Als Chakotay, Kim und Tuvok auf dem [[Holodeck]] von einer unbekannten [[Photon]]ischen [[Energie]]quelle selbst in Energie umgewandelt worden sind, schickt Janeway den Doktor auf das Holodeck, um die drei zu retten. Auf dem Holodeck läuft das Programm über die Legende von [[Beowulf]]. Zu der Zeit legt sich der Doktor auch einen Namen zu und nennt sich fortan Schweitzer. In dem Programm trifft er auf die [[Schildjungfer]] [[Freya]], welche ihn zum [[König]] [[Hrothgar]] führt. Dort allerdings fordert [[Unferth]] den Doktor zum Kampf heraus. Der Doktor ist allerdings im Kampf unter legen. Da der Doktor aber seine Materie nun Kontrollieren lassen kann, durch dringt das Schwert von Unferth den Doktor ohne das dem Doktor etwas geschietgeschieht. Darauf hat der Doktor den Respekt des Königs bekommen und überall wird Schweitzer verehrt. Frey Freya beginnt darauf Interesse an dem mutigen Held Schweitzer zu zeigen und beginnt ihn zu [[Kuss|küssen]]. Der Doktor wartet auf die Photonische Energie, welche im Holoprogramm als [[Ungeheuer]] [[Grendel]] dargestellt wird. Plötzlich greift diese den Doktor an und dieser kann mit einem Nottransport auf die Krankenstation gebeamt werden, allerdings fehlt ihn ein Arm. Der Doktor bekommt einen neuen Arm. Inzwischen findet Janeway heraus, dass es sich bei dieser Photonischen Energie um eine Lebensform handelt. Da die ''Voyager'' bereits eine Probe gesammelt hat, bekommt der Doktor den Auftrag auf dem Holodeck diese Energieprobe an Grendel zurück zu bringen, damit Chakotay, Kim und Tuvok wieder frei gelassen werden. Auf dem Holodeck wird der Doktor wieder von Unferth angegriffen, doch Freya verteidigt den Doktor. Dabei wird Freya von Unferth getötet. Der Doktor kehrt aufs Schloss zurück und es gelingt ihm Grendel die Energieprobe zu übergeben. Darauf gibt das Energiewesen, Chakotay, Kim und Tuvok wieder frei. Der Doktor bekommt nach dieser Mission ein Lob vom Captain, welcher auch ins [[Logbuch]] eingetragen wird. Nach diesen Ereignissen nennt sich der Doktor nicht mehr Schweitzer, da ihn dieser Name zu sehr an den Verlust von Freya erinnert. ({{VOY|Helden und Dämonen}})

Der Doktor nimmt an der Geburtstagsparty von Kes auf dem Holodeck teil. Doch während der Feier flirtet sehr zum Leidwesen des Doktors [[Sandrine]] mit ihm und der Doktor versucht sich ihr immer wieder zu entziehen. Zu der Zeit gerät die ''Voyager'' in einen [[Verzerrungsring]], welcher die ''Voyager'' in ein [[Labyrinth]] verwandelt. Die Offiziere wollen sich auf ihre Posten begeben, doch diese Verlaufen sich an Bord. Auch der Doktor versucht sich auf die Krankenstation zu transferieren doch dies klappt nicht und Sandrine macht sich darauf wieder an den Doktor ran. Doch nach dem sich der Doktor heftig gestritten hat, gibt Sandrine ihre Flirtversuche Flirt versuche schließlich auf. Währenddessen gerät Janeway in Kontakt mit dem Verzerrungsring und verliert ihr Bewusstsein. Der Doktor versucht sie darauf zu behandeln. Zur gleichen Zeit wird die komplette ''Voyager'' von den Ring verschlungen. Durch den Verzerrungsring findet ein Datenaustausch statt. Nachdem die ''Voyager'' den Verzerrungsring verlassen hat, wird der ursprüngliche Zustand wieder hergestellt. ({{VOY|Die Raumverzerrung}})

Einige Zeit später tauchen 2 fremde Wesen an Bord der ''Voyager'' auf und einer von ihnen entführt Chakotay. Der andere wird von Tuvok betäubt. Der Doktor untersucht den Fremden und findet viele gemeinsame Merkmale in der DNS zwischen den Menschen und dieser fremden Spezies heraus. Auf dem Holodeck versuchen der Doktor und Janeway gemeinsamkeiten Gemeinsamkeiten zwischen beide zu finden und sie entdecken, dass dieser Fremde von den [[Dinosaurier]]n auf der Erde abstammt. Später versuchen Professor [[Forra Gegen]] vor der [[Regent]]in [[Odala]] zu Beweisen, dass die [[Voth]] von der Erde abstammen. Doch die Regentin hält an dem [[Doktrin]] der Voth fest und zwingt Gegen dazu seine Theorie zu wiederrufenwiderrufen, später kehrt Chakotay auf die ''Voyager'' zurück. ({{VOY|Herkunft aus der Ferne}})

