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Als Seven of Nine durch ein von [[Spezies 6339]] manipuliertes [[Vinculum]] von den Persönlichkeiten der Personen, die sie assimilierte kontrolliert wird und Tuvok versucht sie mit einer Gedankenverschmelzung zu behandeln, übernimmt Chakotay die taktische Station. ({{VOY|Das Vinculum}})
Kurz darauf langweilt der Doktor die Crew mit einer Präsentation seiner Holofotos. Chakotay gehört zur ersten Gruppe, der der Doktor seine Aufnahmen präsentiert und missachtet daher den Befehl von Janeway, bei der zweiten Gruppe Roten Alarm auszulösen. Kurz darauf, wird das Schiff von einer Energiewelle getroffen und empfängt eine Nachricht. Chakotay lässt Kim diese Nachricht analysieren. Nachdem man ein beschädigtes Schiff entdeckt und den Piloten an Bord beamt, fällt dieser Torres auf der Krankenstation an und verbindet sich mit ihr. Während der Doktor Torres behandelt, versucht Chakotay mit Janeway die Sprache des fremden Schiffes zu entschlüsseln. Nachdem Tabor Crell Moset als Kriegsverbrecher wiedererkennt, fordert er Chakotay auf die Forschungsergebnisse Mosets aus der Datenbank zu löschen. Als Chakotay darauf nicht eingeht, will Tabor sein Offizierspatent niederlegen, was Chakotay ebenfalls ablehnt. ({{VOY|Inhumane Praktiken}})
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