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Auf dem Planeten Niburu droht ein Vulkan jegliches Leben zu vernichten. Um dieses zu verhindern will die Crew der Enterprise den Vulkan zum erlöschen bringen. Während sich das Schiff mitten in einem Ozean verbirgt, taucht Spock verborgen durch eine Aschewolke in den Vulkan ein um die Lava mittels eines technischen Gerätes zum erstarren zu bringen. Unterdessen müssen James Kirk und Leonard McCoy vor den Einwohnern fliehen, da sie von ihnen als Fremde enttarnt wurden. Sie springen über eine Klippe und tauchen direkt in die Luftschleuße der Enterprise. Auf der Kommandobrücke müssen sie aber erfahren dass sie Spock aufgrund von Störungen die der Vulkan verursacht nicht mehr an Bord holen können. Der einzige Weg wäre mit dem Schiff aufzutauchen und direkt in den Vulkan zu steuern um Spock an Board beamen zu können. Dies würde aber direkt gegen die oberste Direktive verstoßen, da es einen direkten Einfluss auf die Bevölkerung hätte wenn sie ein hochentwickeltes Raumschiff sehen würden. Spock beharrt auf der Einhaltung der obersten Direktive und berkräftigt seine Meinung mit den Worten: "die Bedürfnisse der Vielen sind wichtiger als die Bedürfnisse der Wenigen." Kirk entschließt sich dennoch mit dem Schiff aus dem Wasser aufzutauchen und seinem ersten Offizier das Leben zu retten. Der Plan gelingt: die von Spock entworfene Bombe explodiert, der Vulkan erlischt und Spock kann rechtzeitig herraus gebeamt werden. Das ganze hat jedoch eine dramatische Folge: die technisch komplett unterentwickelten Ureinwohner bekommen die Enterprise zu sehen und verehren sie vortan als Gottheit.

== Der Anschlag ==

Unter der Leitung von Admiral Marcus soll über das Vorgehen nach dem Terroranschlag in London beraten werden. Marcus muss zugeben dass der Attentäter, ein Mann nammes John Harrison, einer der besten Agenten der Sternenflotte war. Kirk meldet sich als erster Offizier unter Christopher Pike zu Wort, da er nicht versteht, warum ein einfaches Archiv zerstört wurde. Als ihm laut der Gedanke kommt, dass das Protokol vorsieht dass sich nach so einem Anschlag alle Offiziere an einem bestimmten Ort treffen sollen, erscheint hinter ihnen ein kleines Schiff und eröffnet das Feuer. Hinter dem Steuer sitz Harrison. Kirk gelingt es das Schiff zum Ansturz zu bringen doch Harrison schafft es sich rechtzeitig wegbeamen zu lassen. Unter den Opfern dieses Anschlages ist auch Admiral Pike. Kurz vor seinem Tod gelingt es Spock noch mittels Gedankenverschmelzung seine letzten Gedanken zu erfahren. Kirk ist schockiert über den Tod seines Mentors und will Rache nehmen. Durch Scotty erfährt er dass sich Harrison mittels der von ihm aufgestellten Transwarpgleichung nach Kronos beamen konnte, der klingonischen Heimatwelt. Kirk bittet Admiral Marcus um die Erlaubnis Harrison zu vefolgen und auszuschalten. Dazu möchte er umbedingt Spock wieder als seinen ersten Offizier haben. Der Admiral gesteht Kirk dass Harrson kein Archiv sondern eine geheime Basis einer Organisation der Sternenflotte namens Sektion 31 zerstört habe. Marcus, der glaubt dass ein Krieg mit den Klingonen überfällig ist, gibt Kirk die Erlaubnis und obendrein noch 72 spezielle Torpedos, mit denen Kirk Harrison vom Planetenorbit aus beschießen soll.

== Die Rache ==

In der Arrestzelle der Enterprise erklärt Harrison dem wütenden Kirk seine Motive: er habe sich ergeben weil es an Board 72 Gründe dafür gebe. Er sei in Wirklichkeit ein genetisch verbesserter Mensch der vor 300 Jahren eingefroren wurde und den Admiral Marcus als Waffe gebrauchen will. Außerdem sei sein Name nicht John Harrison sondern Kahn. Und wenn er wissen wolle, warum er die Föderation angegriffen habe, solle er die Torpedos genauer untersuchen und zusätzlich gibt er ihm Koordinaten in der Nähe des Jupiters. Obwohl er ihm misstraut, will Kirk Antworten haben und schickt Dr. Carol Wallace, die in Wiklichkeit die Tochter von Admiral Marcus ist mit einem dieses Torpedos von Board um ihn zu untersuchen. Dabei kommt herraus dass sich in diesem eine alte Stasiskapsel befindet. Kahn erklärt Kirk dass diese insgesamt 72 Personen seine Mannschaft sind die er beschützen wolle. Der Böse sei nicht er sondern in Wirklichkeit Admiral Marcus. Kirk bittet Scotty über Funk als Freund sich anzusehen, was sich bei den Koordinaten die er von Kahn erhalten hatte befindet. Als Scotty dort ankommt, traut er seinen Augen nicht.

== Der Kampf ums Überleben ==

Kahn: Schon bald schreite ich über ihre kalten Leichen!