Als ein Fremder plötzlich auf der ''Voyager'' auftaucht, wird dieser auf die Krankenstation gebracht und der Doktor untersucht den Fremden, welcher keine Ahnung hat, wie er auf die ''Voyager'' gelangt ist. Zur gleichen Zeit wie der Fremde aufgetaucht ist, verschwindet Kes. Mit der Zeit verschwinden immer mehr Crewmitglieder und immer mehr Fremde tauchen auf. Die Fremden beginnen die ''Voyager'' zu übernehmen und bevor Chakotay als letztes von Bord verschwindet, lädet lädt dieser das Programm des Doktors in den Mobilen Emitter, damit die Fremden sein Programm nicht löschen. Chakotay und der Doktor gelangen auf ein [[Biosphärenschiff]] der [[Nyrianer]] und sind dort mit der übrigen Besatzung gefangene der Nyrianer. Die Crew sitzt dort in einer Art Holodeck der Nyrianer fest, doch damit diese den Ausgang finden, wird der Doktor umprogrammiert, damit er den Ausgang finden kann. Während der Programmierung unterhalten sich Torres und Paris über ihre Beziehung und der Doktor mischt sich ständig ein. Als es Torres zu viel wird, stellt sie den Doktor kurzzeitig auf Stumm. Später gelingt es mit Hilfe des Doktor der Crew aus ihrem holograpfischen holografischen Gefängnis zu entkommen und die Kontrolle über das Biosphärenschiff zu erlangen. Kurz darauf gelingt es Janeway mit Hilfe des [[Translokator]]s die Kontrolle über die ''Voyager'' wieder zu übernehmen. ({{VOY|Translokalisation}})

Als ein verletzter Hiroge auf seinem Schiff von einem Außenteam der ''Voyager'' geborgen wird, wird dieser sofort auf die Krankenstation der ''Voyager'' gebracht. Der Doktor behandelt den verletzten, aber er warnt ihn, dass er ein Hologramm ist und nicht von den Hirogen angegriffen werden kann. Der Hiroge hat zu der Zeit ein Mitglied von Spezies 8472 gejagt, welches sich nun ebenfalls an Bord der ''Voyager'' befindet. Der Doktor untersucht später das verletzte Mitglied von Spezies 8472, kann allerdings nicht viel für dieses tun. Als weitere Hirogen auftauchen, beamt Seven of Nine den Hirogen und das Mitglied von Spezies 8472 zu den anderen Hirogen. Zu der Zeit beginnt der Doktor mit Seven of Nine ein soziales Training, damit sie sich besser in die Crew intigrieren intrigieren kann. Seven of Nine gefallen die Übungen zu beginn überhaupt nicht, aber sie übt weiterhin mit dem Doktor. ({{VOY|Die Beute}})

Nachdem Seven of Nine den Händler [[Kovin]] verletzt hat, behandelt der Doktor diesen. Später unterhält sich der Doktor mit Seven of Nine über ihr Verhalten, als diese sich plötzlich beginnt seltsam ängstlich zu verhalten. Der Doktor versucht mit einer Therapie die Erinnerungen von Seven of Nine zu erforschen, um heraus zu finden warum sich diese so ängstlich verhält. Bei diesen Erinnerungen erfährt der Doktor, dass Seven of Nine von Kovin entführt worden ist und ihr von ihm Borg-Technologie entwendet wurde. Der Doktor berichtet Captain Janeway von Seven of Nines Erinnerungen im Bezug auf Kovin. Janeway beginnt basierend auf Seven of Nines Erinnerungen gegen Kovin zu ermitteln. Doch Kovin beteuert seine Unschuld, doch als die Indizien gegen ihn sprechen, flieht Kovin. Bei späteren Ermittlungen stellt sich jedoch heraus, dass Kovin die Wahrheit gesagt hat und das die Erinnerungen von Seven of Nine fehlerhaft sind. Als man dies Kovin mitteilen will, glaubt dieser der ''Voyager'' Crew nicht. Mit seinem Schiff greift Kovin die ''Voyager'' an, doch dabei überladen sich die Waffen von Kovins Schiff und dieses explodiert. Der Doktor macht sich darauf schwere Vorwürfe, da er mit für den Tod von Kovin verantwortlich ist. Er bittet sogar Captain Janeway ihn auf seine ursprüngliche Programmierung zurück zu setzten, damit so etwas niemals wieder geschietgeschieht, doch Janeway verweigert dem Doktor seine Bitte, da dieser so aus seinen Fehlern lernen kann. ({{VOY|Im Rückblick}})

Während die ''Voyager'' weiter zum Alpha-Quadranten fliegt, empfängt das Schiff plötzlich eine seltsame Botaschaft Botschaft mit dem Symbol Omega. Die Sensoren der ''Voyager'' haben das [[Omega-Molekül]] entdeckt und Janeway muss die [[Omega-Direktive]] ausführen. Janeway hat den Auftrag, da dieses Molekül zu gefährlich ist, dieses zu vernichten. Da sie dies nicht allein Bewältigen kann, informiert Janeway ihre Führungsoffiziere, darunter auch den Doktor über die aktuelle Situation. Janeway gelingt es mit ihren Führungsoffizieren schließlich die lokalisierten Omega-Moleküle zu vernichten. ({{VOY|Die Omega Direktive}})

