[[Captain]] [[Kathryn Janeway|Janeway]] ist auf dem Holodeck mit einer Figur des [[Leonardo da Vinci]]. Sie bittet ihm ihn, um eine Ecke zu zum arbeiten, doch er ist nicht begeistert darüber – er ziehe die Einsamkeit vor. Als sie sich über das Fliegen unterhalten und Captain Janeway eine gute Idee hat bekommt sie doch den Platz in seinem Atelier. Doch dann Sie wird sie in den [[Maschinenraum]] gerufen. Dort angekommen berichtet [[Lieutenant]] [[B'Elanna Torres]], dass eine [[Sonde|Erkundungssonde]], die vor ein paar Monaten zur Erkundung der Region gestartet wurde, kein Signal mehr [[Kommunikation|sendet]]. Sie versucht, die letzten gesendeten Daten zu rekonstruieren. Es gelingt ihr auch. Ihr und Captain Janeway, die mittlerweile in den Maschinenraum gekommen ist, stockt der Atem als sie die letzten Aufzeichnungen sehen: Ein Borg-Kubus füllt plötzlich das Bild. Die Sonde wurde von den Borg an Bord [[Beamen|gebeamt]] und anschließend assimiliert.

Janeway ordnet eine [[Offizier]]sbesprechung an und schildert den übrigen Offizieren die Situation. Sie müssen den Borgraum durchfliegen. Er ist mehrere tausend [[Lichtjahr]]e groß, bewacht von Millionen von Borg-SchiffenKuben. Die Durchreise könnte Monate, sogar Jahre dauern, vorausgesetzt die [[USS Voyager|''Voyager'']] wird während des Durchfluges nicht von den Borg assimiliert.

Unterdessen fängt [[Kes]] an, verstärkte [[Telepathie|telepathische]] Kräfte zu entwickeln. Sie ist wird auch von [[Vision]]en geplagt: Visionen , die [[Tod|tote]] Borg zeigen und der die Zerstörung der ''Voyager''. Tuvok kümmert sich um sie und versucht ihr zu helfen. Captain Janeway möchte , dass er sie im Auge behält.

Die ''Voyager'' fliegt eine Weile unbehelligt in Richtung der Nordwest-Passage, als die Sensoren plötzlich erhöhte Transwarpaktivitäten anzeigen. Die gesamte [[Brückenoffizier|Brückenbesatzung]] ist geschockt , als Harry Kim vermeldet, dass sich 15 Borg-Kuben der ''Voyager'' nähern. Das Schiff geht aufgrund von [[Subraumverzerrung]]en unter [[Warp]], die Borg-Kuben ebenfalls, als sie die ''Voyager'' überholt haben. Ein Kubus trennt sich von der Gruppe und [[scan]]nt die ''Voyager''. Janeway ahnt Schlimmes, doch der Kubus lässt nach kurzer Zeit von ihr ab und schließt sich der Gruppe wieder an, welche daraufhin wieder auf Warp geht. Die Crew der ''Voyager'' ist ratlos über das merkwürdige Verhalten der Borg, setzt aber ihre Reise fort.

Captain Janeway versucht sich in ihrem [[Bereitschaftsraum]] Tipps von anderen [[Sternenflotte]]ncaptains zu holen. Sie liest bei [[Jean-Luc Picard]] und [[Amasov]] nach und zitiert [[Chakotay]] daraus. Dieser muss lächeln, da sie die Captains ganz gut imitiert hat. Captain Janeway macht sich klar, dass dieser Tag kommen musste. Und sie fragt sich, ab wann das Risiko zu groß. Sollen sie sich zurückziehen in den Raum von Freunden und sich im [[Delta-Quadrant]]en ansiedeln? Würde die Crew das akzeptieren? Chakotay sicher sichert ihr zu, dass sie alle hinter ihr stehen würden, wenn es so weit kommen würde.

Einige Zeit später meldet Fähnrich Kim, dass die Signaturen der 15 Borgschiffe erloschen sind. Captain Janeway nimmt Kurs darauf und sie finden ein einziges Trümmerfeld, das von den 15 Kuben übrig ist. Auch werden unbekannte [[Energiesignatur]]en von Waffen gefunden. Ratlosigkeit wirft sich auf: Wer vermag 15 Borg-Kuben auf einen Schlag zu vernichten? Harry Kim [[Hoffnung|hofft]] , dass sie eventuell einen Verbündeten in diesen Gegnern der Borg finden können. Doch Chakotay dämpft die Erwartung. Harry Kim entdeckt ein weiteres Objekt: Ein Schiffhaftet an der Außenhülle eines Borg-Kubus. Es scheint vollständig [[Biologie|organisch]] zu sein. Dieses Ding ist nicht weder wegzubeamen, noch mit dem [[Traktorstrahl]] zu erfassen. Doch in einem einer der Kuben scheint noch eine [[Atmosphäre]] zu haben, weshalb Captain Janeway beschließt, ein [[Außenteam]] auf das Schiff zu beamen, um herauszufinden, was passiert ist. Chakotay, [[Tuvok]] und Harry Kim beamen auf das Schiff.

