Die Zone auf Seite der Föderation wird von mehreren [[Außenposten]] überwacht und Raumschiffe der [[Sternenflotte]] patroullieren regelmäßig entlang des Grenzverlaufs. Auch die Romulaner lassen [[Kreuzer]] entlang der Zone patroullieren und haben große [[Flotte]]nverbände entlang der Grenze postiert ({{TOS|Spock unter Verdacht|Wie schnell die Zeit vergeht|Die unsichtbare Falle}}; {{TNG|Die neutrale Zone}}; {{DS9|In fahlem Mondlicht}}; {{Film|8}}).

Es gibt jedoch auch die Möglichkeit ein Treffen von Schiffen an der Neutralen Zone zu arrangieren oder im Rahmen von [[Diplomatie|diplomatischen]] [[Mission]]en einzelnen Schiffen den Durchflug nach vorheriger Absprache zu gestatten ({{TNG|Datas Tag}}; {{DS9|Unter den Waffen schweigen die Gesetze}}; {{Film|10}}).

[[2266]] kommt es zum [[Neutrale-Zone-Zwischenfall]], dem ersten Verstoß gegen die Bestimmungen des Vertrages und gleichzeitig auch der erste Kontakt zwischen Föderation und Romulanern seit dem, als ein mit einer neuartigen [[Tarntechnologie]] ausgerüsteter [[Romulanischer Bird-of-Prey (23. Jahrhundert)|romulanischer Bird-of-Prey]] die Neutrale Zone durchfliegt und die [[Erdaußenstation 2|Erdaußenstationen 2]], [[Erdaußenstation 3|3]], [[Erdaußenstation 4|4]] und [[Erdaußenstation 8|8]] angreift und zerstört. Nach einem Gefecht mit der [[USS Enterprise (NCC-1701)|USS ''Enterprise'']] zerstört sich der Bird-of-Prey nach einer Niederlage [[Selbstzerstörung|selbst]] ({{TOS|Spock unter Verdacht}}).

{{meta|Es ist nicht bekannt, ob die Neutrale Zone das gesamte Grenzgebiet zwischen der Föderation und dem Sternenimperium abdeckt oder ob es auch ein Verstoß gegen sie ist wenn Romulaner ihr Gebiet an einer anderen Stelle verlassen und in die Föderation ebenfalls an anderer Stelle eindringen. Im 24. Jahrhundert kommt es zu einer ganzen Reihe von Begegnungen mit den Romulanern, aber weil die oben genannten Punkte unklar sind kann nicht jede automatisch als Verletzung der Neutralen Zone gewertet werden.}}

{{meta|In {{TNG|Der Überläufer}} wird berichtet, dass [[Alidar Jarok]] an Angriffen auf die Föderation beteiligt war. Ob es zum Beispiel im Rahmen dieser Kampfhandlungen zu Verletzungen der Neutralen Zone kommt ist nicht bekannt.}}

Nach langer Ruhe in der Neutralen Zone kommt es [[2364]] erneut zu Spannungen, als man zunächst mehrere [[Romulanischer Schlachtkreuzer|Romulanische Schlachtkreuzer]] entdeckt, die sich einem Föderationsaußenposten nähren. Als die [[USS Berlin|USS ''Berlin'']] und die [[USS Enterprise (NCC-1701-D)|USS ''Enterprise'' (NCC-1701-D)]] zur Hilfe gerufen werden kann ein Zwischenfall zunächst vermieden werden. Zu dem kommt es dann aber doch, als nur wenig später im selben Jahr mehrer Föderationsaußenposten entlang der Zone von unbekannten Angreifern zerstört werden. Als jedoch ein romulanischer [[Warbird]] der [[D'deridex-Klasse|''D'deridex''-Klasse]] die Neutrale Zone getarnt durchfliegt und dann Kontakt mit der ''Enterprise'' herstellt stellt sich heraus, dass auch die Romulaner Verluste erlitten haben. Trotz der Grenzverletzung durch den Warbird endet der Zwischenfall ohne Konflikt ({{TNG|Planet Angel One|Die neutrale Zone}}).  

[[2366]] wird weit in Föderationsgebiet auf [[Galorndon Core]] ein abgestürztes romulanisches Schiff entdeckt, dass angeblich durch einen [[Navigation]]sfehler dort hin gelangt ist. Ein Warbird unter [[Commander]] [[Tomalak]] durchquert auf der Suche nach dem Überlebenden, den die ''Enterprise'' retten kann, ebenfalls widerrechtlich die Zone. Nach der Übergabe des Romulaners an Tomalak zieht dieser ab ({{TNG|Auf schmalem Grat}}).

[[2368]] kommt es zu einer groß angelegten romulanischen [[Konspiration]], durch die [[Vulkan]] von romulanischen [[Militär|Truppen]] erobert werden soll. [[Spock]], Captain Picard und [[Data]] werden nach [[Romulus]] gelockt, die beiden Letzteren durchqueren die Neutrale Zone unentdeckt an Bord eines getarnten klingonischen Raumschiffs. Später bewegen sich romulanische Angriffstruppen, die sich als [[Vulkanier]] ausgeben, auf dem Weg nach Vulkan durch die Neutrale Zone. Erst im letzten Moment gelingt es Spock, Picard und Data sich auf Romulus zu befreien und den Plan zu enthüllen, die ''Enterprise'' kann die romulanische Invasionsarmee stellen. Nach diesen inoffiziellen Durchquerungen der der Zone, die beide Seiten jeweils getarnt durchführen kommt es am Ende der Affäre doch noch zu einer offenen Verletzung der Neutrale Zone, als ein romulanischer Warbird sie durchquert und zur Beweisvernichtung die eigenen Schiffe im Föderationsgebiet zerstört ({{TNG|Wiedervereinigung? Teil I|Wiedervereinigung? Teil II}}).

[[2374]] schließlich versuchen Kräfte des [[Tal Shiar]] den neuen [[Prototyp]] der [[Prometheus-Klasse|''Prometheus''-Klasse]] zu entführen, es kommt zu Gefechten zwischen mehrern Warbirds und Schiffen der Sternenflotte um die [[USS Prometheus (Prometheus-Klasse)|USS ''Prometheus'']] und dabei auch zur Verletzung der Neutralen Zone. Die Romulaner ziehen sich nach dem Verlust eines Schiffes und der Überwätigung ihres [[Außenteam]]s an Bord der ''Prometheus'' durch deren [[MHN]] Typ II und [[Der Doktor|den Doktor]] der [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] zurück, die ''Prometheus'' kann von der Sternenflotte zurückerlangt werden ({{VOY|Flaschenpost}}).