Einige Monate später entdeckt die ''Enterprise'' eine [[Zeitkapsel (31. Jahrhundert)|Kapsel]] unbekannter Bauart. Die Kapsel wird an Bord des Schiffes gebracht. An der Kapsel und dem Leichnam des unbekannten Piloten werden umfangreiche Untersuchungen durchgeführt. Mit Hilfe der Daten aus Daniels zurückgelassener temporaler [[Bibliothek]] aus dem [[31. Jahrhundert]] wird die wahre Herkunft dieser Kapsel klar. Auch die [[Suliban]] und die [[Tholianer]] zeigen großes Interesse an dem [[Raumschiff]]. Sie greifen die ''Enterprise'' an, um das Raumschiff zu stehlen.

Um zu beweisen, dass die Xindi von den Sphärenbauern getäuscht wurden, reist Daniels zusammen mit Archer in das 26. Jahrhundert. Daniels zeigt Archer die [[Schlacht von Procyon V]], in der die Föderation, deren Mitglied die Xindi inzwischen sind, gegen die Sphärenbauer kämpft. Daniels gibt Archer eine [[Xindi-Initiationsmedaille|Initiationsmedaille der Xindi]]. Die Medaille soll als Beweis dienen, um die Xindi vom Abbruch des Angriffs auf die Erde zu überzeugen. ({{ENT|Azati Prime}})

In das 22. Jahrhundert führen auch noch weitere Zeitreisen. So wurde der [[Tox Uthat]] aus dem [[27. Jahrhundert]] im 22. Jahrhundert auf dem Planeten [[Risa]] versteckt, damit er nicht in falsche Hände gerät. ({{TNG|Picard macht Urlaub}})

Ein ähnlicher, aber stärkerer Effekt wird festgestellt, als die ''Enterprise'' mit [[Warp]] 9 zur Erde fliegt und durch das Gravitationsfeld eines [[Schwarzer Stern|schwarzen Sterns]] in das Jahr [[1969]] zurückgeschleudert wird. Um wieder zurück ins 23. Jahrhundert zu kommen, fliegt die ''Enterprise'' mit hoher Warpgeschwindigkeit um die Sonne und gelangt so wieder ins Jahr [[2267]]. ({{TOS|Morgen ist Gestern}})

Durch Zeitreisen mit dem Fliehkrafteffekt wird [[2286]] sogar die Erde gerettet. Eine unbekannte [[Walsonde|Sonde]] nähert sich der Erde und will mit den bereits ausgestorbenen [[Buckelwal]]en Kontakt aufnehmen. Die Sonde verursacht dadurch unbewusst eine Umweltkatastrophe. [[Admiral]] [[James T. Kirk]] und seine Crew reisen mit dem [[Klingonischer Bird-of-Prey|Bird-of-Prey]] [[HMS Bounty|HMS ''Bounty'']] in das Jahr [[1986]] zurück, um von dort Buckelwale mit ins 23. Jahrhundert zu bringen. Im [[20. Jahrhundert]] verstoßen Kirk und seine Crew gegen viele temporale Gesetze. So nehmen sie zum Beispiel die Meeresbiologin [[Gillian Taylor]] mit ins 23. Jahrhundert. Die Mission ist aber erfolgreich, und mit Hilfe der Wale können Kirk und seine Crew die Erde retten. ({{Film|4}})

[[2269]] wird ein Forscherteam der Föderation beim Hüter der Ewigkeit stationiert. Im selben Jahr benutzten Kirk und Spock den Hüter der Ewigkeit abermals, um in die Vergangenheit von [[Orion (Planet)|Orion]] zu reisen. Dabei wird eine neue [[Zeitlinie]] geschaffen, in der Spock als Kind bei seinem [[kahs-wan]]-Ritual gestorben ist und auf der ''Enterprise'' der [[Andorianer]] [[Thelin]] nun den Posten des ersten Offiziers innehat. Spock benutzt den Wächter, um nach [[Shi'Kahr]] in die Vergangenheit zu reisen und sein eigenes Leben zu retten, damit die ursprüngliche Zeitlinie wiederhergestellt wird. ({{TAS|Das Zeitportal}})

Es gibt auch verschiedene Raumphänomene, mit denen Zeitreisen möglich sind. So verschwindet die [[USS Bozeman|USS ''Bozeman'']] [[2278]] in einer [[Temporale Kausalitätsschleife|temporalen Kausalitätsschleife]]. ({{TNG|Déjà Vu}})

[[Datei:Dreifacher Data führt Antimaterie ein.jpg|thumb|Der Manheim-Effekt.]]

