{{Siehe auch|Logbuch der USS Enterprise (NCC-1701-D)}}

[[Datei:Kampfbrücke im Jahr 2364.jpg|thumb|Picard bereitet sich auf das Eintreffen von Q vor.]]

Wenig später begibt sich die ''Enterprise'' auf ihre erste Mission, die [[Raumbasis]] [[Farpoint-Station]] zu überprüfen. Auf Farpoint-Station befinden sich auch weitere Offiziere, welche auf die ''Enterprise'' versetzt werden, darunter auch der [[Erster Offizier|Erste Offizier]] [[Commander]] [[William T. Riker]] und die [[Chefarzt|Chefärztin]] [[Doktor]] [[Beverly Crusher]]. Auf den Weg dorthin wird die ''Enterprise'' von einer Art Netz eingehüllt und ein Fremder, welcher sich [[Q]] nennt, erscheint auf der [[Brücke]]. Q hält den Menschen vor, sie seien eine barbarische [[Spezies|Rasse]] und er verbietet diesen weitere Reisen durchs All. Als Q sich von [[Lieutenant]] [[Torres (Lieutenant)|Torres]] bedroht fühlt, friert er diesen ein und Torres muss auf die [[Krankenstation]] gebracht werden. Da Q der ''Enterprise'' überlegen ist, versucht Picard diesen abzulenken. Picard fügt sich zum Schein Q und flieht mit der ''Enterprise''. Da die ''Enterprise'' Q nicht entkommen kann, befiehlt Picard die [[Autoseparation]] der Untertassensektion. Q überträgt [[Worf]] das Kommando über die Untertassensektion. Die Untertassensektion kann darauf entkommen, allerdings fängt Q die [[Kampfsektion]] der ''Enterprise'' wieder ab und die [[Brückenoffizier|Brückenbesatzung]] befindet sich plötzlich in einem [[Gericht]]ssaal des Jahres [[2079]], in der [[Postatomare Schreckenszeit|postatomaren Schreckenszeit]]. Q klagt die Brückenoffiziere wieder wegen der Barbarei der Menschen an. Picard setzt sich für die Menschen ein und will beweisen, dass die Menschen sich im Laufe der Zeit gebessert haben. Als Test von Q bekommt Picard das Rätsel von Farpoint-Station zu lösen. Darauf kehren die Offiziere auf die Kampfbrücke zurück. Als die Antriebssektion der ''Enterprise'' [[Deneb IV]] erreicht, wo sich Farpoint-Station befindet, beamt Riker sich an Bord und nimmt dort seinen Posten ein. Picard zeigt Riker Aufnahmen der Ereignisse der letzten Stunden. Nachdem Riker die Aufnahmen gesehen hat, lässt Picard Riker die Antriebssektion manuell an die [[Untertassensektion]] ankoppeln. Nachdem Riker dies erfolgreich gemeistert hat, begrüßt Picard diesen und heißt ihn auf der ''Enterprise'' willkommen. Im Orbit befindet sich zu dieser Zeit die [[USS Hood (Excelsior-Klasse)|USS ''Hood'']]. Zu dieser Zeit besichtigt Admiral [[Leonard McCoy]] die Krankenstation der ''Enterprise''. [[Data]] führt ihn dabei auf dem Schiff herum und bringt ihn dann mit einem [[Shuttle]] zurück zur ''Hood''. Zur selben Zeit gibt Q Picard eine Frist von 24 Stunden, das Geheimnis von Farpoint zu lösen. ({{TNG|Der Mächtige}})

Ende des Jahres findet die ''Enterprise'', während Picard sich auf einer Außenmission befindet, die alte [[SS Birdseye|SS ''Birdseye'']]. Data bittet diesen erkunden zu dürfen und Riker gewährt ihn diese Bitte. Darauf beamen Data und Worf an Bord der ''Birdseye'' und finden dort mehre Menschen aus dem [[20. Jahrhundert]] in [[Stasis]]. Data bringt die drei Überlebenden [[Clare Raymond]], [[L.Q. Clemonds]] und [[Ralph Offenhouse]] an Bord der ''Enterprise'' und diese werden dort wieder erweckt. Crusher behandelt auch die Krankheiten an denen die Drei ursprünglich verstorben sind. Als Picard später davon erfährt, ist er zuerst verärgert über das Verhalten von Data, doch Data erklärt, dass es in seiner Verantwortung gelegen hat, diese zu retten. Darauf bekommt Data den Auftrag sich um die Drei zu kümmern. Zur gleichen Zeit untersucht die ''Enterprise'' in der [[Romulanische Neutrale Zone|Neutralen Zone]] das Verschwinden einiger [[Außenposten]]. Anfangs werden die [[Romulaner]] für dieses Angriffs verdächtigt. Wenig später enttarnt sich ein [[~/Raumschiff/TNG/1x26/1|romulanischer Warbird]] und nimmt Kontakt mit der ''Enterprise'' auf. Auch romulanische Außenposten wurden zerstört und [[Commander]] [[Tebok]] weiß aber nicht wer dafür verantwortlich ist. Beide Fraktionen einigen sich auf einen Informationsaustausch über den fremden Angreifer, aber Tebok gibt Picard zu verstehen, dass diese wieder ein Machtfaktor in dieser Region sind. Nach diesen Ereignissen kehren Raymond, Clemonds und Offenhouse auf die Erde zurück. ({{TNG|Die neutrale Zone}})

[[Datei:Excelsior-Klasse neben Enterprise-D.jpg|thumb|left|Die ''Enterprise'' trifft auf die ''Repulse''.]]

