Ende des Jahres nimmt Eddington an der [[Feier]] zur [[Beförderung]] von [[Captain]] Sisko teil. Als es zu einem angeblichen [[Putsch]] auf der [[Tzenkethi]]-[[Heimatwelt]] kommt, fliegt die ''Defiant'' in diesen [[Sektor]], um die [[Kolonie]]n der Föderation vor einen möglichen Angriff der Tzenkethi zu schützen. Eddington nimmt an dieser [[Mission]] an Bord der ''Defiant'' teil und bekommt den Auftrag, [[Botschafter]] [[Krajensky]] zu schützen. Einige Zeit später sieht es so aus, als haben hätten die Tzenkethi eine Kolonie der Föderation angegriffen und ein [[Krieg]] droht. Zur selben Zeit kommt es zu Systemausfällen an Bord der ''Defiant'' und Sisko vermutet einen Saboteur an Bord des Schiffes. Eddington bietet sofort an, zusammen mit Odo nach dem Saboteur zu suchen. Doch Sisko und [[Jadzia Dax]] finden einen anderen Weg, den Saboteur zu enttarnen, und es stellt sich heraus, dass Krajensky in Wirklichkeit ein Gründer ist. Der Gründer versucht einen Krieg zwischen der Föderation und den Tzenkethi auszulösen, damit das Dominion es so leichter hat, den Alpha-Quadranten zu erobern. Eddington und seine Sicherheitsleute versuchen den flüchtigen Gründer zu finden. Während der Suche nach dem flüchtigen [[Krajensky (Gründer)|Wechselbalg]] bilden Eddington und Odo ein Team, um diesen schnell aufzuspüren. Doch inzwischen gelingt es dem Wechselbalg, [[Doktor]] [[Julian Bashir]] in ein Quartier zu sperren, und er sabotiert in dessen Gestalt einen [[Bluttest]] von Eddington und lässt es so aussehen, als sei Eddington der Gründer. Doch als der echte Bashir gefunden wird, flieht der Gründer wieder und Eddington wird wieder freigelassen. Am Ende gelingt es Odo den Gründer aufzuhalten, indem er ihn tötet. [[Chief]] [[Miles O'Brien]] gelingt es daraufhin, die Sabotage des Gründers zu beseitigen und die ''Defiant'' kehrt in den [[Föderationsraum]] zurück. Dadurch bleibt der Frieden zwischen der Föderation und den Tzenkethi erhalten. ({{DS9|Der Widersacher}})

[[2372]] wollen einige [[Wissenschaftler]] vom [[Wissenschaftsministerium der Trill]] ein künstliches [[Wurmloch]] erzeugen und die Sternenflotte stellt dafür die ''Defiant'' zur Verfügung. Die ersten Tests verlaufen erfolgreich und Eddington überwacht diese Mission vom [[Maschinenraum]] aus. Beim zweiten Testlauf kommt es zu einem [[Unfall]] und das künstliche Wurmloch kollabiert und durch die [[Druckwelle]] wird die ''Defiant'' schwer beschädigt. Im Maschinenraum bricht ein [[Plasmafeuer]] aus und dadurch wird Eddington [[Verletzung|verletzt]]. Die Wissenschaftlerin [[Lenara Kahn]] wird von dem Feuer eingeschlossen und Eddington weiß noch nicht einmal, ob sie noch am Leben ist. Da das [[Feuer]] den [[Warpkern]] bedroht, will Eddington eine Luke öffnen, damit das Feuer in den [[Weltraum]] entweichen kann, doch dies würde Kahn töten. [[Jadzia Dax]] beschließt über ein [[Kraftfeld]] zu Kahn zu gelangen und Eddington versucht das Kraftfeld so lange wie möglich stabil zu halten. Das Kraftfeld bricht kurz darauf zusammen, doch Dax kann Kahn gerade so noch in Sicherheit bringen, während es Eddington gelingt das Feuer zu löschen. ({{DS9|Wiedervereinigt}})

Wenige Wochen später kehren die Führungsoffiziere von einer [[Konferenz]] zurück, allerdings wird ihr [[Runabout]] [[USS Orinoco|USS ''Orinoco'']] von einer cardassianischen Gruppe, welche sich [[Der wahre Weg]] nennt, sabotiert. Wenig später explodiert das Runabout, allerdings gelingt es Sisko, Kira, [[Worf]], Dax und O'Brien sich von Bord zu beamen. Durch die Explosion werden die Muster der Offiziere in den [[Computer]] der Station integriert und im [[Musterpuffer]] der Station gespeichert. Da sich dort die Muster schnell zersetzen, werden die Musterdaten, auf Befehl von Eddington, im Computer der Station integriert und so gelangen die Daten auch in Bashirs [[Holoprogramm|Holosuiteprogramm]]. Eddington informiert Bashir darauf daraufhin über die aktuelle Lage und dass er das Programm weiter laufen lassen muss, damit die Muster der Personen nicht verloren gehen. Bashir ist nun gezwungen, das Programm durchzuspielen, um seine Freunde zu retten. Inzwischen versuchen Eddington und Odo einen Weg zu finden, die Muster der Offiziere aus der Holosuite zu bekommen. Odo und Eddington versuchen mit der Hilfe von [[Rom]] die Muster aus dem Holosuiteprogramm zu bekommen. Rom gelingt es den Transporter der ''Defiant'' mit der Holosuite zu verbinden und die Muster werden schließlich von Odo und Eddington heraus gebeamt. ({{DS9|Unser Mann Bashir}})