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Nachdem die Kazon-Nistrim die ''Voyager'' angreifen, und ein [[Transporter|Transportermodul]] des Schiffes stehlen, fragt er Captain Janeway, ob es klug ist die Nistrim zu verfolgen. Ihr Argument, dass dieses Modul das Gleichgewicht der Kräfte in dieser Region verändert und die anderen Kazon-Sekten dazu bringen wird, auch die Transportertechnologie erlangen zu wollen, überzeugt ihn jedoch. Commander Chakotay versucht im Alleingang, dass Modul zu zerstören wird dabei jedoch gefangen genommen. Daraufhin startet die ''Voyager'' eine Rettungsaktion. Nachdem die ''Voyager'' das Nistrim-Schiff erreicht, ist er überrascht eine Kazon-Flotte vorzufinden, deren Schiffe von verschiedenen Sekten stammen. Er meint, dass die Kazon ihre Taktik geändert haben. ({{VOY|Das Signal}})
Wenig später gehört er zu einem Außenteam, dass auf einem Planeten, der vom [[Mokra-Orden]] kontrolliert wird, dringend benötigtes [[Tellerium]] erwerben soll. Ihm gelingt es mit dem Tellerium auf die ''Voyager'' zurückzukehren. Jedoch werden Tuvok und Torres verhaftet. Nachdem Chakotay den [[Magistrat]] [[Augris]] kontaktiert hat, teilt er ihm mit, dass er nicht glaubt, dass Augris ihnen helfen wird. Später berät er sich mit Chakotay, Kim und Paris, wie man das Außenteam aus dem Gefängnis der Mokra befreien kann. ({{VOY|Die Resistance}})
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