Wenige Wochen später kommt die [[Ramura]] [[Kellin (Ramuranerin)|Kellin]] an Bord der ''Voyager''. Sie behauptet, dass sie vor ein paar Wochen bereits auf der ''Voyager'' gewesen ist und mit Chakotay sogar eine Beziehung gehabt hat. Der Doktor untersucht sie darauf, kann aber nichts an ihr feststellen, da der Tricorder ihren Körper nicht scannen kann. Doch Kellin gelingt es ihre Behauptung zu Beweisen und sie bittet Captain Janeway um Asyl, da sie auf der Flucht vor ihrem Volk ist. Doch Kellin wird aufgespührt aufgespürt und ihre Erinnerungen an die ''Voyager'' werden gelöscht und der Doktor kann nichts für sie tun. Auch die Crew verliert kurz darauf sämtliche Erinnerungen über die Ramura und setzt ihre Reise fort. ({{VOY|Unvergessen}})

Als die [[Deuterium]]vorräte der ''Voyager'' aufgebraucht sind und die Energie knapp wird, werden Notmaßnahmen getroffen, um Energie zu sparen. Die Crew muss ihre Quartier verlassen und ins Kasino umsiedeln. Doch Neelix will sich nicht dorthin umsiedeln lassen und macht es sich stattdessen mit einigen Crewmitgliedern auf der Krankenstation gemütlich. Der Doktor protestiert dagegen, da er sich in seiner Privatsphäre verletzt fühlt, doch Chakotay stellt ihn vor die Wahl, entwerder entweder er lässt Neelix und die anderen auf der Krankenstation bleiben oder er wird einfach deaktiviert. Zur selben Zeit befindet sich die ''Voyager'' im Orbit eines [[Y-Klasse]] Planeten. Auf der Oberfläche versuchen Paris und Kim Deuterium zu finden, doch als der Kontakt zu den beiden abbricht ist Janeway gezwungen die ''Voyager'' auf der Oberfläche zu landen. Zur gleichen Zeit hat Neelix schwierigkeiten Schwierigkeiten auf der Krankenstation zu leben, da der Doktor nachts laut singt. Als Neelix droht mit zu singen, gibt der Doktor nach und lässt die anderen in Ruhe schlafen. Währenddessen findet ein Außenteam Paris und Kim und bringt die beiden auf die Krankenstation. Der Doktor ist froh, da er nun Patienten hat, endlich Neelix und die anderen von seiner Krankenstation zu vertreiben. Als der Doktor Paris und Kim untersucht, stellt dieser fest das die beiden vom Planeten umgewandelt worden sind und nur die Atmosphäre des Planten atmen könnnenkönnen. Doch später stellt sich heraus, dass es sich um [[Silberblut]]-Duplikate von Kim und Paris handelt. Der echte Paris und Kim werden gefunden und werden auf die Krankenstation gebracht. Die ''Voyager'' bekommt das Deuterium im Austausch, dass das Silberblut die Crew duplizieren darf. ({{VOY|Dämon}})

[[Datei:Voyager Stasiskammern.jpg|thumb|left|Der Doktor und Seven of Nine überwachen die sich in Stasis befindene befindende Crew.]]

Einige Zeit später erreicht die ''Voyager'' einen [[Mutara-Klasse-Nebel]]. Als das Schiff in den Nebel hineinfliegt hinein fliegt erleidet die Crew schwere Verbrennungen und die ''Voyager'' verlässt darauf den Nebel. Da das Umfliegen des Nebels über ein Jahr dauert, wird die gesamte Crew mit Ausnahme vom Doktor und Seven of Nine, welche gegen die Auswirkungen des Nebels immun sind, in [[Stasis]] versetzt. Die beiden überwachen während des einmonatigen Fluges durch den Nebel die ''Voyager'' und die in Stasis schlafende Crew. Doch während dieser Zeit geraten der Doktor und Seven of Nine häufig in Streitereien. Doch mit der Zeit fällt durch den Nebel auch die Technologie aus und nach dem Ausfall des mobilen Emitters sitzt der Doktor wieder auf der Krankenstation fest. Inzwischen spührt spürt auch Seven of Nine an den Auswirkungen des Nebels, sie leidet unter HaluzinationenHalluzinationen. Schließlich fällt das Programm des Doktors vollständig aus und Seven of Nine ist gezwungen die ''Voyager'' allein durch den Nebel zu fliegen. Doch schließlich gelingt ihr das und die Crew wird aus der Stasis erweckt. ({{VOY|Eine}})

