Admiral Janeway unterbreitet ihrem jüngeren Ich die Möglichkeit, die Voyager früher als erwartet zurück in den Alpha-Quadranthen Quadranten zu bringen. Capt. Janeway willigt allerdings nicht ein, da sie die Crew nicht in Gefahr bringen möchte. Von Admiral Janeways Shuttle wird die Borg resistente Panzerung adaptiert. Die beiden Janeways entwickeln zusammen mit Seven of Nine einen Virus, der den Großteil der Borg vernichten soll. Mit Hilfe der Panzerung gelingt es der Voyager durch den Nebel, bis hin zu dem Transwarp-Tor HUB zu gelangen. währenddessen befindet sich Admiral Janeway mit ihrem Shuttle auf dem Weg zum Unikomplex. Sie unterbreitet der Borg-Queen einen Deal, bei dem die Voyager freien Flug durch das Transwarp-Netzwerk hat. Kaum die Schwelle überquert werden sie von einer Spähre verfolgt. Die Voyager kann zwar eine Sub-Kreuzung zerstören doch sie droht mit dem Transwarp-Tunnel zu kolabieren. Admiral Janeway wird von der Borg-Queen assimiliert und setzt somit das Virus frei. Viele Borg werden vernichtet und die Voyager gelangt in den Alpha-Quadranthen, wo sie von einer Flotte unter dem Kommando von Admiral Paris begrüsst werden. Seit dem steht die Voyager auf der Erde und dient als Museum. Janeway wurde zum Admiral befördert und hat einen Gastauftritt in Star Trek: Nemesis. Dort erteilt sie J.-L. Picard den Auftrag in den romulanischen Teil der neutralen Zone zu fliegen und Friedensverhandlungen mit den Romulanern führen soll.