Hat der Spieler bei der Manipulation des Simulators die richtige Entscheidung getroffen, so reagieren die klingonischen Schiffe auf die Rufe der ''Ranger''. Der klingonische [[Commander]] Duk'Ret von der ''Tarqat'' beschuldigt den Spieler die neutrale Zone verletzt zu haben. Nachdem der Spieler (David Forrester) sich vorstellt und seine Rettungsmission erklärt, erklärt Duk'Ret voller Ehrfurcht, er würde sich Freuen, bei der Rettungsmission zu helfen. Anschließend kann die ''Kobayashi Maru'' in den [[Traktorstrahl]] genommen werden, und nach Gamma III gebracht werden. Hat der Spieler den Simulator nicht manipuliert oder die falsche Entscheidung getroffen so kann er nichts unternehmen um nicht von den Klingonen vernichtet zu werden. Weder das System verlassen, noch die klingonischen Schiffe besiegen. [[Datei:Kobayashi Maru zerstört.gif|thumb|left|Die Vernichtung der ''Kobayashi Maru'']]Es ist möglich vor dem Eintreffen in das System alle Energie auf die Schilde, den Antrieb und den Traktorstrahl zu legen um dann, sofort nach der Ankunft zur ''Kobayashi Maru'' zu fliegen und diese in den Traktorstrahl zu nehmen. In diesem Fall beginnt eine Videosequenz in der die Klingonen den Tanker vernichten.