Der Doktor begleitet ein Außenteam in einem Shuttle, welches die Entstehung eines [[Protonebel]]s beobachten wollen. Der Doktor möchte unbedingt mit seiner Holokammara einige Bilder machen. Doch durch die Ausdehnung des Nebels droht das Shuttle zu explodieren und das Außenteam. Beim beamen gelangen einige Nanosonden in den Mobilen Emitter des Doktors und dieser wird beschädigt. Der Doktor ist wieder auf der Krankenstation und er bittet, dass Torres seinen Emitter so schnell wie möglich repariert. Doch durch die Nanosonden und der DNS von Fähnrich [[Mulcahey]] entwickelt sich eine Borgdrohne mit der Technologie aus dem 29. Jahrhundert. Der Borg nennt sich [[Erster (Borg)|Erster]] und Seven of Nine kümmert sich um den Borg. Bei einer Untersuchung stellt der Doktor fest, dass sein Emitter nicht mehr von dem Borg entfernt werden kann. Doch schon bald wird das [[Borg-Kollektiv]] auf den jungen Borg aufmerksam und will diesen in das Kollektiv einfügen. Doch der junge Borg opfert sich und beamt auf die [[Borg-Sphäre]] und fliegt mit dieser in den Protonebel. Dabei wird die Sphäre vernichtet und der junge Borg wird dabei schwer verletzt. Der Borg wird darauf auf die Krankenstation gebeamt, doch als der Doktor diesen behandeln will, aktiviert Erster ein kraftfeldKraftfeld. Der Borg will sterben, da ansonsten die ''Voyager'' ständig von den Borg angegriffen wird. Nach dem Tod des Borgs bekommt der Doktor seinen Emitter wieder. ({{VOY|Die Drohne}})

Auf einer [[Terrasphäre 8|Raumstation]] findetet findet ein Außenteam eine Simulation der [[Akademie der Sternenflotte]] vor. Das Außenteam nimmt einen dieser Menschen mit und als der Doktor diesen auf der Krankenstation untersuchen will, bringt sich dieser um. Der Doktor untersucht den Leichnam und findet heraus, dass es sich bei diesem um ein Mitglied von Spezies 8472 handelt. Janeway befürchtet darauf darauf eine Invasion von Spezies 8472 auf die Erde. Der Doktor beginnt darauf mit Seven of nine Nine Nanosonden zu produzieren, um Spezies 8472 zu bekämpfen. Trotzdem hofft der Doktor, dass die Nanosonden nicht eingesetzt werden. Später gelingt es Janeway einen Waffenstillstand mit Spezies 8472 auszuhandeln. ({{VOY|In Fleisch und Blut}})

Der Doktor kümmert sich kurzzeitig um Naomi Wildman, als ihre Mutter kurzeitig kurzzeitig vermisst wurden ist. Der Doktor versucht sie in dieser Zeit abzulenken und erklärt ihr den Aufbau der [[Zelle (Biologie)|Zelle]]. ({{VOY|Es war einmal}})

Kurze Zeit später beginnt Seven of Nine verschiedene Persönlichkeiten anzunehmen und der Doktor untersucht das seltsame Verhalten von Seven of Nine. Mit der Zeit übernehmen aus dem [[Hive-Bewusstsein]] stammenden Persönlichkeiten immer mehr die Kontrolle über den Körper von Seven of Nine. Der Doktor tut zwar alles was er kann, aber ihm gelingt es nicht diese Persönlichkeitsstörung zu behandeln. Inzwischen findet die Voyager in der nähe eine Trümmerfeldes ein [[Vinculum|Borg-Vinculum]], welches für die Persönlichkeitsstörungen von Seven of Nine verantwortlich ist. Die deaktivierung Deaktivierung des Vinculums scheitert und Seven of Nine übernimmt immer mehr Persönlichkeiten. Tuvok schlägt schließlich vor Seven of Nine mit einer Geistesverschmelzung zu helfen, allerdings ist der Doktor gegen diesen Vorschlag. Da dem Doktor keine andere Möglichkeit einfällt Seven of Nine zu retten, stimmt er Tuvoks Vorschlag wiederwillig zu. Tuvok verbindet seinen Geist und nimmt Kontakt mit Seven of Nine auf. Inzwischen gelingt es Torres das Vinculum zu deaktivieren und darauf erhält Seven of Nine wieder die Kontrolle über ihre Persönlichkeit wieder. ({{VOY|Das Vinculum}})

Einige Zeit später wird Torres von einer fremden Lebensform angegriffen, welche sich dann mit Torres Körper verbindet. Der Doktor findet keine Möglichkeiten beide wieder voneinander zu trennen. Da der Doktor Hilfe von einen Experten in [[Xenobiologie]] benötigt, durchsucht der Doktor einen Experten in der Datenbank, welcher das nötige Fachwissen hat. Darauf erscheint ein Hologramm des Cardassianers [[Crell Moset]]. Beide versuchen darauf einen Weg zu finden, Torres und das fremde Wesen voneinander zu trennen ohne beide zu töten. Bei weiteren Arbeiten erkennt der Bajoraner [[Tabor]] Crell Moset, als den Massenmörder der medizinische und Folterexperimente an Bajoranen Bajoranern durchgeführt hat. Der Doktor steht nun vor einem moralischen Konflikt, da er das Fachwissen von Moset benötigt, obwohl das Wissen durch den Tod unschuldiger Bajoraner erlangt hat. Der Doktor stellt später das Hologramm von Moset zur Rede, doch das Hologramm erklärt er sei nur ein Hologramm, was mit den Taten des echten Moset nichts zu tun hat. Währenddessen weigert sich Torres von Moset behandeln zu lassen, da sie weiß, dass er ein Massenmörder ist. Später entscheidet Captain Janeway um Torres zu retten, dass der Doktor weiter mit Moset zusammen arbeiten darf, obwohl sie weiß, dass es moralisch Falsch und gegen den Willen von Torres ist. Dem Doktor gelingt es zusammen mit Moset Torres von dieser Kreatur zu befreien. Später wird das Wesen zu seinen Artgenossen zurück gebeamt. Nach der Operation löscht der Doktor vollständig das Programm von Moset. ({{VOY|Inhumane Praktiken}})

