Janeway beschließt, dass der Doktor zumindest ein [[Diplomatie und Recht|Recht]] darauf hat, zu erfahren, was passiert ist. Nach einer Überspielung einer alten Speicherversion kommen alle Erinnerungen zurück, und es wird klar, was die Fehlfunktion verursacht hat: Bei einer [[Außenmission]] werden [[Harry Kim]] und [[Ahni Jetal]] bei einem Angriff gleichzeitig schwer verletzt. Zurück auf der [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] waren beide [[Medizin|Patienten]] in [[Tod|Lebensgefahr]] und mussten vom Doktor behandelt werden. Er entschied sich für eine Rückenmarksperre, um die Rückenmarkauflösung vor dem unteren [[Gehirn|Kleinhirn]] zu stoppen und den [[Tod|Hirntod ]] der Patienten zu vermeiden. [[Tom Paris]] assistierte ihm, konnte ihm aber nicht helfen, die Operation an beiden Patienten gleichzeitig durchzuführen. Der Doktor entschied sich für die [[Liste der Behandlungen und Medikamente|Behandlung]] von Harry Kim; sein [[MHN|Programm]] ist eigentlich nicht ausgerüstet für den Fall, dass zwei Patienten im gleichen Zustand gleichzeitig behandelt werden müssen. Dies verursachte auch den Konflikt, denn die [[Ethische Subroutine|ethischen Subroutinen]] sehen vor, dass der Doktor seine Objektivität behält, doch seine [[Subroutine|Persönlichkeitssubroutinen]] ließen ihn seinen Freund auswählen. Ahni Jetal starb auf der [[Krankenstation]] an ihren Verletzungen. Später im [[Casino]], nach einem Gespräch mit [[Neelix]], trat der [[Feedback|Programmkonflikt]] auf: er Er [[Philosophie|philosophierte ]] auf zynische Art und Weise über Entscheidungen, sein Auftreten wurde aggressiv. Nachdem Neelix das [[Sicherheit]]steam rief, geriet der Doktor in einen Wutausbruch und fragte immer wieder, wieso seine Patientin sterben musste, warum er sie getötet hat.

Die Erinnerungen sind nun vollständig überspielt und der Doktor wird abermals wütend. Janeway deaktiviert das MHN daraufhin und ohnmächtig bemerkt die anwesende [[B'Elanna Torres]]bemerkt, dass der Schaden möglicherweise irreparabel sei. Janeway interpretiert den Konflikt als Kampf zwischen seiner originalen Programmierung und seiner "„[[Seele"]]“. Doch B'Elanna sieht die Ursache des Konflikts nur in seinen [[Subroutine|Persönlichkeitssubroutinen]].

Janeway entschließt sich, den Doktor auf dem [[Holodeck]] seinen inneren Kampf ausfechten zu lassen. Dabei wird er rund um die Uhr von seinen Freunden betreut, doch erst durch das, vom Captain liegen gelassene, [[Buch]] ''"„[[La Vita Nuova]]"“'' kommt er über die Situation hinweg und akzeptiert seinen Bruch mit dem [[Hippokratischer Eid|Hippokratischen Eid]] als Ausnahmesituation.

*[[Robert Picardo]], der Darsteller des Doktors, spielte die "Fehlfunktion" „Fehlfunktion“ sehr eindrucksvoll: Er philosophierte sarkastisch und nachdenklich zugleich über Entscheidungen. Er ließ den Doktor in Wut ausbrechen, da ihm seine Frage, wieso Fähnrich Jetal sterben musste, nicht beantwortet wird. Kurz gesagt, er spielte den Doktor, wie er verrückt wird und stellte damit den beschriebenen inneren Kampf beziehungsweise die [[Feedback|Feedback-Schleife]] dar. Dies war eines der [[emotion]]alsten Momente des Doktors in der Serie und Robert Picardo bezeichnete in den DVD-Specials diese Episode als seine Lieblingsfolge und als wichtige Etappe in der Charakterentwicklung des Doktors.

*In der Flashback-Szene, als sich der Doktor mit [[Ahni Jetal]] und Harry Kim im Shuttle befindet, benutzt der Doktor seine Holo-Kamera, wobei Robert Picardo für diese Szene eine Handkamera gegeben wurde. Bei den Aufnahmen durch diese sieht man auf den Bildschirmen des Shuttles eine schwarze Linie quer über die Darstellung, ein Hinweis darauf, dass für die [[Okudagramm]]e Röhren-Monitore verwendet werden, denn die Handkamera war in der Aufnahmegeschwindigkeit zu langsam für die Aktualisierungsrate der Monitore, wodurch diese schwarze Linie entsteht.