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Als von der ''Voyager'' das [[Omega-Molekül]] festgestellt wird, beginnt Captain Janeway die [[Omega-Direktive]] auszuführen. Da Seven durch die Assimilation von Captain der Sternenflotte von dieser [[Direktiven der Föderation|Direktiven]] Kenntnis hat arbeitet sie mit dem Captain zusammen. Seven entwickelt eine [[Harmonikresonanzkammer]] in der Omega abgebaut werden kann. Seven bekommt vom Captain die Befugnis alle Ressourcen zu benutzen um dieses Projekt zu leiten. Sie organisiert das Team wie ein Kollektiv und teilt jedem eine Nummer zu. Harry Kim beschwert sich darauf hin und wird zu „two of ten“ degradiert, denn Seven hat das Sternenflottenprotokoll mitverwendet, da ihr das Mittel einer Degradierung praktisch erschien. Als die Kammer fertiggestellt ist, entwickelt Seven eine Möglichkeit das instabile und hochgefährliche Omega zu stabilisieren und nutzbar zu machen. Omega – Partikel 010 - ist für die Borg der Inbegriff von Perfektion und die oberste Anweisung ist, Omega zu finden und nutzbar zu machen.
Seven bitte Captain Janeway das stabilisierende Verfahren durchführen zu dürfen. Doch diese ist nicht bereit das Risiko einzugehen. Kurz bevor Omega ganz zerstört werden kann stabilisiert es sich und Seven schaut fasziniert für einige Sekunden auf die Perfektion. Sie versucht später die Erfahrungen im Programm von [[Leonardo da Vinci]] zu ergründen, da es dort viele [[Religion|religiöse Symbole]] gibt. Captain Janeway, die dazu kommt, meint, es wäre wohl ihre erste spirituelle Erfahrung gewesen. ({{VOY|Die Omega -Direktive}})
[[Datei:Chakotay_und_Seven_finden_das_Shuttle.jpg|thumb|Das leere Shuttle]]
Das [[Backup]]modul des Doktors wird 700 Jahren, nachdem es gestohlen worden ist von den [[Kyrianer]]n auf ihrem Planeten wiedergefunden. Er berichtigt die Version der Kyrianer und stellt klar, dass Seven of Nine keine vollständige Borg-Drohne war, die Kyrianer umgebracht hat, sondern ein Mensch der von ihnen als Geisel genommen worden ist. ({{VOY|Der Zeitzeuge}})
Seven unterhält sich oft mit Janeway, zum Beispiel, wenn sie etwas neues über Menschlichkeit gelernt hat. Auf der anderen Seite fragt auch Janeway Seven oft um Rat, bevor sie [[Befehl]]e gibt. Zwischen den beiden entwickelt sich ein [[Lehrer]]in-und-[[Schüler]]in-Verhältnis.
Allerdings sind beide nicht immer einer Meinung, wie beispielsweise bei dem Konflikt zwischen Spezies 8472 und den [[Hirogen]] oder während der [[Mission]] um das [[Omega-Molekül]]. Auch als der Captain einfach die Erinnerungsdateien des Doktors ändern will und ihn mit einem Replikator vergleicht, kommt es zu einer Auseinandersetzung, die Seven allerdings ''gewinnt''.({{VOY|Die Beute|Die Omega -Direktive|Verborgene Bilder}})
=== Der Doktor ===