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Der Crew wird klar, dass sie es mit einem übermächtigen Gegner zu tun haben, die selbst den Borg überlegen sind. Außerdem scheinen sie gegen Nanosonden immun zu sein.
Unterdessen liegt Harry Kim in der [[Krankenstation]]. Die fremde Spezies hat ihn mit einem Virus infiziert, die seine eigene DNA zerstört. Er wird quasi von innen zerfressen. Kurze Zeit später kommt Janeway und befragt [[Der Doktor|den Doktor]] nach der Lage. Er entgegnet, dass er einen Weg gefunden habe, Borg-[[Nanosonde]]n so zu modifizieren, dass das Immunsystem der Fremden Spezies sie nicht als Fremdkörper sieht und sie somit angreifbar werden.
Zurück auf der Brücke werten sie die Daten aus, die sie auf dem Kubus sammeln konnten. Die Lebensform, der das Außenteam begegnet sind, gehört zu einer Spezies, die von den Borg als [[Spezies 8472]] bezeichnet werden. Die Borg wurden bereit 12 Male von ihnen angegriffen und jedes mal wurden die beteiligten Borg-Schiffe komplett zerstört. Da Spezies 8472 immun gegen die Assimilation ist, können sich die Borg nicht an ihre Waffen und Schilde anpassen; sie sind daher vollkommen Schutzlos ausgeliefert.
Chakotay fragt, woher die Spezies kommt. Sie wissen es und es ist gleichzeitig eine schlechte Botschaft: Spezies 8472 gelangt durch eine Quantensingularität in der Nordwest-Passage in den Borgraum. Die Voyager hat die Singularität erreicht: Hunderte [[Bioschiff]]e strömen in den Borgraum.
Kes hat erneut eine Vision. Spezies 8472 scheint telepatische Fähigkeiten zu haben und kommuniziert mit Kes. Ihr wird gesagt, dass die gesamte Galaxis von den schwachen Lebewesen gesäubert werden muss. Sie redet mit dem Captain darüber. Ihr wird klar, dass die Invasion auf die Borg nur der Anfang ist. Der weitere Weg durch die Nordwest-Passage steht außer Frage, dies würde den sicheren Tod bedeuten. Andererseit bedeutet ein anderer Weg durch den Borg-Raum die assimilationAssimilation. Sie Die ''Voyager'' steht vor einer misslichen Lage.
Einige Zeit später treffen sich die Brückenoffiziere erneut zu einer Besprechung. Janeway hat einen Plan: Eine Allianz mit den Borg. Die Nanosonden wurden hinreichend modifiziert, dass Harry Kim geheilt werden konnte. Deshalb können sie auch als Waffe benutzt werden. Chakotay ist strikt dagegen: Mit den Borg kann man nicht verhandeln. Nach einer Debatte beendet Janeway die Besprechung. Auf der Brücke fragt Janeway, ob sich einige Borg-Schiffe in der Nähe der ''Voyager'' befinden. Harry bejaht. Einige Lichtjahre entfernt seien einige Kuben in der nähe eines assimilierten Planeten stationiert. Janeway befiehlt, Kurs auf den Planeten zu setzen.