Bei der jährlichen Untersuchung, welche der Doktor nun mit der Holokammara, stellt der Doktor fest, dass dieser an Harry Kim eine Operation durchgeführt hat, an die er sich nict nicht erinnern kann. Auch Kim kann sich nicht an diese Operation erinnern. Der Doktor meldet dies später Captain Janeway, aber die hat momentan keine Zeit. Später bittet er Seven of Nine, dass sie ihm hilft heraus zu finden wer Kim operiert hat. Als sich Seven of Nine später beim Doktor meldet, kann sich dieser nicht erinnern sie um so etwas gebeten zu haben. Seven of Nine findet heraus, dass die Erinnerungen vom Doktor gelöscht worden sind. Bei weiteren Untersuchungen finden die beiden heraus, dass die Erinnerungen des Doktors welche vor 18 Monaten statt gefunden manipuliert worden sind. Seven of Nine gelingt es teilweise die Erinnerungen wieder herzustellen und der Doktor beginnt sich an einen unbekannten Fähnrich und einer fremden Spezies zu erinnern. Darauf teilt der Doktor dies Janeway und Tuvok mit, die beiden versprechen das sie sich darum kümmern werden und der Doktor soll sich auf die Krankenstation begeben. Da der Doktor wieder fürchtet, dass seine Erinnerungen gelöscht werden speichert er diese heimlich und er aktiviert die Holokammara, damit er herausfindet wer dafür verantwortlich ist. Nachdem der Doktor sich wieder aktiviert bemerkt der Doktor das seine Erinnerungen wieder gelöscht worden sind, doch diese aktivieren sich wieder und anhand des geschossenen Fotos erkennt der Doktor, dass Janeway seine Erinnerungen gelöscht hat. Der Doktor stellt darauf den Captain zu Rede, doch Janeway erklärt das dies zum Wohle des Doktors geschietgeschieht. Der Doktor soll sich wieder auf die Krankenstation begeben, um dort wieder umprogrammiert zu werden. Der Doktor versteht nicht warum die anderen Crewmitglieder ihm das antun. Doch Seven of Nine setzt sich bei Janeway für den Doktor ein, dass dieser nicht umprogrammiert wird. Janeway erklärt darauf dem Doktor, dass er sich vor 18 Monaten bei einer Operation zwischen der Rettung von Harry Kim und Ahni Jetal entscheiden mußtemusste. Kim hat die Operation überlebt, aber Jetal ist gestorben und der Doktor hat sich schwere vorwürfe gemacht und sein Programm geriet sogar in eine Feedback-Schleife und nur eine Löschung des Erinnerung konnte ihn damals retten. Doch nachdem der Doktor die Wahrheit erfahren gerät sein Programm wieder in die selbe Feedback-Schleife. Doch nach einen weiteren Gespräch mit Seven of Nine ist Janeway dafür, dass der Doktor seine damalige Entscheidung verarbeiten kann. In den nächsten zwei Wochen ist immer ein Crewmitglied in der Nähe des Doktors, welche ihm hilft diese Erinnerung und die Feedback-Schleife zu verarbeiten, um auch so den Doktor zu helfen sich weiter zu entwickeln. ({{VOY|Verborgene Bilder}})

Wenige Wochen später entdeckt die ''Voyager'' ein Wurmloch, welches direkt zur Erde zurück führt. Doch als Seven of Nine von eine Außenmission zurückkehrt, bemerkt sie das seltsame Verhalten der Crew und berichtet dies dem Doktor. Der Doktor will darauf die Crew untersuchen, doch er wird deaktiviert, da sein Programm im Wurmloch beschädigt werden könnte. Auch Seven of Nine wird außer Gefecht gesetzt und die ''Voyager'' fliegt in das scheinbare Wurmloch. In Wirklichkeit handelt es sich bei dem Wurmloch um eine [[Telepathische Werferpflanze]], welche sich von der Energie der ''Voyager'' und ihrer Crew ernähren will. Während sich die Crew in dieser Werferpflanze befindet, verliert die gesamte Besatzung ihr Bewusstsein. Nur Naomi Wildman bleibt bei Bewusstsen Bewusstsein und hilft Seven of Nine wieder zu sich zu kommen und diese aktiviert darauf dem Doktor. In der Telepathischen Werferpflanze befindet sich ein weiteres Schiff mit einem Fremden namens [[Qatai]] und beide Schiffe versuche aus dem Schlund der Werferpflanze zu entkommen. Qatai will die Werferpflanze töten, doch der Doktor streubt sträubt sich dagegen, da er gegen das töten dieser Kreatur ist. Doch beiden Schiffen gelingt es mit Energieausstößen zu entkommen und die Werferpflanze speit beide Schiffe wieder aus. ({{VOY|Euphorie}})

