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→Der Dominion-Konflikt
Als Antwort darauf startet das Dominion sofort eine Invasion des bajoranischen Systems und erobert die Station aufgrund seiner strategischen Position am [[Wurmloch]]. Dies markiert den Beginn des [[Dominion-Krieg]]es. ([[DS9]]: "''[[Zu den Waffen!]]")
Da vor allem die Lage am Wurmloch Deep Space 9 zu einem der bedeutendsten strategischen Punkte des gesamten [[Alpha-Quadrant]]en macht, wird sie stark von vom Dominion verteidigt. Da aber derjenige, der die Station kontrolliert, faktisch auch die Kontrolle über das Wurmloch und die Nachschubwege des Dominion hat, will die Sternenflotte die Station schnellstmöglich wieder zurückerobern.
:''Siehe dazu auch: [[Schlacht um Deep Space 9]]
[[Bild:GalaxyPhaser.jpg|thumb|"[[Operation Rückkehr]]"]]
Wegen der Kämpfe an verschiedenen Fronten ist die [[Sternenflotte]] nich nicht sofort in der Lage einen Gegenangriff zum machenzu starten. Für fünf Monate befindet sich die Station wieder unter dem [[Kommandant|Kommando]] von Gul Dukat und wird wieder in Terok Nor umbenannt. Innerhalb dieser [[Zeit]] verwendet man beträchtliche Ressourcen darauf, das Minenfeld zu deaktivieren. Kurz vor dem Gegenangriff der [[Föderation]] Mitte des Jahres [[2374]] hat man einen Weg gefunden das Feld zu deaktivieren. Im Zuge der "[[Operation Rückkehr]]" kann die [[2. Flotte|2.]] und [[5. Flotte]] der Sternenflotte mit der Unterstützung durch [[Klingone|klingonische]] Verbände die Station und das bajoranische System zurückerobern. Allerdings gelingt es Dukat noch , das Minenfeld zu deaktivieren und es zu zerstören, Captain Sisko kann aber die Wurmlochwesen überzeugen die Dominion-Flotte, die daraufhin durch das Wurmloch kommt, zu vernichten. ([[DS9]]: "''[[Sieg oder Niederlage]]")
Deep Space 9 dient im weiteren Verlauf des Dominion-Krieges als Reparatur- und Versorgungsstation für die Streitkräfte und ist zugleich das Hauptquartier der [[9. Flotte]]. Desweiteren wird die Station für Friedensverhandlungen mit den [[Tzenkethi]] genutzt.
