Kurz vor Ende der Besetzung führt Dukat eine Beziehung mit Tora Naprem, aus der seine Tochter Tora Ziyal hervorgeht. Wissend, dass deren Existenz seine Karriere gefährden wird, schickte er beide nach Lissepia, doch ihr Schiff wurde von den Breen angegriffen. Ziyal überlebte und wurde versklavt, bis sie von Dukat und Kira Nerys gerettet wurde. Seine Liebe zu Ziyal ist aber zu groß, um sie zu töten. Er akzeptiert sie als Tochter und wird daraufhin von seiner Familie und der cardassianischen Gesellschaft geächtet ({{DS9|Indiskretion|Zu neuer Würde}}). Den späteren Tod Ziyals kann Dukat nicht verkraften und wird wahnsinnig ({{DS9|Sieg oder Niederlage}}). Als er 2375 die Sekte der Pah-Geister auf Empok Nor anführt, zeugt er ein weiteres Kind mit der Bajoranerin Mika ({{DS9|Entscheidung auf Empok Nor}}).