An Bord der ''Voyager'' wird Seska zum [[Fähnrich]] ernannt und sie wird [[Wissenschaftsoffizier]]. Seska macht [[Captain]] [[Kathryn Janeway]] dafür verantwortlich, dass die ''Voyager'' im Delta-Quadrant gestrandet ist. Janeway hat, um die Vorschriften der [[Sternenflotte]] einzuhalten, die einzige Möglichkeit nach Hause zurück zukehren vertan. Insgeheim hofft sie, dass der Maquis die Kontrolle über das Schiff übernimmt und so ihre Chanchen Chancen größer werden wieder in den Alpha-Quadranten zurück zukehren. Als B'Elanna Torres wegen eines Vorfalls im [[Maschinenraum]] in ihr [[Quartier]] unter [[Arrest]] gestellt wird sieht sie eine Chance eine [[Meuterei]] anzufangen. Sie und [[Jarvin]] schlagen Chakotay vor, das [[Kommando]] über die ''Voyager'' zu übernehmen und B'Elanna dann zu befreien. Die beiden sagen ihm vollen Unterstützung zu, als aber Chakotay das hört verwarnt er sie und droht den beiden, wenn er sowas nochmal hört werden beide wegen Meuterei eingesperrt. Während die ''Voyager'' im [[Ereignishorizont]] einer [[Quantensingularität]] gefangen ist bedient Seska die Wissenschaftsstation. ({{VOY|Die Parallaxe}})

Auf dem [[Planet]] [[Sikaris]] besteht die Möglichkeit, mit Hilfe eines [[Raumtrajektor]] die Reise der ''Voyager'' um 40.000 [[Lichtjahr]]e zu verkürzen. Aber das Gesetz der [[Sikarianer]] verbietet fremde Technik an andere Völker weiter zugeben und Captain Janeway achtet das Gesetz. Als es eine Möglichkeit gibt, illegal an die Technik ran zukommen ist Seska sofort bereit sie zu besorgen. Sie plant auch schon zusammen mit B'Elanna und [[Joseph Carey]] die Installation des Geräts. Die drei wollen im Austausch für das Gerät heimlich die Daten aus der Schiffsbibliothek kopieren. Die drei bekommen unerwartet Hilfe von [[Tuvok]] der den Austausch vornimmt. Als der Austausch abgeschlossen ist übergibt Tuvok ihnen das Gerät und sagt, dass sie warten sollen bis er den Captain darüber informiert hat. Als man bemerkt, dass der Trajektor nur im [[Orbit]] von Sikaris funktioniert, überzeugt Seska B'Elanna das Gerät zu aktivieren. Aber der Trajektor ist nicht mit der Technik der Föderation kompatibel, das Schiff wird beschädigt und es droht ein [[Warpkernbruch]]. B'Elanna kann das Gerät vernichten und Seska will auch sämtliche Beweise für diese illigale illegale Aktion vernichten, aber B'Elanna will dafür die Verantwortung übernehmen. Seska kann diese [[Ehre]]nhaftigkeit und den Wandel von B'Elanna nicht verstehen. ({{VOY|Das oberste Gesetz}})

Während sie bei den Kazon ist, beginnt Seska wieder ihre cardassianische Physiologie herzustellen. Sie beginnt eine Beziehung mit Culluh. Obwohl die Kazon Frauen als minderwärtig minderwertig betrachten, gelingt es Seska immer wieder Culluh zu manipulieren. Mit ihrem taktischen Wissen der Cardassianer, des Maquis und der Sternenflotte plant Seska zusammen mit Culluh den Angriff auf die ''Voyager'' um das Schiff zu erobern.

Nachdem es nicht mit den Relora geklappt hat, nimmt Seska Kontakt zu den [[Kazon-Hobii|Hobii]] und den [[Kazon-Oglamar|Oglamar]] auf, um mit ihnen zusammen die ''Voyager'' zu erobern. Culluh ist sehr verägertverärgert, dass seine Frau über seinen Kopf hinweg gehandelt hat. Insgeheim, bewundert er ihre [[Intelligenz]].

Einige Wochen später versucht Janeway mit den Kazon eine Allianz zu bilden. Als erstes versucht sie es über die Nistrim. Seska kann Culluh überzeugen, an der Verhandlung mit Janeway teilzunehmen. An Bord der ''Voyager'' macht Janeway ihre Vorschläge für die Allianz zwischen den Nistrim und der ''Voyager''. Anfangs laufen die Verhandlungen erfolgreich, aber dann übertreibt es Culluh mit seinen Bedingungen und Vorschlägen. Seska versucht seine schwachsinnigen Ideen zu beschlichtigenbeschwichtigen, aber er geht nicht darauf ein. Culluh weißt Seska zurück. Aber auch für Janeway gehen die Foderungen von Culluh zu weit, sie beendet das Treffen.

