Das Ziel des Multiplayer-Modus ist es, als letzter Spieler zu überleben oder gemeinsam mit mindestens einem Mitstreiter die gegnerische(n) Allianz(en) auszuschalten. Jeder Spieler kann dabei vor Beginn der Partie zwischen den sechs im Spielverlauf der Einzelmissionen auftauchenden Rassen wählen (Klingonen,Romulaner,Föderation,Borg,. Hierbei muss der Spieler die Vorteile der einzelnen Spezies 8471,Cardassianer letzere beiden sind nur im Multiplayer modus spielbar) nutzen und muss mit einer gut gewählten Strategie eine mächtige Flotte bilden, um den/die Gegner zu eliminierenschlagen.

:''Es ist zu beachten, dass die Rassen Spiel das Stärkeverhältnis der Spezies untereinander ohne den Patch auf die aktuelle Version 1.1 recht unausgeglichen sindist.''

Wie auch beim Vorgänger ist das Sofortspiel als Single-Player-Version des Multiplayer-Modus anzusehen. Die zusätzlichen Spieler werden können vom Computer in drei verschiedenen Schwierigkeitsgraden gesteuertwerden.