'''Chakotay''' ist ein [[Mensch]] [[Indianer|indianischer]] Herkunft. Mit bürgerlichem Namen heißt er Amal Kotay (''[[{{VOY]]: "[[|Arbeiterschaft, Teil I]]"''}}). Er hat uramerikanische Vorfahren aus der Gegend um Arizona und ist ein sehr spiritueller Mensch. Außerdem bezeichnet er sich selbst als Vegetarier (''[[{{VOY]]: "[[|Die Kooperative]]"''}}).

Als Junge kümmerte er sich um seinen Großvater, der unter durch einen [[Gen]]defekt ausgelöste Halluzinationen litt. Der Gendefekt konnte bei Chakotay noch vor seiner Geburt unterdrückt werden, später jedoch wurde er von Wesen aktiviert, die versuchten, mit der ''Voyager'' in Kontakt zu treten (''[[{{VOY]]: "[[|Der Fight]]"''}}).

Er regte sich als Kind oft darüber auf, dass sein Stamm sich nicht wie andere Stämme an das [[24. Jahrhundert]] anpasste (''[[{{VOY]]: "[[|Tattoo]]"''}}).

Mit 15 Jahren trat er, gefördert von [[Captain]] Sulu (''von dem man annimmt, dass es sich um einen Nachfahren von [[Hikaru Sulu]] handelt, eventl. Hiromi Sulu, der der Sohn von [[Demora Sulu]] ist.''), aber gegen den Willen seines Vaters [[Kolopak]] in die [[Sternenflotten-Akademie]] ein. Dort machte er eine Ausbildung zum [[Anthropologie|Anthropologen]] (''[[{{VOY]]: "[[|Tattoo]]"''}}). Chakotay hatte auf der Akademie die Angewohnheit sehr unordentlich zu sein (''[[{{VOY]]: "[[|Ein Jahr Hölle, Teil I]]"''}}).

Später verließ Chakotay die Sternenflotte und schloss sich dem [[Maquis]] an, weil er den Platz seines Vaters einnehmen wollte, der kurz zuvor im Kampf gegen die [[Cardassianer]] gestorben war. Durch seine Führungsstärke stieg er dort rasch auf und erhielt bald das Kommando über die [[SS Val Jean|SS ''Val Jean'']], einen [[Maquis-Raider]]. Zusammen mit seiner Crew wurde er dann [[2371]] von dem [[Fürsorger]] in den [[Delta-Quadrant]]en verschleppt ''([[{{VOY]]: "[[|Der Fürsorger, Teil I]]"}})''.

[[2378]] kehren Chakotay und die [[USS ''Voyager|Voyager]] '' mithilfe eines [[Transwarpzentrum|Transwarpzentrums]] der [[Borg]] zurück in den [[Alpha-Quadrant|Alpha-Quadranten]] (''[[{{VOY]]: "[[|Endspiel, Teil I]]" und "[[|Endspiel, Teil II|Teil II]]"''}}).