Unterdessen liegt Harry Kim in der [[Krankenstation]]. Die fremde Spezies hat ihn mit einem [[Virus]] infiziert, die seine [[DNS]] zerstört. Er wird quasi von innen zerfressen. Kurze Zeit später kommt Janeway und befragt den Doktor nach der Lage. Er arbeitet an einer Methode , mit Hilfe modifizierter Borg-[[Nanosonde]]n, die das [[Immunsystem]] der fremden [[Spezies]] nicht als Fremdkörper erkennt, die Infektion zu besiegen. Es wird aber mehrere Tage dauern, so viele Nanosonden herzustellen. Captain Janeway erteilt Harry den Befehl durch zu haltendurchzuhalten.

Im Maschinenraum werten sie die Daten aus, die sie auf dem Kubus sammeln konnten. Die Lebensform, der das Außenteam begegnet sind, gehört zu einer Spezies, die von den Borg als [[Spezies 8472]] bezeichnet werden. Die Borg sind im letzten Monat bereit bereits 12 Mal von ihnen angegriffen und jedes mal Mal wurden die beteiligten Borg-Schiffe komplett zerstört. Da die Borg technischen Fortschritt nicht durch Forschung, sondern durch Assimilation erreichen, können sie sich nicht an die Waffen und [[Schutzschild|Schilde]] von Spezies 8472 anpassen; sie sind daher vollkommen schutzlos ausgeliefert.

Chakotay fragt, woher die Spezies kommt. B'Elanna hat festgestellt, dass Spezies 8472 durch eine Quantensingularitäten Quantensingularität in der Nordwest-Passage in den Borgraum gelangen. Die ''Voyager'' hat die Passage fast erreicht: Hunderte Bioschiffe strömen von dort aus in den Borgraum.

Kes hat erneut eine Vision. Spezies 8472 scheint telepatische telepathische Fähigkeiten zu haben und [[Kommunikation|kommuniziert]] mit Kes. Ihr wird gesagt, dass die gesamte [[Galaxis]] von den schwachen Lebewesen gesäubert werden muss. Sie redet mit dem Captain darüber. Ihr wird klar, dass die [[Invasion]] auf die Borg nur der Anfang ist. Der Weg durch die Nordwest-Passage steht außer Frage, dies würde den sicheren [[Tod]] bedeuten. Andererseits bedeutet ein anderer der andere Weg durch den Borg-Raum die Assimilation. Die ''Voyager'' steht vor einer misslichen Lage.

Am nächsten Morgen treffen sich die Brückenoffiziere zu einer Besprechung. Janeway hat einen Plan: Eine [[Allianz]] mit den Borg. Die Nanosonden wurden hinreichend modifiziert, dass Harry Kim geheilt werden konnte. Deshalb können sie auch als Waffe benutzt werden. Nach einer Debatte beendet Janeway die Besprechung. Chakotay ist strikt dagegen, was er ihr nach der offiziellen Besprechung noch einmal sagt: Mit den Borg kann man nicht verhandeln. Er erzählt ihr eine [[Story|Geschichte]]: Ein [[Skorpion]] will über den [[Fluss]] und bittet einen Fuchs ihn hinüberzutragen. Aber der Fuchs ist nicht bereit, denn er will nicht gestochen werden. Der Skorpion gibt zu bedenken, dass er doch auch sterben würde, wenn er ihn auf dem Fluss stechen würde. Das sieht der Fuchs ein und nimmt ihn auf dem Rücken. In der Mitte des Flusses sticht der Skorpion zu. Als der Fuchs langsam sinkt fragt er nach, warum der Skorpion dies getan hat und er sagt ganz einfach, es : "Es ist meine Natur. " Captain Janeway gibt zu, dass es Risiken gibt, aber sie ist bereit es diese einzugehen. Chakotay plädiert dafür umzukehren. Es folgt ein Streitgespräch und Chakotay wirft Janeway vor, dass sie ihr Wunsch nach Haus zu kommen sie blind macht und sie manchmal nicht weiß, wann es besser ist zurückzustecken. Da fragt sie ihn nach seinem [[Vertrauen]] in sie, denn das sei die entscheidende Frage. Er gibt an ihre Befehle zu befolgen, aber er kann ihrer Meinung nicht zustimmen. Captain Janeway lässt ihn wegtreten.