Der [[Transphasentorpedo]] ist eine [[Waffe]] aus einem [[alternative Zeitlinie|alternativen 25. Jahrhundert]], in dem die [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] erst nach 23 [[Jahr]]en nach Hause zurückgekehrt ist.  

Die mittlerweile zum [[Vizeadmiral]] [[Beförderung|beförderte]] [[Kathryn Janeway]] reist aus dem Jahre [[2404]] mit [[Shuttle SC-4|ihrem Shuttle]] in die [[Vergangenheit]], um [[Liste von Crewmitgliedern der USS Voyager|die Mannschaft]] 16 Jahre früher durch ein [[Transwarpzentrum]] der [[Borg]] nach Hause zu bringen und so den Heimweg der ''Voyager'' stark zu verkürzen.  

Dazu wird die ''Voyager'', als erstes [[Sternenflotte]]nschiff, mit Hilfe der Baupläne aus der [[Zukunft]] neben [[Ablativgenerator|Ablativgeneratoren]] mit Transphasentorpedos ausgestattet. Dies soll dazu dienen, den Borg entgegentreten zu können, die das Transwarpzentrum verteidigen. Der Plan von Admiral Janeway sieht zunächst vor, mit Hilfe dieses Transwarpzentrums einen [[Transwarpkanal]] in den [[Alpha-Quadrant|Alpha-Quadranten]] zu finden und anschließend hindurch zu fliegen. Allerdings erkennt [[Captain]] Janeway die Gefahr, die von dieser [[Technologie]] der Borg ausgeht, und beschließt, stattdessen das Transwarpzentrum zu zerstören. Es wird schließlich ein gemeinsamer Plan entwickelt, der sowohl das Transwarpzentrum vernichtet als auch die ''Voyager'' nach Hause bringt. Die Borg sind auf den Einsatz dieser Zukunftstechnologie nicht vorbereitet und erleiden starke Verluste. Die Wirkung der Transphasentorpedos ist enorm. So gelingt es der USS ''Voyager'' mehrmals mit nur einem einzigen Schuss einen ganzen [[Borg-Kubus]] zu zerstören. Kurz bevor die ''Voyager'' in den rettenden Transwarpkanal in den Alpha-Quadranten eintritt, gelingt es ihr unter anderem, mehrere [[Interspatialer Verteiler|Verbindungsknoten]] eines Transwarpkanals mit Transphasentorpedos zu zerstören, wodurch der Kanal zusammenbricht und eine Kettenreaktion in Gang gesetzt wird, die am Ende das gesamte Transwarpzentrum vernichtet und den Weg für weitere Borg-Raumschiffe versperrt. Da die ''Voyager'' jedoch trotzdem noch von einer Borg-Sphäre verfolgt wird, lässt sich die Crew ins Innere der Sphäre ziehen, um sie schlussendlich in der Nähe der [[Erde]], nach dem Austritt aus dem Kanal, von Innen heraus zu zerstören. ({{VOY|Endspiel, Teil II}})

{{HGI|Der im Namen befindliche Wortteil ''Transphasen'' deutet darauf hin, dass diese Waffe durch eine Manipulation seines [[Phase]]nzustand wirksam ist, was ihr ermöglicht [[Schutzschild]]e und [[Kraftfeld]]er zu durchdringen und die maximal zur Verfügung stehende [[Sprengkraft]] beziehungsweise [[Energie]]menge im Inneren des feindlichen Raumschiffs frei zu setzen. Dass die Wirkung einer Waffe nicht immer durch ihre bloße Sprengkraft bestimmt wird, wird schon in {{e|Das ungewisse Dunkel, Teil I}} deutlich, als die Crew der USS ''Voyager'' ein Borg-Raumschiff von der Größe etwa der ''Voyager'' mit der Sprengkraft nur eines einzelnen [[Photonentorpedo]]s zerstören konnte, indem sie ihn einfach ins Innere, in die Nähe der Energiematrix, [[Beamen|gebeamt]] hat. Bereits in {{Film|8}} wurde ein [[Borg-Kubus]] dadurch zerstört, dass die [[USS Enterprise (NCC-1701-E)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-E)]] einige [[Quantentorpedo]]s direkt im Inneren zur Detonation gebracht hat, nachdem die restliche Flotte ein großes Loch in die [[Außenhülle]] des Kubus geschossen hat. Zudem war die Sprengkraft der Transphasentorpedos durch die der USS ''Voyager'' zur Verfügung stehenden Ressourcen limitiert.}}

 

 

{{HGI|Laut dem Roman ''[[Mehr als die Summe]]'' werden Ende [[2380]] Transphasentorpedos auf der [[USS Enterprise (NCC-1701-E)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-E)]] installert, da eine weitere Bedrohung der Borg bevorsteht. Captain [[Jean-Luc Picard]] erhält von Admiral [[Alynna Nechayev]] den Befehl die Torpedos als letzte Alternative zu verwenden.}}

{{HGI|In der Romanserie ''[[Star Trek: Destiny]]'' werden die Transphasentorpedos vor allem von der ''Enterprise'' und später auch von anderen Schiffen der [[Föderation]] und ihrer [[Klingonisches Reich|Alliierten]] eingesetzt, um eine Invasion der Borg aufzuhalten. Die Föderation ist zunächst vorsichtig mit dem Umgang dieser Waffen, damit die Borg möglichst lange damit zu kämpfen haben, doch als der Kampf mit den Borg immer verzweifelter wird, werden auch andere Kampfgruppen damit ausgerüstet, ehe die Borg schließlich doch einen Weg finden, sich zuerst an phasenverschobene Raumschiffe und dann an die Transphasentorpedos anzupassen.}}