Durch eine Fehlfunktion des [[Transporter]]s der [[USS Defiant (NX-74205)|USS ''Defiant'']] werden [[2371]] [[Commander]] [[Benjamin Sisko]], [[Lieutenant]] [[Jadzia Dax]] und [[Julian Bashir]] in das Jahr [[2024]] transportiert. Durch das Eingreifen von Sisko wird [[Gabriel Bell]] getötet. Damit die Geschichte wieder ihren richtigen Lauf nimmt, schlüpft Sisko in die Rolle von Bell und der [[Bell-Aufstand]], welcher für die zukünftige Geschichte der Erde eine wichtige Rolle spielt, findet statt. Später können die drei Offiziere mit Hilfe des Transporters der USS ''Defiant'' wieder ins Jahr 2371 zurück gebeamt werden. ({{DS9|Gefangen in der Vergangenheit, Teil I|Gefangen in der Vergangenheit, Teil II}})

[[2371]] wird [[Chief]] [[Miles O'Brien]] bei einem [[Unfall]] mit strahlenden Partikeln überflutet. Eine [[Singularität]] im elliptischen Orbit um die Station [[Deep Space 9]], die sich später als getarnter romulanischer [[Warbird]] herausstellt, verursacht bei ihm mehrere kurz anhaltende Zeitsprünge, jeweils etwa fünf Stunden in die Zukunft. Bei einer dieser Reisen sieht er, wie die Station zerstört wird. Daraufhin wird er von Bashir einer modifizierten Menge der strahlenden Partikel ausgesetzt, um den Zeitsprung zu verkürzen. Tatsächlich kann er herausfinden, weshalb Deep Space 9 zerstört werden soll. Allerdings ist er zu schwach, um noch einmal zurückzureisen. Stattdessen schickt er sein dreieinhalb Stunden älteres Ich zurück in seine Vergangenheit. Das jüngere Ich bleibt in der Zukunft, während die Station unter Feuer der [[Romulaner]] liegt. Dies erscheint zunächst unlogisch: Der ältere O'Brien sollte mit dem jüngeren sterben. Da der ältere aber durch die Warnung die Zeitlinie verändert hat, ist der jüngere offenbar auch in einer anderen Zeitlinie verblieben. ({{DS9|Der Visionär}})

Auch im 24. Jahrhundert wird neben der technischen Entwicklung der Zeitreisemethoden auch ein weiteres [[Zeitportal]] entdeckt. Auf dem Planeten [[Golana]] wird [[2374]] ein [[Zeitportal]] durch Zufall entdeckt, welches 300 Jahre in die Vergangenheit führt. Durch einen Unfall fällt [[Molly O'Brien]], die Tochter von Miles O'Brien, durch das Portal. Ein Team von Föderationswissenschaftlern versucht sie aus der Vergangenheit zu retten, aber sie können Molly erst retten, nachdem sie 12 Jahre in der Vergangenheit festgesessen hat. Das Portal wird aufgrund der Gefahr, welches es bringt, vernichtet. Kurz vor seiner Vernichtung bringen die O'Briens ihre Tochter zum Portal zurück. Das 18-jährige Mädchen kommt im 24. Jahrhundert nicht zurecht und soll wieder zurück in die Vergangenheit geschickt werden, weil sie dort glücklich gewesen ist. Als sie durch das Portal springt, trifft sie auf der anderen Seite die 6-jährige Molly und schickt sie zurück ins 24. Jahrhundert und zu ihren Eltern. ({{DS9|Das Zeitportal}})

