Einige Monate später stellt der [[Obsidianischer Orden|Obsidianische Orden]] zusammen mit dem [[Tal Shiar]] eine [[Cardassianisch-romulanische Flotte|vereinte Flotte]] auf, um einen Präventivschlag gegen die [[Heimatwelt der Gründer]] durchzuführen. [[Commander]] [[Benjamin Sisko]] übermittelt diesen Vorfall der Sternenflotte und will darauf mit der ''Defiant'' in den [[Gamma-Quadrant]]en fliegen und der Flotte folgen, da Odo und Garak Gefangene an Bord der Flotte sind. Doch [[Admiral]] [[Toddman]] verbietet Sisko in den Gamma-Quadranten zu fliegen. Trotz des Verbotes tut Sisko es dennoch. Doch Eddington Allerdings [[Sabotage|sabotiert]] Eddington auf direkten [[Befehl]] von Admiral Toddman die ''Defiant'', um diese an einer Verfolgung zu hindern. Die Durch die Sabotage fällt die [[Tarnvorrichtung]] fällt aus und Sisko muss seine Mission vorerst abbrechen. Eddington gibt darauf seine Sabotage zu und erklärt auch seine [[Motiv]]e. Sisko will Eddington in sein [[Quartier]] sperren lassen, doch Eddington [[Versprechen|verspricht]] keine Sabotage mehr durchzuführen und Sisko lässt Eddington seine Arbeit fortsetzen. Die romulanische-cardassianische Flotte wird wenig später bei der [[Schlacht im Omarion-Nebel]] vernichtet, doch es gelingt der ''Defiant'' Odo und Garak zu retten. Darauf fliegt die ''Defiant'' zurück in den Alpha-Quadranten. ({{DS9|Der geheimnisvolle Garak, Teil II}})

Ende des Jahres nimmt Eddington an der [[Feier]] zur [[Beförderung]] von [[Captain]] Sisko teil. Als es zu einem angeblichen [[Putsch]] auf der [[Tzenkethi]]-[[Heimatwelt]] kommt, fliegt die ''Defiant'' in diesen [[Sektor]], um die [[Kolonie]]n der Föderation vor einen möglichen Angriff der Tzenkethi zu schützen. Eddington nimmt an dieser [[Mission]] an Bord der ''Defiant'' teil und bekommt den Auftrag, [[Botschafter]] [[Krajensky]] zu schützen. Einige Zeit später sieht es so aus, als haben hätten die Tzenkethi eine Kolonie der Föderation angegriffen und ein [[Krieg]] droht. Zur selben Zeit kommt es zu Systemausfällen an Bord der ''Defiant'' und Sisko vermutet einen Saboteur an Bord des Schiffes. Eddington bietet sofort an, zusammen mit Odo nach dem Saboteur zu suchen. Doch Sisko und [[Jadzia Dax]] finden einen anderen Weg, den Saboteur zu enttarnen, und es stellt sich heraus, dass Krajensky in Wirklichkeit ein Gründer ist. Der Gründer versucht einen Krieg zwischen der Föderation und den Tzenkethi auszulösen, damit das Dominion es so leichter hat, den Alpha-Quadranten zu erobern. Eddington und seine Sicherheitsleute versuchen den flüchtigen Gründer zu finden. Während der Suche nach dem flüchtigen [[Krajensky (Gründer)|Wechselbalg]] bilden Eddington und Odo ein Team, um diesen schnell aufzuspüren. Doch inzwischen gelingt es dem Wechselbalg, [[Doktor]] [[Julian Bashir]] in ein Quartier zu sperren, und er sabotiert in dessen Gestalt einen [[Bluttest]] von Eddington und lässt es so aussehen, als sei Eddington der Gründer. Doch als der echte Bashir gefunden wird, flieht der Gründer wieder und Eddington wird wieder freigelassen. Am Ende gelingt es Odo den Gründer aufzuhalten, indem er ihn tötet. [[Chief]] [[Miles O'Brien]] gelingt es daraufhin, die Sabotage des Gründers zu beseitigen und die ''Defiant'' kehrt in den [[Föderationsraum]] zurück. Dadurch bleibt der Frieden zwischen der Föderation und den Tzenkethi erhalten. ({{DS9|Der Widersacher}})

