Nach einer langen Periode des Friedens steht die gesamte Föderation im [[24. Jahrhundert]] ihrer härtesten Bewährungsprobe gegenüber. Obwohl sie weiterhin eine rein friedliche Expansionspolitik verfolgt, ist dies unter anderem der Anlass für zahlreiche neue militärische Konflikte mit allen bedeutenden [[Regierung und Politik|Mächten]] des Quadranten. Aus einigen dieser Konflikte entwickeln sich mit der Zeit gar harte und langwierige Kriege. Dazu gehören beispielsweise in den [[2340er|40er]] Jahren ein Grenzkonflikt mit den [[Cardassianer]]n ({{TNG|Der Rachefeldzug}}). Später gibt es noch weitere Konflikte mit den [[Talarianer]]n ({{TNG|Endars Sohn}}), den [[Tholianer]]n ({{TNG|Rikers Vater}}), den [[Sheliak]] ({{TNG|Die Macht der Paragraphen}}), sowie den [[Tzenkethi]] ({{DS9|Der Widersacher}}). In den [[2360er|60ern]] macht die Föderation Bekanntschaft mit einem vollkommen neuen Typ von Feind, den [[Borg]] ({{TNG|Zeitsprung mit Q}}). Nach der verlustreichen [[Schlacht von Wolf 359]], muss die Föderation ihre friedliche Verteidigungs- und Schiffsbaupolitik vollkommen neu überdenken, wodurch eine Vielzahl von moderneren und leistungsstärkeren [[Liste der Föderationsschiffsklassen des 24. Jahrhunderts|Schiffsklassen]] entwickelt und in Dienst gestellt wird.