Ende [[2368]] stellt die [[USS Enterprise (NCC-1701-D)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-D)]] den ersten Kontakt zu den [[Devidianer]]n her, einer Rasse, die mit Hilfe ihrer Technik ins [[19. Jahrhundert]] auf die Erde zurückreist, um dort von Obdachlosen und Kranken die Lebensenergie abzusaugen. Captain [[Jean-Luc Picard]] und seine Führungsoffiziere reisen zurück ins 19. Jahrhundert und können dort die Devidianer stoppen. ({{TNG|Gefahr aus dem 19. Jahrhundert, Teil I|Gefahr aus dem 19. Jahrhundert, Teil II}})

Die [[Borg]] können mit ihren [[Borg-Sphäre|Sphären]] [[Zeitwirbel]] erschaffen und so durch die Zeit reisen. [[2373]] reisen die Borg durch einen Zeitwirbel in das Jahr [[2063]], um den ersten Kontakt zwischen Menschen und [[Vulkanier]]n zu verhindern und darauf die Erde zu [[Assimilation|assimilieren]]. Die Borg können von der [[USS Enterprise (NCC-1701-E)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-E)]] aufgehalten werden. Mit Hilfe des Wirbels reisen Picard und seine Crew wieder zurück in das 24. Jahrhundert. ({{Film|8}})

Die [[Krenim]] aus dem [[Delta-Quadrant]]en bauen ihr Imperium auf, indem sie die Zeit manipulieren und ganze Völker aus der Geschichte auslöschen. Mit Hilfe eines von [[Annorax]] gebauten [[Krenim-Waffenschiff|Zeitwaffenschiffs]] kann dieser die Geschichte ändern und ein riesiges Krenim-Imperium aufbauen. [[2374]] fliegt die ''Voyager'' durch den Krenimraum und wird mit in den Konflikt hineingezogen. Mit Hilfe der [[Mawasi]] und den [[Nihydron]] kann Captain [[Kathryn Janeway]] das Zeitwaffenschiff vernichten und die normale Zeitlinie wiederherstellen. ({{VOY|Ein Jahr Hölle, Teil I|Ein Jahr Hölle, Teil II}})

Die Propheten schicken den Bajoranern auch mehre Drehkörper, darunter auch den [[Drehkörper der Zeit]], mit den man durch die Zeit reisen kann. [[2373]] bekommen die Bajoraner den Drehkörper von den [[Cardassianer]]n zurück. Der ehemalige klingonische Agent [[Arne Darvin]] benutzt den Drehkörper, um zurück in das Jahr [[2268]] zu reisen. Er will sich dort an Captain Kirk rächen. Kirk hatte ihn damals mit einem [[Tribble]] entlarvt und nun will Darvin ihn mit einer [[Bombe]] in einem Tribble töten. Sisko und seine Crew können den Tribble mit der Bombe finden und Kirk retten. [[Major]] [[Kira Nerys]] findet nebenbei heraus wie der Drehkörper funktioniert und darauf reisen sie zurück ins 24. Jahrhundert. ({{DS9|Immer die Last mit den Tribbles}})

[[2374]] reist Kira ins Jahr [[2346]] zurück, um herauszufinden, ob ihre Mutter [[Kira Meru]] eine Liebesbeziehung mit [[Gul]] [[Dukat]] hat. Nachdem sie die Wahrheit herausgefunden hat, reist sie zurück in die Gegenwart. ({{DS9|Tiefes Unrecht}})

Ende [[2370]] gibt Q Picard die Möglichkeit die Menschheit zu retten. Er lässt dafür Picard durch die Zeit springen. Picard soll verhindern, dass das [[Antizeit]]phänomen, welches die Entstehung des Lebens auf der Erde verhindert, entsteht. Picard springt zwischen [[2364]], [[2370]] und [[2395]] hin und her. Als Picard erkennt, dass es sich hier um ein [[Temporale Paradoxie|Temporales Paradoxon]] handelt, findet er so eine Möglichkeit, wie er die Anomalie vernichten kann. Mit Hilfe der ''Enterprise'' aus den verschiedenen Zeitlinien kann Picard das Antizeitphänomen vernichten und die Menschheit retten. ({{TNG|Gestern, Heute, Morgen, Teil I|Gestern, Heute, Morgen, Teil II}})