Anfang [[2365]] gibt es einige Änderungen bei den Führungsoffizieren. Crusher wird zum Leiter der [[Medizinisches Corps der Sternenflotte|medizinischen Abteilung]] ernannt und verlässt die ''Enterprise''. La Forge wird neuer Chefingenieur und Worf übernimmt nun dauerhaft den Posten als Sicherheitschef. In dieser Zeit trifft sich die ''Enterprise'' mit der [[USS Repulse|USS ''Repulse'']], da von dort aus Doktor [[Katherine Pulaski]] an Bord kommt und den Posten als Chefärztin übernimmt. Wenig später transportiert die ''Enterprise'' den gefährlichen Erreger der [[Plasmaseuche]]. La Forge kümmert sich gemeinsam mit Lieutenant Commander [[Hester Dealt]] um den Transport des Erregers und beide über die Behälter, in dem der Erreger gelagert wird. Zur selben Zeit wird Troi auf mysteriöse Weise [[Schwangerschaft|schwanger]]. Nach einer extrem kurzen Schwangerschaft kommt das Kind auf die Welt und Troi gibt ihm den Namen [[Ian Andrew Troi II|Ian Andrew]]. Doch das Kind beginnt mit rapider Geschwindigkeit zu wachsen. Zur selben Zeit beginnen sich die Erreger plötzlich zu vermehren. La Forge und Dealt stellen fest, dass [[Eichner-Strahlung]] für die Vermehrung des Erregers verantwortlich ist. Es stellt sich heraus, dass das fremde Wesen, welches durch Troi geboren geworden ist, für die Vermehrung der Erreger verantwortlich ist. Der Junge verlässt seine körperliche Form und wird wieder zu einem Energiewesen, welches die ''Enterprise'' verlässt. Nachdem das Wesen verschwunden ist, normalisiert sich die Situation wieder und die ''Enterprise'' bringt schließlich den Erreger zur [[Forschungsstation Tango Sierra]]. ({{TNG|Das Kind}})

Daraufhin kam es im [[Orbit]] von [[Veridian III]] schließlich zu einem Kampf gegen einen [[Klingonischer Bird-of-Prey|klingonischen Bird-of-Prey]]. Durch den von Dr. Soran manipulierten [[VISOR]] gelang es den Klingonen, die [[Schildfrequenz]] der ''Enterprise'' in Erfahrung zu bringen. Dadurch war man nun in der Lage, der ''Enterprise'' im Kampf schwere Schäden zuzufügen. Dennoch konnte sich die ''Galaxy''-Klasse im Kampf behaupten und zerstörte das klingonische [[Kriegsschiff]] durch Zuhilfenahme einer von Commander Riker eingesetzten Strategie. Da die ''Enterprise'' schwer beschädigt war, stand ein unmittelbarer [[Warpkernbruch]] bevor. Der [[Liste von Crewmitgliedern der USS Enterprise (NCC-1701-D)|Crew]] blieb keine andere Wahl, als die [[Antriebssektion]] zu evakuieren und zu versuchen, sich in Sicherheit zu bringen. Durch die anschließende [[Druckwelle]] der Explosion erlitt die Untertassensektion nicht nur schwere Schäden, sondern wurde infolge dessen manövrierunfähig und konnte dadurch nicht mehr der Anziehungskraft von Veridian III entkommen. Es blieb keine andere Möglichkeit als eine Notlandung zu versuchen. Letztlich konnte sie sicher und mit nur minimalen Verlusten gelandet werden. Aber aufgrund der schweren strukturellen Schäden sah man von einer Bergung des Schiffes ab. Alle noch brauchbaren Ausrüstungsgegenstände wurden geborgen und so ging die Ära des bedeutsamsten [[Raumschiff]]es der Sternenflotte zu Ende ({{Film|7}}). Daraufhin wurde kurze [[Zeit]] später die neue [[USS Enterprise (NCC-1701-E)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-E)]] der [[Sovereign-Klasse|''Sovereign''-Klasse]] gebaut und in Dienst gestellt.

In den [[2370er]], während die [[USS Quito|USS ''Quito'']] bei [[Deep Space 9]] befindet, berichtet [[Ensign]] [[Angie]] [[Beckett Mariner]], dass Data zu seiner Zeit an Bord der ''Enterprise'', einen bösen Zwilling gehabt hat und das dieser mit den Borg zusammen gearbeitet hat. Mariner ist geschockt, als sie dies erfährt. ({{LDS|Mondtrümmer und Liebesleid}})