Als Captain Janeway dort ankommt, ist der [[Warpkern]] abgeschaltet. B'Elanna Torres kann sich nicht erinnern, warum sie die [[Notabschaltung]] des Warpkerns gemacht hat und wird von Tuvok festgehalten. Janeway stellt fest, dass es zwei Stunden dauert die [[Dilithiummatrix]] zu regenerieren. Janeway wirft Torres vor, dass den Hauptcomputer hat abstürzen lassen, die Brücke blockiert und das Schiff abrupt gestoppt hat. Dafür verlangt sie eine Erklärung von ihrer Chefingenieurin, die diese jedoch nicht zu geben vermag. Janeway fragt sich, was hier nur vorgehe.

Inzwischen hat der Doktor etwas herausgefunden. Auf der Krankenstation informiert er Janeway und Tuvok über seine Entdeckung. In Paris' Gedächtnisengrammen gibt es Abweichungen zu den Zeiten, in denen er unter Gedächtnisverlust leidet und den neuen Kurs eingab. Bei B'Elanna Torres findet sich die gleiche Abweichung zu der Zeit, als sie den Warpkern abschaltete. Der Doktor meint, dass es sich dabei um eine neuroelektrische Signatur handelt, die seiner Meinung nach eine fremde Hirnwelle ist, die die eigene überlagert. Paris erkundigt sich nun, woher sie stammt. Die Herkunft dieser Hirnwelle kann er jedoch nicht bestimmen. Allerdings ist die Energiesignatur ungewöhnlich. Eine mögliche Erklärung ist, dass sich eine fremde Lebensform an Bord befindet. Diese versucht zu verhindern, dass sie zu dem Nebel zurückzufliegen. Tuvok gibt [[Eindringlingsalarm]] und lässt das Sicherheitspersonal auf Kondition 4 übergehen. Er vermutet, dass das Wesen mit dem Shuttle an Bord gelangt ist. Es wird vermutet, dass das Wesen von einem zum anderen springen, jedoch das Schiff nicht direkt kontrollieren kann. Janeway befürchtet, dass es Jeden von ihnen kontrollieren kann. Deshalb ist der Doktor auch nicht anfällig dafür. Er ist der einzige, dem man vertrauen kann, da er kein organisches Wesen ist. Paris ist sich sicher, dass es die Kommando- und Navigationssysteme nicht direkt kontrollieren kann, da es dies sonst schon längst getan hätte. Janeway kann nicht riskieren, dass das fremde Wesen einen der Führungsoffiziere kontrolliert. Daher überträgt der Captain bis auf Weiteres alle [[Kommandocode]]s auf ihn. Der Doktor fragt, ob das bedeutet, dass er das Kommando hat. Janeway erklärt ihm aber, dass er als eine Art Sicherung fungieren wird und ihre Befehle außer Kraft setzen kann, wenn er vermutet, dass einer von ihnen vom Wesen kontrolliert wird. Der Doktor ist etwas unsicher, ob er der Aufgabe gewachsen ist, aber er stimmt zu. Paris meint ironisch, dass er sich schon viel besser fühlt. Janeway überträgt daraufhin die Kommandocodes und begibt sich mit Tuok und Torres zum Maschinenraum, um den Schaden zu beheben.