Q ist überzeugt, dass Quinn recht gehabt hat und er lehnt sich mit Anhängern gegen das Q-Kontinuum auf. Q und und seine Anhänger fordern mehr Freiheiten, doch viele Q sind dagegen und mit der Zeit kommt es zum [[Q-Bürgerkrieg]] in welchen sich beide Seiten bekämpfen. Q beginnt zu glauben, dass ein neuer Q den Krieg beenden wird, da dieser neue Gedanken und ideen in das Q-Kontinuum bringt. [[2373]] begibt sich Q auf die ''Voyager'' um mit Janeway ein Kind zu zeugen. Q verschweigt seine wahren Absichten und versucht mehrfach erfolglos Janeway zu verführen, doch diese hat kein Interesse an Q. Plötzlich erscheint seine Gefährtin und als die ''Voyager'' von der Druckwelle einer [[Supernova]] getroffen wird, entführt Q Janeway in das Q-Kontinuum. Dort gesteht Q Janeway die Wahrheit, dass er mit dem gemeinsamen Kind den Krieg im Kontinuum beenden will. Doch Q wird angegriffen und dabei verwundet. Im letzten Moment kann Janeway Q in Sicherheit bringen und sie bringt ihn zu seinen Gefährten. Anhand der Situation erkennt Janeway, dass Q dabei ist diesen Krieg zu verlieren. Janeway gibt Q auch zu verstehen, dass sie nicht die richtige Partnerin für ihn ist und schlägt stattdessen seine Partnerin als Mutter seines Kindes vor. Mit einigen Argumenten kann Janeway Q davon überzeugen mit seiner Partnerin ein Kind zu zeugen. als nächstes will Janeway diesen Krieg beenden und begibt sich zu Qs Gegnern, um einen Waffenstillstand auszuhandeln. Janeway begibt sich zu [[Q (Colonel)|dem Anführer der Gegenseite]] um zu verhandeln. Doch er gibt ihr zu verstehen, dass er nicht mit Q verhandeln wird, da Q hingerichtet werden soll. Wenig später wird Q gefangen genommen und soll mit Janeway zusammen hingerichtet werden. Als beide hingerichtet werden, bittet Q darum das wenigstens Janeway frei gelassen wird, doch diese Bitte wird ihm nicht gewährt. Inzwischen gelangt die Crew der ''Voyager'' mit Hilfe der Gefährtin von Q ins Kontinuum und diese greift ins Kampfgeschehen ein. Dabei können Q und Janeway gerettet werden. Darauf zeugen Q und seine Gefährtin das kind und können so den Krieg im Kontinuum beenden. Die Crew der ''Voyager'' kehrt darauf auf das Schiff zurück. Wenig später erscheint Q mit seinem [[Q (Sohn)|Q]] und präsentiert diesen Janeway. Q ist stolz auf seinen Sohn und ernennt Janeway zur Patentante seines Sohnes. Janeway fühlt sich geehert und Q kehrt darauf mit seinen Sohn in das Kontinuum zurück. ({{VOY|Die "Q"-Krise}})

== Spätere Begegnungen ==