkt}})
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