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Durch diese Tatsache sind sie vollkommen ungeeignet, um gegen Schiffe oder die Infrastruktur eines bewohnten [[Planet]]en eingesetzt zu werden, da sie bei leblosen Objekten keinerlei Wirkung erzielen. Die biogenen Waffen, die sich im Besitz des [[Maquis]] befinden, müssen unter besonders kalten Umgebungstemperaturen gelagert werden. Zu den biogenen Waffen gehören unter anderem das [[Trilithium]]harz, das absolut tödlich für [[Mensch]]en ist (''[[DS9]]: "[[Für die Uniform]]"; [[TNG]]: "[[In der Hand von Terroristen]]"'').
Eine von mehreren Methoden, die die [[Xindi]] entwickelt haben, um die Bevölkerung der [[Erde]] auszulöschen war eine besondere [[Xindi-Biowaffe|Biowaffe]]. Diese wurde anschließend von mehreren [[Xindi|Reptilianern]] auf die Erde des Jahres [[2004]] gebracht. Allerdings nimmt [[Captain]] [[Jonathan Archer|Archer]] die Verfolgung auf und durchkreuzt erfolgreich die Pläne der Xindi (''[[ENT]]: "[[Carpenter Street (Episode)|Carpenter Street]]"'').
Im Krieg zwischen den [[T'Lani]] und den [[Kellerun]] wurde eine Waffe namens [[Harvester]] eingesetzt, die ebenfalls eine biogene Waffe darstellt (''[[DS9]]: "[[Das Harvester-Desaster]]"'').