[[2372]] wollen einige [[Wissenschaftler]] vom [[Wissenschaftsministerium der Trill]] ein künstliches [[Wurmloch]] erzeugen und die Sternenflotte stellt dafür die ''Defiant'' zur Verfügung. Die ersten Tests verlaufen erfolgreich und Eddington überwacht diese Mission vom [[Maschinenraum]] aus. Beim zweiten Testlauf kommt es zu einem [[Unfall]] und das künstliche Wurmloch kollabiert und durch die [[Druckwelle]] wird die ''Defiant'' schwer beschädigt. Im Maschinenraum bricht ein [[Plasmafeuer]] aus und dadurch wird Eddington [[Verletzung|verletzt]]. Die Wissenschaftlerin [[Lenara Kahn]] wird von dem Feuer eingeschlossen und Eddington weiß noch nicht einmal, ob sie noch am Leben ist. Da das [[Feuer]] den [[Warpkern]] bedroht, will Eddington eine Luke öffnen, damit das Feuer in den [[Weltraum]] entweichen kann, doch dies würde Kahn töten. [[Jadzia Dax]] beschließt über ein [[Kraftfeld]] zu Kahn zu gelangen und Eddington versucht das Kraftfeld so lange wie möglich stabil zu halten. Das Kraftfeld bricht kurz darauf zusammen, doch Dax kann Kahn gerade so noch in Sicherheit bringen, während es Eddington gelingt das Feuer zu löschen. ({{DS9|Wiedervereinigt}})

Wenige Wochen später kehren die Führungsoffiziere von einer [[Konferenz]] zurück, allerdings wird ihr [[Runabout]] [[USS Orinoco|USS ''Orinoco'']] von einer cardassianischen Gruppe, welche sich [[Der wahre Weg]] nennt, sabotiert. Wenig später explodiert das Runabout, allerdings gelingt es Sisko, Kira, [[Worf]], Dax und O'Brien sich von Bord zu beamen. Durch die Explosion werden die Muster der Offiziere in den [[Computer]] der Station integriert und im [[Musterpuffer]] der Station gespeichert. Da sich dort die Muster schnell zersetzen, werden die Musterdaten, auf Befehl von Eddington, im Computer der Station integriert und so gelangen die Daten auch in Bashirs [[Holoprogramm|Holosuiteprogramm]]. Eddington informiert Bashir darauf daraufhin über die aktuelle Lage und dass er das Programm weiter laufen lassen muss, damit die Muster der Personen nicht verloren gehen. Bashir ist nun gezwungen, das Programm durchzuspielen, um seine Freunde zu retten. Inzwischen versuchen Eddington und Odo einen Weg zu finden, die Muster der Offiziere aus der Holosuite zu bekommen. Odo und Eddington versuchen mit der Hilfe von [[Rom]] die Muster aus dem Holosuiteprogramm zu bekommen. Rom gelingt es den Transporter der ''Defiant'' mit der Holosuite zu verbinden und die Muster werden schließlich von Odo und Eddington heraus gebeamt. ({{DS9|Unser Mann Bashir}})

Während seiner Zeit bei der Sternenflotte wird Eddington Mitglied einer Widerstandszelle des [[Maquis]] in der [[Entmilitarisierte Zone|Demilitarisierten Zone]], wobei er zunächst seine Position als Sternenflottenoffizier ausnutzt und auf der Raumstation bleibt. Eddington nutzt seine Position als Sicherheitschef aus, um den Maquis mit Informationen zu versorgen. Zu der Zeit beliefert die Föderation zwölf [[Industriereplikator|Industriereplikatoren]] an die [[Cardassianer]] und der [[Konvoi]] passiert auch Deep Space 9. Gleichzeitig [[Verdacht|verdächtigen]] Odo und Eddington [[Kasidy Yates]], die Freundin von Sisko, dass diese für den Maquis arbeitet. Sisko bittet die beiden, dass diese ein Auge auf Yates halten, um zu sehen, ob sich dieser Verdacht bestätigt. Die ''Defiant'' folgt unter dem Kommando von Worf der [[Xhosa|''Xhosa'']] in die [[Badlands]] und dort trifft sich Yates mit einem Maquis-Schiff. Nach diesen Ereignissen schlagen Odo und Eddington Sisko vor, Yates [[Verhaftung|verhaften]] zu lassen. Eddington schlägt vor sich persönlich um die Überwachung der Replikatoren zu kümmern, während Sisko persönlich mit der ''Defiant'' in die Badlands fliegt. Sisko überwacht die ''Xhosa'', aber diesmal erscheint kein Maquis-Schiff. Die ''Defiant'' wartet fünf Stunden und schließlich enttarnt sich man sich und Sisko stellt Yates zur Rede. Sisko und Odo verhaften darauf Yates, da diese Güter für den Maquis geliefert hat und Yates erklärt Sisko, dass sie den Auftrag gehabt hat in den Badlands zu warten. Zur selben Zeit stiehlt Eddington die Industriereplikatoren und setzt dabei Kira außer Gefecht. Eddington übergibt die Replikatoren dem Maquis und taucht unter. Sisko und Odo tun alles, um ihn zu finden, doch sie sind dabei erfolglos. Eddington sendet Sisko eine Botschaft, in der er seine Motive erklärt. Doch Sisko setzt nun alles daran, den [[Verräter]] auf zu spüren aufzuspüren und zu verhaften. ({{DS9|In eigener Sache}})

