Der [[Transphasentorpedo]] ist eine [[Waffe]] aus dem einem [[alternative Zeitlinie|alternativen 25. Jahrhundert]], in der die [[USS Voyager|USS ''Voyager'']] erst nach vielen Jahren und unter hohen Verlusten nach Hause zurückgekehrt ist. Die mittlerweile zum 23 [[AdmiralJahr]] [[Beförderung|beförderte]] [[Kathryn Janeway]] reist mit [[Shuttle SC-4|ihrem Shuttle]] in die Vergangenheit, um den Heimweg der ''Voyager'' stark zu verkürzen und so [[Liste von Crewmitgliedern der USS Voyager|der Mannschaft]] das Leid zu ersparen, das sie miterlebt haten nach Hause zurück gekehrt ist.

So wird als erstes Die mittlerweile zum [[SternenflotteAdmiral]]nschiff die [[USS VoyagerBeförderung|''Voyager''beförderte]] neben einem [[AblativgeneratorKathryn Janeway]] mit Transphasentorpedos ausgestattet, um den reist aus dem Jahre [[Borg2404]] entgegenzutreten, die ihr mit [[TranswarpzentrumShuttle SC-4|ihrem Shuttle]] verteidigen. Mit Hilfe dieses in die [[TranswarpzentrumVergangenheit]]s will die , um den Heimweg der ''Voyager''-Crew durch einen stark zu verkürzen und so [[TranswarpkanalListe von Crewmitgliedern der USS Voyager|der Mannschaft]] in den 16 Jahre früher durch ein [[Alpha-Quadrant|Alpha-QuadrantenTranswarpzentrum]] gelangen. Die Borg sind auf den Einsatz dieser Waffe aus der Zukunft nicht vorbereitet und erleiden starke Verluste. Der ''Voyager'' gelingt es unter anderem, die [[Interspatialer Verteiler|VerbindungsknotenBorg]] eines Transwarpkanals nach Hause zu zerstören, wodurch dieser zusammenbricht und den Weg hinter ihnen versperrtbringen. ({{VOY|Endspiel, Teil II}})

Dazu wird die [[USS Voyager|''Voyager'']], als erstes [[Sternenflotte]]nschiff, mit Hilfe der Baupläne aus der [[Zukunft]] neben einem [[Ablativgenerator]] mit Transphasentorpedos ausgestattet. Dies soll dazu dienen, um den [[Borg]] entgegenzutreten, die das Transwarpzentrum verteidigen. Der Plan von Admiral Janeway sieht zunächst vor, mit Hilfe dieses Transwarpzentrums einen [[Transwarpkanal]] in den [[Alpha-Quadrant|Alpha-Quadranten]] zu finden und anschließend hindurch zu fliegen. Allerdings erkennt Captain Janeway die Gefahr, die von dieser Borg-Technologie ausgeht und beschließt stattdessen das Transwarpzentrum zu zerstören. Es wird schließlich ein gemeinsamer Plan entwickelt, der sowohl das Transwarpzentrum vernichtet als auch die ''Voyager'' nach Hause bringt. Die Effizienz Borg sind auf den Einsatz dieser Zukunftstechnologie nicht vorbereitet und erleiden starke Verluste. Die Wirkung der Transphasentorpedos ist enorm. Anscheinend ist die So gelingt es der USS ''Voyager'' durch diese Torpedos in der Lage mehrmals mit nur einem einzigen Schuss einen ganzen [[Borg-Kubus]] oder eine zu zerstören. Kurz bevor die ''Voyager'' den rettenden Transwarpkanal in den Alpha-Quadranten betritt, gelingt es ihr unter anderem, mehrere [[Interspatialer Verteiler|Verbindungsknoten]] eines Transwarpkanals mit Transphasentorpedos zu zerstören, wodurch der Kanal zusammenbricht und eine Kettenreaktion in Gang setzt, die am Ende das gesamte Transwarpzentrum vernichtet und den Weg für weitere Borg-Raumschiffe versperrt. Da die ''Voyager'' jedoch trotzdem noch von einer Borg-Sphäreverfolgt wird, lässt sich die Crew ins Innere der Sphäre ziehen, um sie schlussendlich in der Nähe der [[Erde]] , nach dem Austritt aus dem Kanal, von Innen heraus zu zerstören. ({{VOY|Endspiel, Teil II}})