Der Maquis ist eine Organisation, die 2367 von ehemaligen Kolonisten der Föderation und einigen Bajoranern gegründet wurde. Sie richtete sich gegen die Föderation und die Cardassianische Union. Der Maquis verübte Anschläge auf das cardassianische Militär und auch die Zivilbevölkerung.
Der Maquis wurde zu Beginn des Dominion Krieges restlos vernichtet.
Das Wort Maquis kommt aus dem französischen und bezeichnet den undurchdringlichen Buschwald in den Mittelmeerländern. Dort haben sich traditionell Banditen und Gesetzlosen versteckt. Daher wird Maquis häufig als Synonym für Untergrundbewegung verwendet.