Als Mitte des Jahres Sisko unerlaubt mit der ''Defiant'' in den Gamma-Quadranten fliegt, sabotiert Eddington im Auftrag von Admiral Toddman die ''Defiant''. Sisko will Eddington darauf in sein Quartier sperren, doch Eddington erwidert, er habe nur Befehlen gefolgt und werde keine weiteren Sabotagen durch führendurchführen. ({{DS9|Der geheimnisvolle Garak, Teil II}})

Während Eddington auf der Station dient , lädt Sisko ihn mehrmals zum Abendessen, darunter zum [[Thanksgiving]], ein. Die beiden verbringen sogar einen Abend in der [[Holosuite]] und schauen sich ein [[Baseball]]spiel an. ({{DS9|Für die Uniform|Glanz des Ruhms}})

Als Eddington 2372 die Sternenflotte verrät und zum Maquis [[Überläufer|überläuft]], nimmt Sisko dies sehr persönlich. Sisko schwört sich alles daran zu setzten Eddington auf zu spüren aufzuspüren und zu verhaften. ({{DS9|In eigener Sache}})

[[Calvin Hudson]] ist ein ehemaliger Offizier der Sternenflotte, welcher zu zum Maquis übergelaufen ist. Wie Eddington ist Hudson gut mit Sisko befreundet, doch nachdem Hudson zum Maquis übergelaufen ist , zerbricht die Freundschaft zwischen Sisko und Hudson. Beim Maquis unterhalten sich Hudson und Eddington viel über Sisko. Allerdings kommt Hudson 2373 bei einem Kampf gegen die Cardassianer ums Leben. ({{DS9|Glanz des Ruhms}})

;T'Rul:Danke , ich kenn all ihre Namen und ich bin nicht hier um Freundschaften zu schließen.

}} (|quelle={{DS9|Die Suche, Teil I}})}}

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}} (|quelle={{DS9|Für die Uniform}})}}

;Eddington:Das hätte nicht passieren dürfen, wir waren dabei zu siegen. Das Cardassianische cardassianische Reich fing an ins Chaos zu stürzen. Die Maquiskolonien hatten vor sich zu einer unabhängigen Nation zu erklären.;Sisko:Eddington , hören Sie mir zu. Das ist nicht der richtige Zeitpunkt.

;Eddington:Ist das alles , was sie Sie interessiert, die Raketen , mehr nicht?;Sisko:Wir können diesen Leuten nicht mehr helfen, es ist zu spät. Aber wenn wir es nicht schaffen diese Raketen aufzuhalten, wird das nur der Anfang sein.;Eddington:Ich war ihr Anführer, ich war für sie verantwortlich und habe sie im Stich gelassen. Ich habe sie alle im Stich gelassen.

}} (|quelle={{DS9|Glanz des Ruhms}})}}

}} (|quelle={{DS9|Glanz des Ruhms}})}}

;Sisko:Er starb für das , woran er glaubte. Ich habe ihn als Verräter bezeichnet, aber in gewisser weise Weise war er der loyalste Mann , den ich je kannte. Er war ein Maquis und das bis zum bitteren Ende.}} (|quelle={{DS9|Glanz des Ruhms}})}}

{{HGI|Michael Eddington wurde von [[Kenneth Marshall]] gespielt und .}} {{HGI|Michael Eddington wurde von [[Dieter MemelWalter Alich]] [[Liste von Synchronsprechern|synchronisiert]] (nur .}} {{HGI|In den Folgen {{DS9e|Die Suche, Teil I}} und {{e|Die Suche, Teil II}}) sowie wurde Eddington von [[Walter AlichDieter Memel]] [[Liste von Synchronsprechern|synchronisiert]].}}