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Nach Monaten im Exil auf [[Vulkan]] reist die Crew der ''Enterprise'' mit der [[HMS Bounty]] (einem im letzen Film erbeuteten [[Klingonischer Bird-of-Prey|Klingonischen Bird-of-Prey]]) zurück zur [[Erde]], wo eine gigantische [[Walsonde|Sonde]] zu Umweltkatatstrophen führt, als sie versucht mit [[Buckelwal]]en Kontakt aufzunehemen. [[Admiral]] [[James T. Kirk|Kirk]] reist in die Vergangenheit, um die inzwischen ausgestorbenen Wale zurück zu bringen.