Die '''[[Biofilter''' ]] bilden eine der wichtigsten Komponenten eines [[Transporter]]s. Ihre Hauptaufgabe besteht darin, die Personen, die beispielsweise von einem [[Planet]]en herauf [[Beamen|gebeamt]] werden, nach diversen Fremdkörpern (Bakterien, Viren) zu untersuchen. Sollte so ein Fall eintreten, werden die Fremdkörper während des Beamvorgangs augenblicklich entfernt, indem der Transporter das ursprüngliche Muster der Person mit dem aktuellen vergleicht.

Allerdings bietet der Biofilter keinen vollkommenen Schutz, da es viele unbekannte Varianten von Viren gibt, die nicht automatisch erkannt werden können (''[[{{TNG]]: "[[|Die jungen Greise]]"}}; [[{{VOY]]: "[[|Makrokosmos]]"''}}).

Durch einige Modifikationen an den Biofiltern, können sie unter anderem, im [[Medizin|medizinischen]] Bereich angewendet werden, um beispielsweise organische Veränderungen wieder rückgängig zu machen (''[[{{TNG]]: "[[|Erwachsene Kinder]]"''}}).