Nachdem die ''Voyager'' eine [[Borg-Sonde]] vernichtet hat, beamt die Beatzung die [[Trümmer]] an Bord. Der Doktor ist sehr begeistert, als dieser in den Trümmern einige medizinische Komponenten entdeckt. Zu der Zeit beschließt Captain Janeway von den Borg eine [[Transwarpspule]] zu stehlen, damit die ''Voyager'' mit dieser Technologie schneller zurück in den Alpha-Quadrant reisen kann. Doch bei dem Diebstahl der Transwarpspule bleibt Seven of Nine auf dem Borgschiff zurück und kehrt zum [[Borg-Kollektiv]] zurück. Janeway plant eine Rettungsmission und lässt die gestohlene Transwarpspule in den [[Delta Flyer|''Delta Flyer'']] installieren. Der Doktor soll diese Rettungsmission begleiten, da er sich um den medizinischen Zustand von Seven of Nine kümmern soll. Der ''Flyer'' fliegt durch einen [[Transwarpkanal]] zum [[Unikomplex]] der Borg. Doch das Programm des Doktors scheint den Flug durch den Transwarpkanal nicht richtig zu vertragen und dieser wird [[Raumkrankheit|Raumkrank]]. Später gelingt es Janeway Seven of Nine aus der Gewalt der Borg zu befreien und der Doktor stellt die volle Gesundheit an ihr fest. Später kehrt der ''Flyer'' zur ''Voyager'' zurück und mit der Transwarpspule gelingt es der ''Voyager'' 20.000 Lichtjahre näher an den Alpha-Quadrant hinzugelangenhinzu gelangen. ({{VOY|Das ungewisse Dunkel, Teil I|Das ungewisse Dunkel, Teil II}}) [[Datei:Der Doktor führt Seven of Nine aus.jpg|thumb|left|Der Doktor führt Seven of Nine aus.]]

Wenige Wochen später gerät die ''Voyager'' in den [[Chaosraum]] und ist darin gefangen. Zu dieser Zeit leidet Commander Chakotay und Halluzinationen und Wahnvorstellungen und der Doktor versucht ihn darauf zu behandeln. Doch in Wirklichkeit versuchen die [[Chaoswesen|Wesen, welche im Chaosraum leben]] Kontakt mit Chakotay aufzunehmen. Chakotay lässt dies schließlich zu, auch wenn er Angst hat davn davon Wahnsinnig zu werden. Der Doktor überwacht Chakotay während dieser Zeit. Die Chaoswesen zeigen schließlich Chakotay eine Möglichkeit den Chaosraum zu verlassen und schließlich gelingt dies der ''Voyager'' auch. ({{VOY|Der Fight}}) Während die ''Voyager'' von den [[Hazari]] verfolgt wird, bitte die [[Denkfabrik]] Hilfe bei diesem Problem an. Doch sie fordern als Preis Seven of Nine im Austausch für die Rettung der ''Voyager''. Doch der Doktor findet mit heraus, dass die Denkfabrik die Hazari angeheuert hat, um die ''Voyager'' zu verfolgen. Schließlich gelingt es Janeway sich mit den Hazari zu verbünden, um die Denkfabrik aufzuspüren. ({{VOY|Die Denkfabrik}})  [[Datei:Kim und der Doktor untersuchen die Bombe.jpg|thumb|Harry Kim und der Doktor untersuchen die Bombe.]]

Während Einige Zeit später entdeckt die ''Voyager'' von den [[Hazari]] verfolgt wirdeinen Malon-Frachter, bitte die [[Denkfabrik]] Hilfe bei diesem Problem welcher kurz vor der Explosion steht. Die Überlebenden Malon werden an. Doch sie fordern als Preis Secen of Nine im Austausch für die Rettung Bord der ''Voyager''. Doch gebeamt und der Doktor findet mit heraus, dass behandelt die Denkfabrik Verletzten. Später beamt ein Außenteam auf den Frachter um dort die Hazari angeheuert hatExplosion zu Verhindern, um da ansonsten die ''Voyager'' zu verfolgenThetastrahlung, welche ei der Explosion austritt den ganzen Sektor verstrahlen würde. Schließlich gelingt es Janeway sich mit den Hazari zu verbündenwird der Frachter in einen Stern der [[Spektralklasse O]], um welcher die Denkfabrik aufzuspührenThetastrahlung mit adsorbiert. Nach dieser Mission wird das Außenteam vom Doktor behandelt und diese entspannen sich von der harten Mission. ({{VOY|Die DenkfabrikVerheerende Gewalt}})