Es werden auch weitere temporale Anomalien im 24. Jahrhundert entdeckt. Im Jahr [[2344]] fliegt die [[USS Enterprise (NCC-1701-C)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-C)]] in das Jahr [[2366]]. Es entsteht eine [[Alternative Zeitlinie|alternative Zukunft]], in der Krieg zwischen der Föderation und dem klingonischen Reich herrscht. Die USS ''Enterprise'' reist zurück ins Jahr 2344, und die richtige Zeitlinie wird wiederhergestellt. ({{TNG|Die alte Enterprise}})

Im Jahr 2373 wird die ''Defiant'' durch eine Energiebarriere eines [[Gaia|unbekannten Planeten]] im [[Gamma-Quadrant]]en 200 Jahre in die Vergangenheit versetzt. Ohne die Möglichkeit, in ihre Zeit zurück zu gelangen oder den Planeten zu verlassen, baut die Crew eine Siedlung auf dem Planeten auf. Als die ''Defiant'' 200 Jahre später wieder den Planeten erreicht, treffen Captain Sisko und seine Crew auf ihre eigenen Nachfahren. Um diese Gemeinschaft nicht zu vernichten, befiehlt Sisko den Rückflug durch die Barriere, damit der Kreis geschlossen wird und die Siedlung erhalten bleibt. Der Odo aus der Vergangenheit manipuliert die Flugdaten der ''Defiant'', damit das Schiff in seiner Zeit bleibt und er Kira nicht verliert. Die ''Defiant'' bleibt in ihrer Zeit und die Siedlung wird aus der Geschichte gelöscht. ({{DS9|Kinder der Zeit}})

Im Jahr [[2377]] trifft die ''Voyager'' auf eine Anomalie, welche das Schiff in 37 Zeitzonen aufteilt. Als einziger ist [[Commander]] [[Chakotay]] nicht von dieser Anomalie betroffen. Er reist zwischen den Zeitzonen und bringt mit Hilfe der Voyagercrew aus den verschiedenen Zeitzonen die ''Voyager'' wieder in die richtige Zeit. ({{VOY|Zersplittert}})

[[2387]] explodiert ein großer Stern und wird zur [[Supernova]]. Botschafter Spock versucht mit seinem Quallenschiff und mit Hilfe von [[Rote Materie|roter Materie]] ein [[Schwarzes Loch]] zu erschaffen, welches die [[Druckwelle]] aufhalten soll, welche [[Romulus]] bedroht. Doch es ist zu spät Spock kann zwar die Druckwelle mit den Schwarzen Loch aufhalten, aber Romulus wird vernichtet. Der Romulaner [[Nero]] macht Spock dafür verantwortlich und er greift mit seinem Schiff, der [[Narada|''Narada'']], an und beide Schiffe werden bei diesem Kampf in das Schwarze Loch gezogen. Die ''Narada'' gelangt so in das Jahr [[2233]] während Spock in das Jahr [[2258]] zurückgeschleudert wird. Nero verändert in der Vergangenheit die Geschichte und es entsteht eine [[Neue Zeitlinie]]. ({{Film|11}})

Captain [[Braxton]] erhält den Auftrag die ''Voyager'' im 24. Jahrhundert zu vernichten, weil diese angeblich an der Vernichtung des [[Sol-System]] schuld ist. Bei dem Versuch, die ''Voyager'' zu vernichten, wird das Schiff ins Jahr [[1996]] zurückgeschleudert. Auf der Erde im Jahr 1996 wird der wahre Schuldige [[Henry Starling]] entdeckt. Er wird bei seinem Versuch, mit dem Zeitschiff [[Aeon|''Aeon'']] ins 29. Jahrhundert zu fliegen, von Captain Janeway aufgehalten. Später wird die ''Voyager'' von Braxton wieder ins 24. Jahrhundert gebracht. ({{VOY|Vor dem Ende der Zukunft, Teil I|Vor dem Ende der Zukunft, Teil II}})

Später erhält das Zeitschiff [[USS Relativity|USS ''Relativity'']] den Auftrag herauszufinden, wer die USS ''Voyager'' im Jahr [[2375]] durch einen [[Temporaler Disruptor|temporalen Disruptor]], der ebenfalls aus dem 29. Jahrhundert stammt, zerstört hat. ({{VOY|Zeitschiff Relativity}})