Seska ist wütent wütend über Culluh und gibt ihm die Schuld, die einmalige Chanche die ''Voyager'' zu erobern, vertan zu haben. Als die ''Voyager'' ein Bündnis mit den [[Trabe]], den Todfeinden der Kazon eingeht, macht sie Culluh dafür verantwortlich. Um Stabilität in den Quadranten zu bringen plant Janeway eine [[Konferenz]] auf [[Sobras]], wo ein Friedensabkommen zwischen den Trabe, den Kazon und der ''Voyager'' ausgehandelt werden soll. Seska überzeugt Culluh auch an der Konferenz teilzunehmen um Information zu sammeln und Bündnisse zu schmieden, damit sie so die ''Voyager'' erobern zu können. Aber Seska hat noch ein weiteres Ass im Ärmel, ein [[Liste der Crew der USS Voyager|Crewmitglied]] der ''Voyager'', [[Michael Jonas]] schickt heimlich Informationen an sie. ({{VOY|Allianzen}})

Sie weiß aber nicht, dass Paris eigentlich zu Janeways Plan gehört, den wahren [[Spion]] auf der ''Voyager'' zu finden. Er sammelt Informationen über den Verräter und entdeckt auch Seskas Falle. Seska hat mir ihrem Instinkt, Paris nicht zu trauen, Recht behalten. Sie entdeckt Paris, wie dieser heimlich Daten sammelt. Als sich ihr Wachen um ihn kümmern wollen, zündet Paris einen [[Sprengstoff|Sprengsatz]]. Obwohl Seska ihn verfolgen lässt, kann Paris mit einem Kazonshuttle entkommen. Paris kann Janeway rechtzeitg rechtzeitig vor Jonas und Seskas Falle warnen, die ''Voyager'' fliegt nicht nach Hemikek IV und Seskas Plan scheitert. ({{VOY|Der Verräter}})

Kurz darauf wird die ''Voyager'' von der Nistrimflotte angegriffen. Mehrere [[Kazon-Trägerschiff]]e greifen die ''Voyager'' an. In der Zwischenzeit sprengt sich Tierna mit einem Sprengsatz, der in seinen Köper Körper implantiert wurde, in die Luft. Die Explosion beschädigt viele Systeme der ''Voyager'' und das Schiff wird kampfunfähig. Die Kazon können die ''Voyager'' schwer beschädigen und sie beginnen das Schiff zu entern. Als Janeway die [[Selbstzerstörung]] aktivieren will, funktioniert diese nicht, weil die sekundären Kommandoprozessoren beschädigt wurden.

Das Spiel wird sehr schnell beliebt an Bord, es stellt sich heraus, dass Tuvok der Autor des Programmes Programms ist. Als Tom Paris das Programm durchspielt, hat der Maquis bereits das Schiff im Spiel vollständig übernommen. Seska zeigt auch im Programm ihren Hass gegen Janeway. Plötzlich endet das Programm, da Tuvok es nie fertig geschrieben hat. Kurz darauf will zunächst Paris und schliesslich schließlich auch Tuvok das Programm fertig schreiben.

{{Dialogzitat|Seska (bevor sie zu den Kazon überläuft)|Ich tat es für Sie. Ich tat es für die ganze Crew. Wir sind hier draußen ganz allein der Barmherzigkeit unzähliger feindlicher Lebewesen ausgeliefert. Und zwar aufgrund einer nicht nachvollziehbaren Entscheidung eines Captains der Föderation. Eines Captains der unsere einzige Chance, nach Hause zu kommen, zerstört hat. Gesetze der Föderation, Ehrenhaftigkeit der Föderation, Mitgefühl der Föderation. Wenn dieses Schiff ein Cardassianisches wäre, wären wir längst zu Hause. Um zu Überleben müssen wir Verbündete gewinnen in der Zukunft benötigen wir mächtige Freunde. Die Kazon-Nistrim waren bereit uns zu beschützen im Tausch gegen eine unbedeutende Technologie.|Janeway|Eine unbedeutende Technologie, die das Gleichgewichte der Kräfte in diesen Quadranten verändert hätte.|Seska|Ja und zwar zu unseren Gunsten, dass allein ist für uns wichtig. Wir müssen eine Machtposition in diesen Quadranten aufbauen. Sie sind eine Närrin Captain. Und sie…|Seska (zu Chakotay)|…sind ein Narr weil sie sich ihr untwerfenunterwerfen. Es ist mir unverständlich wie ich Sie je lieben konnte.}} ({{VOY|Der Verrat}})