Einige Zeit später entdeckt die ''Voyager'' einen Malon-Frachter, welcher kurz vor der Explosion steht. Die Überlebenden Malon werden Kurz darauf beginnt Seven of Nine Interesse an Bord der Voyager gebeamt romantischen Beziehungen zu zeigen und der Doktor behandelt die Verletztenbeginnt sie über Romantik zu unterrichten. Später beamt ein Außenteam Der Doktor übt mit Seven of Nine Verabredungen auf den Frachter um dort die Explosion dem Holodeck, doch diese scheitert zu Verhindernbeginn. Als Tom Paris dies mitbekommt, da ansonsten die Thetastrahlungwettet er mit dem Doktor, welche ei der Explosion austritt den ganzen Sektor verstrahlen dass Seven of Nine niemals eine Verabredung zustanden bringen würde. Schließlich wird Paris wettet, falls er verliert macht er einen Monat [[Doppelschicht]]en auf der Frachter in Krankenstation, ansonsten bekommt er einen Stern Monat frei und der Doktor geht darauf ein. Als Seven of Nine eine Verabredung mit [[Spektralklasse OWilliam Chapman]]hat, sieht sich der Doktor schon als Sieger dieser Wette, doch die ganze Verabredung läuft schief und Chapman wird sogar von Seven of Nine bei der Verabredung verletzt und muss auf die Krankenstation. Darauf beschließt der Doktor selbst mit Seven of Nine auszugehen, welcher um die Thetastrahlung Wette mit asorbiertParis doch zu gewinnen. Nach dieser Mission wird das Außenteam vom Als Paris sieht, dass der Doktor es doch geschafft mit Seven of Nine auszugehen, gesteht er ein, dass er die Wette verloren hat. Als dies Seven of Nine mitbekommt, dass sie ein Wetteinsatz gewesen ist, ist diese sehr über den Doktor verärgert. Später entschuldigt sich der Doktor behandelt bei Seven of Nine und diese entspannen nimmt die Entschuldigung an, doch der Doktor merkt, dass sich von dieser in Seven of Nine verliebt hat. Doch Seven of Nine macht dem Doktor schnell klar, dass sie momentan kein Interesse mehr an romantischen Beziehungen hat und der harten MissionDoktor muss dies schweren Herzens hinnehmen. ({{VOY|Verheerende GewaltLiebe inmitten der Sterne}})

Kurz darauf beginnt Seven of Nine Intresse an romantischen Beziehungen zu zeigen Als die Führungsoffiziere über ihre Familien und der Doktor beginnt sie über Romantik zu unterrichten. Der Doktor übt mit Seven of Nine Verabredungenauf dem HolodeckVorfahren sprechen, doch diese scheitert zu beginn. Als scherzt Tom Paris dies mitbekommt, wettet er mit dem Doktor, dass Seven of Nine niemals eine Verabredung zustanden bringen würde. Paris wettet, falls er verliert macht er einen Monat [[Doppelschicht]]en auf der Krankenstation, ansonsten bekommt er einen Monat frei über die Verwandtschaft des Doktors und der Doktor geht darauf ein. Als Seven of Nine eine Verabredung mit bezeichnet diese als [[William Chapmanrasieren|Rasierer]] hat, sieht sich der Doktor schon als Sieger dieser Wette, doch die ganze Verabredung läuft schief und Chapman wird sogar von Seven of Nine bei der Verabredung verletzt und muss auf die Krankenstation. Darauf beschließt der Doktor selbst mit Seven of Nine auszugehen, um die Wette mit Paris doch zu gewinnen. Als Paris sieht, dass der Doktor es doch geschafft mit Seven of Nine auszugehen, gesteht er ein, dass er die Wette verloren hat. Als dies Seven of Nine mitbekommt, dass sie ein Wetteinsatz gewesen ist, ist diese sehr über den Doktor verärgert. Später entschuldigt sich der Doktor bei Seven of Nine und diese nimmt die Entschuldigung an, doch der Doktor merkt, dass sich dieser in Seven of Nine verliebt hat. Doch Seven of Nine macht dem Doktor schnell klar, dass sie momentan kein Intresse mehr an romantischen Beziehungen hat und der Doktor muss dies schweren herzens hinnehmen. ({{VOY|Liebe inmitten der Sterne23 Uhr 59}})

Als Einige Wochen später empfängt die Führungsoffiziere über ihre Familien ''Voyager'' einen Notruf und Vorfahren sprechenein Außenteam, scherzt Tom Paris über welches von Kim geführt wird, beamt auf die Verwandtschaft des Doktors Oberfläche. Der Doktor beamt begleitet Kim bei dieser Außenmission und diese finden einen empfindungsfähigen Flugkörper. Der Doktor ist begeistert auf eine empfindungsfähige künstliche Intelligenz zu treffen und bezeichnet der Doktor setzt sich dafür ein, dass diese als mit auf die ''Voyager'' gebeamt wird. An Bord der Voyager stellt sich jedoch heraus, dass es sich bei diesem Flugkörper um eine [[rasieren|RasierSerie-5 taktische Langstrecken-Waffeneinheit]]handelt, trotzdem setzt sich der Doktor weiter für die künstliche Intelligenz ein und Torres und Kim wollen diese Waffe auf der Krankenstation entschärfen. Bei der Entschärfung wollen die beide die Waffe deaktivieren, doch diese wehrt sich und übernimmt das holographische Programm des Doktors. Die Waffe droht die ''Voyager'' zu vernichten, wenn die Crew nicht seine Bedingungen erfüllt. Später kann Kim die Bombe davon überzeugen, dass die Krieg für welche diese programmiert ist bereits beendet ist und die Bombe gibt darauf den Doktor wieder frei. Die Bombe opfert sich, um zu verhindern, dass weitere Bomben ein planetares Ziel angreifen. Nach dieser Mission macht sich der Doktor schwere Vorwürfe, da er sich für die Bombe eingesetzt und diese an Bord der ''Voyager'' gebracht hat. ({{VOY|23 Uhr 59Geheimnisvolle Intelligenz}})

