Für die fünte fünfte Staffel wurde ein neues [[Shuttle]], der ''[[Delta Flyer]]'', in die Serie eingeführt. In dieser Staffel gab es auch ein Jubiläum; "[[Temporale Paradoxie (Episode)|Temporale Paradoxie]]" war die einhunderste Folge. In dieser Folge hatte LeVar Burton einen Gastauftritt. Zum Ende der fünften Staffel wollte Kate Mulgrew aus der Serie aussteigen. Es war geplant, dass in der letzten Folge der fünten Staffel Janeway schwer verletzt würde und in der dritten Folge der sechsten Staffel an ihren Verletzungen sterben wird. Die drei ersten Folgen der sechsten Staffel sollten die Möglichkeit geben, sich von der Crew und den Fans zu verabschieden. Aber Mulgrew blieb zum Glück der Serie weiter erhalten und der "Voyager" bis zur traditionellen siebten Staffel treu.