Während seiner Zeit bei der Sternenflotte wird Eddington Mitglied einer Widerstandszelle des [[Maquis]] in der [[Entmilitarisierte Zone|Demilitarisierten Zone]], wobei er zunächst seine Position als Sternenflottenoffizier ausnutzt und auf der Raumstation bleibt. Eddington nutzt seine Position als Sicherheitschef aus, um den Maquis mit Informationen zu versorgen. Zu der Zeit beliefert die Föderation zwölf [[Industriereplikator]]en an die [[Cardassianer]] und der [[Konvoi]] passiert auch Deep Space 9. Zu dieser Zeit verdächtigen Odo und Eddington [[Kasidy Yates]], die Freundin von Sisko, dass diese für den Maquis arbeitet. Sisko bittet die beiden, dass diese ein Auge auf Yates halten, um zu sehen ob sich dieser Verdacht bestätigt. Die ''Defiant'' folgt unter dem Kommando von Worf die [[Xhosa|''Xhosa'']] in die [[Badlands]] und dort trifft sich Yates mit einem Maquis-Schiff. Nach diesen Ereignissen schlagen Odo und Eddington vor Sisko vor Yates verhaften zu lassen. Eddington schlägt vor sich persönlich um die Überwachung der Replikatoren zu kümmern, während Sisko persönlich mit der ''Defiant'' in die Badlands fliegt. Sisko überwacht die Xhosa, aber diesmal erscheint kein Maquis-Schiff. Die ''Defiant'' wartet fünf Stunden und schließlich entarnt sich diese und Sisko stellt Yates zur Rede. Sisko und Odo verhaften darauf Yates, da diese Güter für den Maquis geliefert hat und Yates erklärt Sisko, dass sie den Auftrag hat in den Badlands warten sollte. Zur selben Zeit stiehlt Eddington die Industriereplikatoren und setzt dabei Kira außer Gefecht. Eddington übergibt die Replikatoren dem Maquis und taucht unter. Sisko und Odo tun alles um diesen zu finden, doch diese sind dabei erfolglos. Eddington sendet Sisko eine Botschaft, in der er seine Motive erklärt. Doch Sisko setzt nun alles daran den Verräter auf zu spühren und zu verhaften. ({{DS9|In eigener Sache}})

Im Innerhalb von acht Monaten steigt Eddington zum Führer einer Maquiszelle auf. Sisko versucht in diesen Monaten Den Verräter Eddington auf zu spühren und schließlich findet er diesen auf [[2373Marva IV]]. Beide führen ein Streitgespräch über den Maquis und den Verrat von Eddington. Eddington bedroht Sisko mit einer Waffe, doch er lässt Sisko gehen und beamt auf sein Schiff. Sisko lässt darauf Eddington sofort mit der ''Defiant'' verfolgen. Zusammen mit der [[USS Malinche|folgenden JahrUSS ''Malinche'']] beabsichtigt unter dem Kommando von Captain [[Sanders (Captain)|Sanders]] lässt Sisko Eddingtons Schiff verfolgen. Als die Defiant Eddingtons Schiff aufspührt, aktiviert Eddingtoneinen Kaskadenvirus, welcher den Computerspeicher der ''Defiant'' löscht und nun ist das Schiff kampfunfähig. Eddington meldet sich bei Sisko und erklärt, dass er die ''Defiant'' ziehen lässt, da er sich nicht im Krieg mit der inzwischen Anführer einer Zelle geworden Föderation, sondern mit den Cardassianern befindet. Da die ''Defiant'' nun außer Gefecht gesetzt ist, gegen übergibt die Cardassianer Sternenflotte Sanders den Auftrag Eddington zu fangen. Inzwischen gelingt es Eddington mit Hilfe von [[Biologische Waffe|biologischen Waffen]] zu kämpfen. Er [[Gift|vergiftet]] die [[Atmosphäre]]n der [[cardassianischen Kolonie]]n [[Velos Veloz Prime]] und zu [[Quatal PrimeGift|vergiften]]. Die [[USS Da außer der ''Malinche|USS '' sich kein weiteres Schiff der Sternenflotte im Sektor befindet, nimmt Sisko die schwer beschädigte ''Defiant'' um Eddington aufzuhalten. Inzwischen gelingt es Eddington mit einem Trick die ''Malinche'']] unter außer Gefecht zu setzen. Später vergiftet Eddington auch [[Captain]] [[Sanders (Captain)|SandersQuatal Prime]] und USS die Cardassianer müssen auch diese Kolonie aufgeben. Die ''Defiant'' unter Captain Sisko werden losgeschickterreicht zwar den Planeten und hilft bei der Evakuierung der Cardassianer, um dies zu verhinderndoch Eddington kann wieder entkommen. Da Eddington lässt sich allerdings erst gefangen nehmenimmer wieder entkommen kann, nachdem bleibt Sisko auf der Maquis-Kolonie nur eine Wahl er muss auch zu einem Bösewicht werden. Sikso beginnt nun Maquiskolonien an zu greifen. Mit einem [[Solossos IITrilithium]] einen -Sprengsatz vergiftet Sisko die Atmosphäre von [[TrilithiumSolosos III]]-Sprengsatz zündet. Eddington kann nicht glauben, dass Sisko dazu in der die Bewohner zwingt die Kolonie aufzugeben Lage ist und als Sisko weitere Planeten des Maquis auslöschen will, ergibt sich Eddington. Darauf wird Eddington zurück zur Station gebracht und von Odo in Gewahrsam genommen. ({{DS9|Für die Uniform}}).