Während einer Außenmission auf [[~/Planet/VOY/6x12/1|Planeten|Kelemanes Planet]], dessen Zeit etwa 85.000 mal so schnell voranschreitet wie die der [[Erde]], hat er einen Sohn mit Namen [[Jason Tabreez]]. ({{VOY|Es geschah in einem Augenblick}})

Als Captain Janeway den Doktor umprogrammieren will, da sich sein Programm in einer Feedback-Schleife befindet, setzt sich Seven of Nine für den Doktor ein. Sie macht Janeway klar, dass der Doktor nicht einfach nur ein Computerprogramm ist, sonderen sondern eine eigenständige Persönlichkeit. ({{VOY|Verborgene Bilder}})

2375 zeigt Seven of Nine Intresse Interesse an romantische Beziehungen. Der Doktor beginnt darauf sie in diesem bezug Bezug zu unterrichten. Der Doktor wettet sogar mit Tom Paris, dass sie in der Lage ist eine Veraredung Verabredung durchzuführen. Doch nachdem die erste Verabredung mit Lieutenant Chapman in einem Desaster endet, beschließt der Doktor mit Seven of Nine auszugehen. Während dieser Zusammenareit Zusammenarbeit mit Seven of Nine beginnt sich der Doktor in sie zu verlieben. Doch Seven of Nine macht dem Doktor schnell klar, dass sie momentan kein Intresse Interesse mehr an romantischen Beziehungen hat und der Doktor muss dies schweren herzens Herzens hinnehmen. ({{VOY|Liebe inmitten der Sterne}})

Als der Doktor mit seiner Kammara den Maschinenraum fotographiren will, nervt dieser Torres damit so sehr, dass Torres seine Kammara nimmt und zerstört. Später entschuldigt sich Torres beim Doktor und replizirt repliziert ihm eine neue Kammara. ({{VOY|Verheerende Gewalt}})

Als die ''Voyager'' versucht mit Hilfe des Quanten-Slipstream-Antrieb zurück in den Alpha-Quadrant zu fliegen, kommt es zu einer Katastrophe. Die ''Voyager'' wird aus dem Quanten-Slipstream geschleudert und stürzt auf einen Eisplaneten und wird unter Meterdicken Eisschichten begraben. Nur Chakotay und Kim, welche mit dem ''Delta Flyer'' vor der ''Voyager'' fliegen, gelingt die Rückkehr zur Erde. Die beiden machen sich Vorwürfe, dass sie als einzige den Flug überlebt haben und jahre Jahre später planen diese die Zeitlnie Zeitlinie zu verändern. [[2390]] stehlen die beiden den ''Delta Flyer'' und einen [[Temporaler Borg-Transmitter|Temporalen Borg-Transmitter]], mit diesen wollen diese eine Botschaft durch die Zeit schicken. Chakotay und Kim gelingt es die ''Voyager'' zu bergen und beamen den mobilen Emitter des Doktors an Bord des ''Delta Flyers''. Der Doktor erfährt von Kim und Chakotay was mit der ''Voyager'' geschehen ist und das die beiden die Geschichte ändern wollen. Der Doktor soll mit Hilfe von Seven of Nines [[Neuraler Transceiver|Neuralen Transceiver]] eine Botschaft in die Vergangenheit schicken. Währenddessen taucht die [[USS Challenger (NCC-71099)|USS ''Challenger'']] unter dem Kommando von Captain [[Geordi La Forge]] auf und fordert Chakotay auf sein Vorhaben zu beenden. Als Chakotay sich weigert, erklärt La Forge, dass er diesen Aufhalten muss die Vergangenheit zu verändern. Kim schickt zu der Zeit eine Botschaft in die Vergangenheit, aber es passiert nichts und Kim rastet darauf aus. Dem Doktor gelingt es Kim zu beruhigen und Kim versucht eine weitere Botschaft in die Vergangenheit zu schicken, welche die Vergangenheit ändern soll. Durch das Eingreifen der ''Challenger'' droht auf dem ''Delta Flyer'' ein Warpkernbruch und die Energie fällt aus. Der Doktor deaktiviert sich und Kim verwendet die Energie des mobilen Emitters, um die Botschaft in die Vergangenheit zu schicken. Kurz bevor der Flyer explodiert hat Kim Erfolg und die Geschichte wird verändert. ({{VOY|Temporale Paradoxie}})